92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1934 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1934  NnrS family protein  100 
 
 
388 aa  721    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00282797  normal  0.473648 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3136  NnrS family protein  39.15 
 
 
375 aa  159  8e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1485  NnrS-like protein  41.79 
 
 
356 aa  149  8e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0230809  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2901  NnrS family protein  32 
 
 
414 aa  93.6  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.81186  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0307  NnrS family protein  31.25 
 
 
390 aa  91.7  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.799454  normal  0.0277833 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3970  NnrS family protein  34.42 
 
 
398 aa  91.3  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0283  hypothetical protein  31.02 
 
 
413 aa  84.7  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0259  hypothetical protein  30.66 
 
 
413 aa  82.4  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2607  NnrS family protein  32.64 
 
 
395 aa  82.8  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4727  NnrS  33.33 
 
 
398 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4289  NnrS  28.98 
 
 
388 aa  76.6  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0630  Heme/copper membrane protein of NnrS family protein  29.47 
 
 
394 aa  73.6  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0557  NnrS  34.63 
 
 
402 aa  73.2  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.042435  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4999  NnrS  34.69 
 
 
405 aa  73.2  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.441301  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03874  Heme/copper membrane protein  29.64 
 
 
400 aa  71.6  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0648  NnrS  36 
 
 
393 aa  70.9  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86713  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2849  NnrS family protein  33.09 
 
 
393 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3037  NnrS family protein  28.18 
 
 
403 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.226927  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0687  NnrS family protein  28.12 
 
 
403 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1410  NnrS-like protein  29.31 
 
 
399 aa  69.7  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.124987  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3859  NnrS family protein  34.42 
 
 
391 aa  67.4  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0504  NnrS family protein  31 
 
 
403 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1884  NnrS  36.06 
 
 
401 aa  65.1  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0526931  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002671  NnrS protein  27.67 
 
 
394 aa  65.5  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6279  NnrS family protein  31.94 
 
 
403 aa  63.2  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  0.20499 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0227  NnrS family protein  33.15 
 
 
390 aa  63.2  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2847  NnrS family protein  30.48 
 
 
401 aa  63.2  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2336  NnrS family protein  30.48 
 
 
401 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00114269  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2805  hypothetical protein  28.12 
 
 
390 aa  62.4  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5307  putative heme/copper membrane protein  33.44 
 
 
401 aa  62.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0853882  normal  0.0678899 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2876  NnrS family protein  27.3 
 
 
406 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534905  hitchhiker  0.00000000207371 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1227  NnrS family protein  27.91 
 
 
403 aa  62.4  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25611  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1910  hypothetical protein  28.71 
 
 
414 aa  62  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1006  NnrS family protein  31.21 
 
 
389 aa  59.7  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0347076  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2891  hypothetical protein  31.93 
 
 
398 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00927369  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2840  NnrS family protein  33.62 
 
 
393 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250907  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2398  hypothetical protein  31.93 
 
 
398 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1711  hypothetical protein  31.93 
 
 
398 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.129457  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2181  NnrS  27.61 
 
 
385 aa  58.9  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0614  hypothetical protein  31.93 
 
 
406 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3791  NnrS  28.16 
 
 
409 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.527545  normal  0.280069 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6821  putative membrane protein, NnrS-like protein  29.51 
 
 
403 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2105  NnrS family protein  32.81 
 
 
392 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0196977  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4044  NnrS family protein  31.59 
 
 
504 aa  57.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.704595 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1235  NnrS  29.45 
 
 
403 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00575591  unclonable  0.0000000301222 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1798  hypothetical protein  30.09 
 
 
406 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.425687  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2677  NnrS family protein  30.07 
 
 
390 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0244063 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03317  hypothetical protein  26.37 
 
 
406 aa  57.4  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1810  hypothetical protein  34.62 
 
 
407 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.427105  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1673  NnrS family protein  29.88 
 
 
408 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496066  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0918  NnrS  37.42 
 
 
229 aa  56.6  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.948629  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3582  NnrS family protein  31.37 
 
 
391 aa  57  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.936992  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3399  hypothetical protein  32.73 
 
 
403 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2940  NnrS family protein  32.92 
 
 
393 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1665  NnrS family protein  28.95 
 
 
390 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0410131  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2362  NnrS family protein  29.33 
 
 
403 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000703097  decreased coverage  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1702  NnrS family protein  26.81 
 
 
390 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.591488  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1680  NnrS family protein  26.9 
 
 
390 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2322  NnrS family protein  28.21 
 
 
390 aa  53.5  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000140024  normal  0.965133 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0720  putative heme-Cu membrane protein (NnrS)  27 
 
 
393 aa  53.5  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3145  NnrS family protein  26.49 
 
 
394 aa  53.5  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0163982  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1515  NnrS family protein  29.51 
 
 
409 aa  53.1  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.329363  normal  0.0719715 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3603  NnrS family protein  27.11 
 
 
403 aa  52.8  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.147714  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1119  NnrS  45.71 
 
 
396 aa  53.1  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2759  hypothetical protein  31 
 
 
398 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2303  hypothetical protein  30.69 
 
 
432 aa  52.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1475  NnrS family protein  31.97 
 
 
399 aa  52.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0760953 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2587  NnrS family protein  28.62 
 
 
390 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16699  normal  0.0601628 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2701  heme/copper membrane protein  31.93 
 
 
398 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2741  hypothetical protein  32.84 
 
 
442 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.300362  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2821  Heme/copper membrane protein  43.84 
 
 
398 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0849  putative ATP synthase F0, A subunit  25.93 
 
 
428 aa  50.8  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4037  NnrS  26.95 
 
 
408 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3288  NnrS family protein  31.93 
 
 
404 aa  50.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.451558  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0630  hypothetical protein  32.84 
 
 
407 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0446034  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2807  Heme/copper membrane protein  32.84 
 
 
407 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.817552  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2905  hypothetical protein  32.84 
 
 
407 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2382  hypothetical protein  32.84 
 
 
407 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.863987  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2683  hypothetical protein  32.84 
 
 
407 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3610  NnrS family protein  31.93 
 
 
404 aa  49.7  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.84805  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3182  NnrS family protein  29.73 
 
 
396 aa  48.9  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827588  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4283  hypothetical protein  28 
 
 
401 aa  48.9  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2537  hypothetical protein  35.32 
 
 
388 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2837  NnrS  29.15 
 
 
403 aa  47.8  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0722604  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2168  NnrS  32.4 
 
 
384 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0102  hypothetical protein  27.22 
 
 
418 aa  46.6  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.139814  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2495  NnrS family protein  30.47 
 
 
390 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal  0.0503888 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2425  NnrS family protein  30.47 
 
 
390 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.194019  normal  0.204544 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5672  NnrS family protein  31.13 
 
 
392 aa  43.5  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1409  hypothetical protein  29.39 
 
 
424 aa  43.1  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.922088  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3473  NnrS  25.17 
 
 
422 aa  43.1  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2560  NnrS family protein  28.87 
 
 
397 aa  42.7  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>