More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1016 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1016  cysteine--tRNA ligase  100 
 
 
390 aa  772    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0427365  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2573  Cysteine--tRNA ligase  59.72 
 
 
392 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00340458  hitchhiker  0.000587086 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1446  cysteine--tRNA ligase  55.92 
 
 
373 aa  370  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2219  Cysteine--tRNA ligase  57.11 
 
 
391 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0471843  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0549  Cysteine--tRNA ligase  53.33 
 
 
372 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22970  cysteinyl-tRNA synthetase  53.02 
 
 
382 aa  344  2e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.299926  normal  0.292075 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0653  cysteine--tRNA ligase  51.92 
 
 
371 aa  322  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1206  cysteinyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 
392 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1230  Cysteine--tRNA ligase  42.98 
 
 
372 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2860  cysteinyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 
400 aa  243  5e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000103148  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3331  cysteinyl-tRNA synthetase  39 
 
 
401 aa  234  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.552746  normal  0.24215 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  36.74 
 
 
481 aa  232  9e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4315  cysteinyl-tRNA synthetase  38.35 
 
 
401 aa  229  5e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.754463  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4263  cysteinyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 
396 aa  225  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5930  Cysteine--tRNA ligase  39.52 
 
 
407 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.499354  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0429  cysteinyl-tRNA synthetase  36.88 
 
 
455 aa  224  3e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  37.29 
 
 
465 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 
481 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1932  cysteine/1-D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside ligase  40.06 
 
 
403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.11867  normal  0.637063 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  36.68 
 
 
480 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  37.29 
 
 
494 aa  220  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  36.68 
 
 
480 aa  220  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3478  cysteinyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 
429 aa  219  6e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.601837 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  37.54 
 
 
487 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3049  cysteinyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 
444 aa  218  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0153969  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 
485 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 
460 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 
479 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  37.38 
 
 
486 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_002936  DET0061  cysteinyl-tRNA synthetase  33.52 
 
 
458 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0458  cysteinyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 
484 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0471  cysteinyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 
484 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361627  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1662  cysteinyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 
478 aa  213  5.999999999999999e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.69895  normal  0.620733 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41360  cysteinyl-tRNA synthetase  36.81 
 
 
460 aa  212  7e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.490011 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1172  cysteinyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 
403 aa  213  7e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1109  cysteinyl-tRNA synthetase  31.17 
 
 
488 aa  212  7.999999999999999e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.98105  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1832  cysteinyl-tRNA synthetase  39.77 
 
 
412 aa  211  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  34.67 
 
 
487 aa  212  1e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23530  cysteinyl-tRNA synthetase  34.27 
 
 
461 aa  211  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  36.96 
 
 
466 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2628  cysteinyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 
397 aa  211  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0825  cysteinyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 
500 aa  210  3e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_61  cysteinyl-tRNA synthetase  33.52 
 
 
457 aa  209  5e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2287  cysteine/1-D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside ligase  39.19 
 
 
414 aa  209  5e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000304997  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0055  cysteinyl-tRNA synthetase  33.9 
 
 
457 aa  209  6e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  34.49 
 
 
456 aa  209  7e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15891  cysteinyl-tRNA synthetase  34.54 
 
 
500 aa  209  7e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.854558  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19450  cysteinyl-tRNA synthetase  38.03 
 
 
498 aa  209  8e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000839474 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1544  cysteine/1-D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy-alpha-D-glucopyranoside ligase  39.71 
 
 
407 aa  208  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.965113 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4892  cysteinyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 
444 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00699487  normal  0.0480407 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0749  cysteinyl-tRNA synthetase  34.54 
 
 
500 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11479  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  34.66 
 
 
493 aa  207  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12161  cysteinyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 
414 aa  207  3e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.376997 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  36.59 
 
 
493 aa  207  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  36 
 
 
466 aa  207  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  34.39 
 
 
456 aa  206  5e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  36 
 
 
468 aa  206  6e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 
485 aa  206  6e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2642  cysteinyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 
464 aa  206  6e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.736924  normal  0.302095 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 
485 aa  206  6e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22240  cysteinyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 
415 aa  206  8e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0725298  normal  0.435165 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  33.62 
 
 
460 aa  205  9e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4002  cysteinyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 
489 aa  205  9e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.993734 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0419  cysteinyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 
453 aa  205  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0310723 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12151  cysteinyl-tRNA synthetase  35.67 
 
 
516 aa  205  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.532713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0711  cysteinyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 
465 aa  205  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848323  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2168  cysteinyl-tRNA synthetase  38.44 
 
 
404 aa  205  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.258931  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  34.37 
 
 
485 aa  204  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4502  cysteine/1-D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside ligase  39.88 
 
 
431 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00204978 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  34.01 
 
 
460 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0689  cysteinyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 
459 aa  204  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0435653  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2201  cysteine/1-D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside ligase  38.54 
 
 
412 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0760868  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  34.8 
 
 
460 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  35.53 
 
 
461 aa  203  4e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 
485 aa  203  5e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  36.72 
 
 
461 aa  202  6e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2442  cysteine/1-D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside ligase  43.4 
 
 
413 aa  202  8e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
460 aa  202  9e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  34.29 
 
 
460 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00355  cysteinyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 
474 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.229746  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3165  cysteinyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 
415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3153  cysteinyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 
415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0176981  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3215  cysteinyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 
415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13190  cysteinyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 
499 aa  201  3e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.633789  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2233  cysteinyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 
501 aa  200  3e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.056881  normal  0.890291 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3718  cysteinyl-tRNA synthetase  34.71 
 
 
486 aa  201  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1903  cysteinyl-tRNA synthetase  35.21 
 
 
459 aa  200  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08671  cysteinyl-tRNA synthetase  37.18 
 
 
511 aa  200  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0149  cysteinyl-tRNA synthetase  32.26 
 
 
457 aa  200  3.9999999999999996e-50  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2140  cysteine/1-D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside ligase  39.94 
 
 
414 aa  200  3.9999999999999996e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3638  cysteinyl-tRNA synthetase  34.63 
 
 
460 aa  199  5e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.1842 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2732  cysteinyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 
474 aa  199  5e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.511576  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  31.25 
 
 
466 aa  199  5e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13301  cysteinyl-tRNA synthetase  30.6 
 
 
489 aa  199  6e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1829  cysteinyl-tRNA synthetase  34.21 
 
 
453 aa  199  7e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2780  cysteine/1-D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside ligase  43.27 
 
 
405 aa  199  9e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474656  hitchhiker  0.000282521 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1181  cysteinyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 
493 aa  199  9e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00250228  hitchhiker  0.0000333718 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 
474 aa  199  9e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37953  predicted protein  35.37 
 
 
497 aa  199  9e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150647  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5399  cysteinyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 
427 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139344  normal  0.289642 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>