44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0466 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0466  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  440  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6388  hypothetical protein  60.58 
 
 		 220 aa  262  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2086  hypothetical protein  60.56 
 
 		 221 aa  256  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0405838 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0417  hypothetical protein  60.09 
 
 		 224 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1287  hypothetical protein  56.25 
 
 		 217 aa  237  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.25253 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4193  hypothetical protein  54.38 
 
 		 218 aa  236  1e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0775  hypothetical protein  51.09 
 
 		 280 aa  228  5e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0949  hypothetical protein  50.66 
 
 		 280 aa  227  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187097  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5508  hypothetical protein  58.46 
 
 		 216 aa  227  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108926  normal  0.294794 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0787  hypothetical protein  50.66 
 
 		 280 aa  227  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0924735  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6280  hypothetical protein  59.69 
 
 		 219 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0032529 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6566  hypothetical protein  59.18 
 
 		 219 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7244  hypothetical protein  49.28 
 
 		 218 aa  218  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0175016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1915  hypothetical protein  32.46 
 
 		 200 aa  118  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.577578  normal  0.34771 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3684  hypothetical protein  35.38 
 
 		 244 aa  105  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.435578  normal  0.0330479 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5468  hypothetical protein  31.72 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1165  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.35 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0665  thioesterase  33.13 
 
 		 475 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6209  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.9 
 
 		 251 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0086  hypothetical protein  26.9 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2375  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  26.95 
 
 		 248 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.69303  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3384  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  26.67 
 
 		 246 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.515612 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00890  gluconate dehydrogenase small subunit  24.12 
 
 		 236 aa  49.3  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1924  hypothetical protein  26.13 
 
 		 237 aa  49.7  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.240204  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4094  hypothetical protein  26.63 
 
 		 252 aa  48.9  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.90179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2016  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.44 
 
 		 238 aa  48.1  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2561  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  25.9 
 
 		 248 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2178  hypothetical protein  24.43 
 
 		 187 aa  48.1  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3645  hypothetical protein  24.4 
 
 		 268 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4119  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.95 
 
 		 245 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1794  hypothetical protein  25 
 
 		 262 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653349  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4640  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.7 
 
 		 246 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.833906  normal  0.885196 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4382  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.6 
 
 		 263 aa  46.2  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3609  hypothetical protein  26.5 
 
 		 233 aa  45.8  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.465458  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4143  hypothetical protein  24.4 
 
 		 263 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00393741  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4223  hypothetical protein  24.4 
 
 		 263 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.15123 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3294  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.4 
 
 		 246 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.973305 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2136  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.35 
 
 		 245 aa  45.4  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.517564 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2564  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.1 
 
 		 245 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0228  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.81 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2976  hypothetical protein  24.55 
 
 		 238 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.522308  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35300  hypothetical protein  24.55 
 
 		 238 aa  42.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462474  normal  0.381438 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4679  hypothetical protein  27.42 
 
 		 176 aa  42  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3450  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  28.23 
 
 		 643 aa  41.6  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>