78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3136 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_3136  NnrS family protein  100 
 
 		 375 aa  722    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1934  NnrS family protein  43.38 
 
 		 388 aa  142  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00282797  normal  0.473648 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1485  NnrS-like protein  37.74 
 
 		 356 aa  139  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0230809  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0307  NnrS family protein  28.45 
 
 		 390 aa  94  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.799454  normal  0.0277833 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2303  hypothetical protein  30.4 
 
 		 432 aa  86.7  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002671  NnrS protein  31.88 
 
 		 394 aa  86.7  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0259  hypothetical protein  28 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0283  hypothetical protein  28 
 
 		 413 aa  85.1  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3037  NnrS family protein  28.99 
 
 		 403 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.226927  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03317  hypothetical protein  29.22 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2901  NnrS family protein  27.71 
 
 		 414 aa  78.6  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.81186  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0648  NnrS  31.68 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86713  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0557  NnrS  29.69 
 
 		 402 aa  77  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.042435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2876  NnrS family protein  28.13 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534905  hitchhiker  0.00000000207371 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0918  NnrS  33.74 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.948629  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0687  NnrS family protein  29.25 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1910  hypothetical protein  27.41 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3582  NnrS family protein  32.73 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.936992  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2607  NnrS family protein  28.88 
 
 		 395 aa  69.7  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2805  hypothetical protein  28.53 
 
 		 390 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0227  NnrS family protein  31.22 
 
 		 390 aa  67.4  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2168  NnrS  32.42 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3859  NnrS family protein  27.18 
 
 		 391 aa  66.2  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0504  NnrS family protein  27.46 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1410  NnrS-like protein  29.43 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.124987  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2322  NnrS family protein  28.7 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000140024  normal  0.965133 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03874  Heme/copper membrane protein  25.85 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0720  putative heme-Cu membrane protein (NnrS)  25 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4289  NnrS  25.07 
 
 		 388 aa  62.8  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2849  NnrS family protein  30.09 
 
 		 393 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1673  NnrS family protein  25.69 
 
 		 408 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496066  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0630  Heme/copper membrane protein of NnrS family protein  25.29 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1227  NnrS family protein  28.15 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25611  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3473  NnrS  27.01 
 
 		 422 aa  59.7  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1006  NnrS family protein  28.93 
 
 		 389 aa  59.7  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0347076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6279  NnrS family protein  25.34 
 
 		 403 aa  57  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  0.20499 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4283  hypothetical protein  27.49 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0967  NnrS family protein  29.75 
 
 		 397 aa  56.2  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2940  NnrS family protein  30.2 
 
 		 393 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3182  NnrS family protein  27.17 
 
 		 396 aa  53.9  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1409  hypothetical protein  28.35 
 
 		 424 aa  53.9  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.922088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1515  NnrS family protein  25.71 
 
 		 409 aa  53.9  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.329363  normal  0.0719715 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3603  NnrS family protein  29.09 
 
 		 403 aa  53.1  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.147714  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1665  NnrS family protein  29.46 
 
 		 390 aa  53.1  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0410131  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3791  NnrS  26.25 
 
 		 409 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.527545  normal  0.280069 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1702  NnrS family protein  27.35 
 
 		 390 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.591488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2677  NnrS family protein  29.19 
 
 		 390 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0244063 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1680  NnrS family protein  28.83 
 
 		 390 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0102  hypothetical protein  27.94 
 
 		 418 aa  51.2  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.139814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4230  NnrS family protein  28.57 
 
 		 404 aa  50.8  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2425  NnrS family protein  28.1 
 
 		 390 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.194019  normal  0.204544 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2495  NnrS family protein  28.1 
 
 		 390 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal  0.0503888 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2362  NnrS family protein  27.66 
 
 		 403 aa  50.4  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000703097  decreased coverage  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1884  NnrS  28.72 
 
 		 401 aa  50.1  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0526931  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0849  putative ATP synthase F0, A subunit  28.53 
 
 		 428 aa  50.1  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4037  NnrS  25.15 
 
 		 408 aa  49.7  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2587  NnrS family protein  26.13 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16699  normal  0.0601628 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1288  hypothetical protein  25.54 
 
 		 389 aa  49.3  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0467877  normal  0.017488 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2560  NnrS family protein  25.62 
 
 		 397 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12013  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1475  NnrS family protein  28.24 
 
 		 399 aa  48.1  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0760953 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3145  NnrS family protein  28.41 
 
 		 394 aa  48.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0163982  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2840  NnrS family protein  30.63 
 
 		 393 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250907  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0614  hypothetical protein  26.72 
 
 		 406 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2398  hypothetical protein  26.72 
 
 		 398 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2891  hypothetical protein  26.72 
 
 		 398 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00927369  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1711  hypothetical protein  26.72 
 
 		 398 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.129457  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0765  NnrS family protein  26.81 
 
 		 409 aa  47.4  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.960663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3970  NnrS family protein  28.2 
 
 		 398 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2837  NnrS  27.65 
 
 		 403 aa  45.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0722604  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2105  NnrS family protein  25.8 
 
 		 392 aa  44.3  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0196977  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6821  putative membrane protein, NnrS-like protein  27.43 
 
 		 403 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2322  NnrS family protein  27.64 
 
 		 400 aa  44.3  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000138032  normal  0.897473 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4044  NnrS family protein  27.63 
 
 		 504 aa  43.9  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.704595 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1119  NnrS  32.65 
 
 		 396 aa  43.9  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2821  Heme/copper membrane protein  28.23 
 
 		 398 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2701  heme/copper membrane protein  28.23 
 
 		 398 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2759  hypothetical protein  28.23 
 
 		 398 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4727  NnrS  27.55 
 
 		 398 aa  43.1  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>