82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1485 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1485  NnrS-like protein  100 
 
 		 356 aa  682    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0230809  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1934  NnrS family protein  41.79 
 
 		 388 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00282797  normal  0.473648 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3136  NnrS family protein  36.02 
 
 		 375 aa  119  9e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1410  NnrS-like protein  30.35 
 
 		 399 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.124987  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3970  NnrS family protein  30.84 
 
 		 398 aa  93.6  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03874  Heme/copper membrane protein  28.26 
 
 		 400 aa  87  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3582  NnrS family protein  30.47 
 
 		 391 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.936992  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03317  hypothetical protein  28.77 
 
 		 406 aa  82.8  0.000000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0630  Heme/copper membrane protein of NnrS family protein  25.31 
 
 		 394 aa  80.1  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002671  NnrS protein  29.71 
 
 		 394 aa  79  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1409  hypothetical protein  27.64 
 
 		 424 aa  78.2  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.922088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0504  NnrS family protein  27.57 
 
 		 403 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2876  NnrS family protein  27.17 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534905  hitchhiker  0.00000000207371 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2607  NnrS family protein  29.51 
 
 		 395 aa  77  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2322  NnrS family protein  28.75 
 
 		 390 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000140024  normal  0.965133 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3037  NnrS family protein  25.95 
 
 		 403 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.226927  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1475  NnrS family protein  30.42 
 
 		 399 aa  75.5  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0760953 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2362  NnrS family protein  28.85 
 
 		 403 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000703097  decreased coverage  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0720  putative heme-Cu membrane protein (NnrS)  25.14 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4727  NnrS  31.91 
 
 		 398 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0557  NnrS  28.73 
 
 		 402 aa  72.8  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.042435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2849  NnrS family protein  30.81 
 
 		 393 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0687  NnrS family protein  24.86 
 
 		 403 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4283  hypothetical protein  24.72 
 
 		 401 aa  72  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2805  hypothetical protein  27.59 
 
 		 390 aa  72  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2587  NnrS family protein  28.49 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16699  normal  0.0601628 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2336  NnrS family protein  28.24 
 
 		 401 aa  70.5  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00114269  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2847  NnrS family protein  28.24 
 
 		 401 aa  70.9  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0283  hypothetical protein  28.29 
 
 		 413 aa  70.1  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0227  NnrS family protein  32.18 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3473  NnrS  27.3 
 
 		 422 aa  69.3  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2840  NnrS family protein  29.61 
 
 		 393 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0259  hypothetical protein  28 
 
 		 413 aa  68.6  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1006  NnrS family protein  29.57 
 
 		 389 aa  67  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0347076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1910  hypothetical protein  28.32 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1227  NnrS family protein  25.14 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25611  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0102  hypothetical protein  26.04 
 
 		 418 aa  64.7  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.139814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3145  NnrS family protein  26.56 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0163982  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0648  NnrS  27.42 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86713  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1665  NnrS family protein  28.74 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0410131  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4289  NnrS  25.45 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1680  NnrS family protein  29.43 
 
 		 390 aa  62.8  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2677  NnrS family protein  28.15 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0244063 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0307  NnrS family protein  27.36 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.799454  normal  0.0277833 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2181  NnrS  25.56 
 
 		 385 aa  61.6  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2560  NnrS family protein  26.99 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12013  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2425  NnrS family protein  28 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.194019  normal  0.204544 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2495  NnrS family protein  28 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal  0.0503888 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1702  NnrS family protein  26.25 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.591488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6279  NnrS family protein  25.27 
 
 		 403 aa  59.7  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  0.20499 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2901  NnrS family protein  24.79 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.81186  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2940  NnrS family protein  28.4 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0918  NnrS  36.11 
 
 		 229 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.948629  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3791  NnrS  28.13 
 
 		 409 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.527545  normal  0.280069 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1288  hypothetical protein  25.07 
 
 		 389 aa  56.2  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0467877  normal  0.017488 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4999  NnrS  27.22 
 
 		 405 aa  56.2  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.441301  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1810  hypothetical protein  28.3 
 
 		 407 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.427105  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3603  NnrS family protein  27.76 
 
 		 403 aa  55.1  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.147714  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0765  NnrS family protein  23.56 
 
 		 409 aa  54.7  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.960663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4037  NnrS  28.13 
 
 		 408 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2837  NnrS  26.96 
 
 		 403 aa  53.5  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0722604  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2168  NnrS  28.65 
 
 		 384 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5307  putative heme/copper membrane protein  28.49 
 
 		 401 aa  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0853882  normal  0.0678899 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1348  hypothetical protein  23.56 
 
 		 417 aa  51.2  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1884  NnrS  28.85 
 
 		 401 aa  51.2  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0526931  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0967  NnrS family protein  27.45 
 
 		 397 aa  50.4  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1673  NnrS family protein  25.49 
 
 		 408 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496066  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3859  NnrS family protein  28.62 
 
 		 391 aa  50.1  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0686  NnrS family protein  25.81 
 
 		 431 aa  49.7  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4044  NnrS family protein  29.86 
 
 		 504 aa  49.3  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.704595 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1515  NnrS family protein  28.04 
 
 		 409 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.329363  normal  0.0719715 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6821  putative membrane protein, NnrS-like protein  28.61 
 
 		 403 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1524  NnrS family protein  29.63 
 
 		 394 aa  47.8  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2741  hypothetical protein  28.57 
 
 		 442 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.300362  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2303  hypothetical protein  26.83 
 
 		 432 aa  47  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0630  hypothetical protein  28.57 
 
 		 407 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0446034  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2807  Heme/copper membrane protein  28.57 
 
 		 407 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.817552  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2905  hypothetical protein  28.57 
 
 		 407 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2382  hypothetical protein  28.57 
 
 		 407 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.863987  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2683  hypothetical protein  28.57 
 
 		 407 aa  46.6  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3182  NnrS family protein  26.47 
 
 		 396 aa  44.3  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2159  NnrS family protein  30.58 
 
 		 398 aa  43.9  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0400909  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>