More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0549 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0549  Cysteine--tRNA ligase  100 
 
 
372 aa  749    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1446  cysteine--tRNA ligase  61.25 
 
 
373 aa  428  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2219  Cysteine--tRNA ligase  60.33 
 
 
391 aa  402  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0471843  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2573  Cysteine--tRNA ligase  56.84 
 
 
392 aa  395  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00340458  hitchhiker  0.000587086 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22970  cysteinyl-tRNA synthetase  56.18 
 
 
382 aa  390  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.299926  normal  0.292075 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0653  cysteine--tRNA ligase  53.39 
 
 
371 aa  367  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1016  cysteine--tRNA ligase  53.33 
 
 
390 aa  345  5e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0427365  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1230  Cysteine--tRNA ligase  47.46 
 
 
372 aa  298  1e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4315  cysteinyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 
401 aa  290  3e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.754463  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3331  cysteinyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 
401 aa  286  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.552746  normal  0.24215 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1206  cysteinyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 
392 aa  270  4e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2860  cysteinyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 
400 aa  263  4e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000103148  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4263  cysteinyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 
396 aa  255  7e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146865  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  42.9 
 
 
459 aa  255  7e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 
485 aa  252  6e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 
466 aa  252  8.000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 
466 aa  250  2e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0117  cysteinyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 
447 aa  248  1e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3478  cysteinyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 
429 aa  248  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.601837 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 
481 aa  248  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3049  cysteinyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 
444 aa  248  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0153969  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0429  cysteinyl-tRNA synthetase  36.93 
 
 
455 aa  247  3e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 
456 aa  246  6.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 
456 aa  245  8e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 
460 aa  245  8e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 
480 aa  245  9e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 
465 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  39.64 
 
 
460 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 
485 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41360  cysteinyl-tRNA synthetase  37.9 
 
 
460 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.490011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5930  Cysteine--tRNA ligase  40.71 
 
 
407 aa  243  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.499354  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 
460 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 
494 aa  241  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0980  cysteinyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 
465 aa  241  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2642  cysteinyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 
464 aa  240  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.736924  normal  0.302095 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1932  cysteine/1-D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside ligase  42.6 
 
 
403 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.11867  normal  0.637063 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00355  cysteinyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 
474 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.229746  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0590  cysteinyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 
461 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00144184  normal  0.0627987 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0645  cysteinyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 
461 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108038  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0583  cysteinyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 
461 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000237473  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0585  cysteinyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 
461 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0307581  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0582  cysteinyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 
461 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.193345 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0207  cysteinyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 
447 aa  239  4e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1832  cysteinyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 
412 aa  239  4e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0711  cysteinyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 
465 aa  239  4e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848323  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23530  cysteinyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 
461 aa  239  4e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0061  cysteinyl-tRNA synthetase  35.91 
 
 
458 aa  239  8e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0055  cysteinyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 
457 aa  239  8e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_61  cysteinyl-tRNA synthetase  36.74 
 
 
457 aa  238  1e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3165  cysteinyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 
415 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3638  cysteinyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 
460 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.1842 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3153  cysteinyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 
415 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0176981  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3215  cysteinyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 
415 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 
480 aa  237  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2732  cysteinyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 
474 aa  237  3e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.511576  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  39.54 
 
 
474 aa  237  3e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 
487 aa  236  4e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01977  cysteinyl-tRNA synthetase  37.43 
 
 
460 aa  236  5.0000000000000005e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4892  cysteinyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 
444 aa  236  6e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00699487  normal  0.0480407 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12161  cysteinyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 
414 aa  235  7e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.376997 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 
493 aa  236  7e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 
463 aa  235  8e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1248  cysteinyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 
461 aa  235  9e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000407868  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0571  cysteinyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 
461 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000388833  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2668  cysteine/1-D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside ligase  41.53 
 
 
422 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.335738  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 
461 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
468 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1172  cysteinyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 
403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2507  cysteinyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 
461 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00476  cysteinyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 
461 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0063567  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3087  cysteinyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 
461 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869328  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0627  cysteinyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 
461 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.589324 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  38.39 
 
 
461 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00481  hypothetical protein  39.31 
 
 
461 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114278  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0601  cysteinyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 
461 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000694006  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0689  cysteinyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
459 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0435653  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3096  cysteinyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 
461 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0232678  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 
461 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 
459 aa  233  5e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 
485 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0448  cysteinyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 
461 aa  232  8.000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000245002  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  40.58 
 
 
466 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 
458 aa  232  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0508946  normal  0.0729596 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 
466 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2731  cysteinyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 
458 aa  231  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1544  cysteine/1-D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy-alpha-D-glucopyranoside ligase  43.98 
 
 
407 aa  231  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.965113 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  37.1 
 
 
481 aa  231  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2660  cysteinyl-tRNA synthetase  38.44 
 
 
461 aa  230  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0958679  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37953  predicted protein  37.12 
 
 
497 aa  231  2e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150647  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1109  cysteinyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 
488 aa  230  3e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.98105  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 
479 aa  230  3e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 
487 aa  230  3e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 
465 aa  229  4e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2442  cysteine/1-D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside ligase  42.42 
 
 
413 aa  229  4e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2140  cysteine/1-D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside ligase  43.53 
 
 
414 aa  229  5e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2287  cysteine/1-D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside ligase  42.99 
 
 
414 aa  229  5e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000304997  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1273  cysteinyl-tRNA synthetase  39.89 
 
 
481 aa  229  7e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  39.3 
 
 
461 aa  228  9e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1902  cysteinyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 
454 aa  228  1e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.478316  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5399  cysteinyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 
427 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139344  normal  0.289642 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>