More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0915 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0915  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  100 
 
 
335 aa  659    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0457  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  51.55 
 
 
373 aa  305  8.000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7663  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  49.69 
 
 
339 aa  296  5e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2934  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstC  46.95 
 
 
326 aa  236  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4379  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.08 
 
 
320 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0353  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.02 
 
 
383 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0142166 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4980  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40 
 
 
369 aa  229  6e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0592  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.93 
 
 
328 aa  229  6e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8332  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.05 
 
 
325 aa  219  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328047  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2741  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  42.46 
 
 
320 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0392833  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06950  phosphate ABC transporter membrane protein  40.57 
 
 
326 aa  213  3.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0092  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.23 
 
 
332 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.902581  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4264  phosphate ABC transporter permease  42.23 
 
 
347 aa  210  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2829  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.56 
 
 
322 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.594709  normal  0.637207 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3294  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.56 
 
 
322 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31860  phosphate ABC transporter membrane protein  40.91 
 
 
327 aa  204  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4649  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.33 
 
 
318 aa  202  7e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0363  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.69 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0203  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.63 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8262  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.95 
 
 
694 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735974  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25610  phosphate ABC transporter membrane protein  38.97 
 
 
320 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0166325  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4262  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.51 
 
 
312 aa  196  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3538  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.11 
 
 
328 aa  195  9e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.590785  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37630  phosphate ABC transporter membrane protein  39.21 
 
 
314 aa  195  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.158089 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2216  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstC  38.77 
 
 
324 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100122  normal  0.140551 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0874  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.12 
 
 
328 aa  193  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.524714  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01620  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  36.34 
 
 
319 aa  192  5e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6820  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.37 
 
 
352 aa  192  9e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1071  phosphate ABC transporter permease  38.85 
 
 
317 aa  190  2e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2805  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.26 
 
 
319 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578144 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2081  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.64 
 
 
353 aa  187  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.601728  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3425  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.58 
 
 
325 aa  186  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00542  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  36.51 
 
 
324 aa  185  7e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0417223  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1091  phosphate ABC transporter permease  35.14 
 
 
329 aa  185  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0222  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  36.69 
 
 
334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1154  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.44 
 
 
341 aa  183  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3925  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.36 
 
 
344 aa  183  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0659  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.58 
 
 
336 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.825746  hitchhiker  0.000295634 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2967  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.4 
 
 
330 aa  183  4.0000000000000006e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1437  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  39.44 
 
 
325 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177965  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1283  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.01 
 
 
324 aa  182  7e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1347  ABC transporter phosphate permease  36.01 
 
 
324 aa  182  7e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.225213  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3542  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.13 
 
 
348 aa  182  8.000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1137  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  35.03 
 
 
325 aa  182  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0819  phosphate ABC transporter permease  36.42 
 
 
315 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08661  putative phosphate ABC transporter  33.33 
 
 
315 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1292  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.42 
 
 
338 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0582  phosphate ABC transporter permease  34.17 
 
 
343 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0697516  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0727  phosphate ABC transporter permease  33 
 
 
315 aa  179  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.127565  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07751  putative phosphate ABC transporter  33 
 
 
315 aa  179  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07751  putative phosphate ABC transporter  33 
 
 
315 aa  179  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.588684  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1397  phosphate ABC transporter permease  35.31 
 
 
315 aa  179  7e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.684943  normal  0.553355 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1310  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.84 
 
 
322 aa  179  7e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.648336  normal  0.22532 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1530  phosphate transporter permease subunit PstC  34.95 
 
 
321 aa  178  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22156  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10947  phosphate-transport system integral membrane ABC transporter pstC2  37.22 
 
 
324 aa  178  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1796  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.29 
 
 
325 aa  178  1e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00856556  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0650  phosphate ABC transporter permease  34.17 
 
 
337 aa  176  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0147  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4081  phosphate transporter permease subunit PstC  33.23 
 
 
319 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4137  phosphate transporter permease subunit PstC  33.23 
 
 
319 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.293082  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4244  phosphate transporter permease subunit PstC  33.23 
 
 
319 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.812613  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4187  phosphate transporter permease subunit PstC  33.23 
 
 
319 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4065  phosphate transporter permease subunit PstC  33.23 
 
 
319 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.132116  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15191  putative phosphate ABC transporter  33.66 
 
 
307 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.48693 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0777  phosphate ABC transporter permease  38.51 
 
 
332 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2503  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32.93 
 
 
336 aa  176  6e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2356  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.23 
 
 
315 aa  175  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1517  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.83 
 
 
324 aa  175  8e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2559  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.83 
 
 
324 aa  175  8e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00389867  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2312  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.86 
 
 
359 aa  175  9e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.310759  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4444  phosphate transporter permease subunit PstC  33.63 
 
 
328 aa  175  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2478  phosphate ABC transporter permease  35.14 
 
 
316 aa  175  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1720  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  31.87 
 
 
336 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000175747  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1851  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.44 
 
 
334 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1662  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.49 
 
 
322 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.334683  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03611  phosphate transporter subunit  33.23 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4240  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.23 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4201  phosphate transporter permease subunit PstC  33.23 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4091  phosphate transporter permease subunit PstC  33.23 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.541621 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3942  phosphate transporter permease subunit PstC  33.23 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4238  phosphate transporter permease subunit PstC  33.23 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5156  phosphate transporter permease subunit PstC  33.23 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.558018 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03555  hypothetical protein  33.23 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4267  phosphate transporter permease subunit PstC  33.23 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.879292  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1272  phosphate transporter permease subunit PstC  33.33 
 
 
328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4901  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.07 
 
 
349 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0820  phosphate transporter permease subunit PstC  33.33 
 
 
328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1301  phosphate transporter permease subunit PstC  33.33 
 
 
328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.446821  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2963  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.49 
 
 
331 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4518  phosphate ABC transporter permease  40.07 
 
 
349 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4605  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.07 
 
 
349 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2184  phosphate transporter permease subunit PstC  34.69 
 
 
321 aa  173  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.184456  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4170  phosphate transporter permease subunit PstC  32.08 
 
 
318 aa  172  9e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4196  phosphate transporter permease subunit PstC  32.08 
 
 
318 aa  172  9e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.319484  normal  0.0245807 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2025  phosphate transporter permease subunit PstC  35.11 
 
 
324 aa  172  9e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.619161  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4232  phosphate transporter permease subunit PstC  32.08 
 
 
318 aa  172  9e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.691548  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2166  phosphate transporter permease subunit PstC  34.5 
 
 
321 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450116  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0883  phosphate transporter permease subunit PstC  32.23 
 
 
332 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0013  phosphate transporter permease subunit PstC  35.23 
 
 
318 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468415  normal  0.0760881 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2220  phosphate ABC transporter permease  34.6 
 
 
316 aa  171  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.253336  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2832  phosphate ABC transporter permease protein  33.54 
 
 
324 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111498  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>