29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0257 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0257  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  710    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2868  hypothetical protein  37.27 
 
 		 330 aa  168  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.430946  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1790  hypothetical protein  34.12 
 
 		 318 aa  162  8.000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.269411  normal  0.659808 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1650  hypothetical protein  35.86 
 
 		 299 aa  158  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00343352  normal  0.111404 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3530  hypothetical protein  29.25 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.582782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5936  hypothetical protein  33.02 
 
 		 350 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.400754  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2459  hypothetical protein  31.72 
 
 		 351 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.243354 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3069  protein of unknown function DUF201  31.58 
 
 		 330 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3138  hypothetical protein  31.27 
 
 		 343 aa  110  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2621  hypothetical protein  38.22 
 
 		 319 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6502  hypothetical protein  29.97 
 
 		 357 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.868447  normal  0.0200511 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0283  protein of unknown function DUF201  30.03 
 
 		 360 aa  89.4  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1315  hypothetical protein  26.92 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1043  hypothetical protein  25.24 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0571  hypothetical protein  27.73 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0897117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1583  hypothetical protein  24.84 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0448  hypothetical protein  25.39 
 
 		 311 aa  57  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00145655  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1440  hypothetical protein  24.36 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.357308  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3436  hypothetical protein  26.05 
 
 		 319 aa  53.5  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0385752 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0329  hypothetical protein  22.94 
 
 		 302 aa  50.4  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1666  hypothetical protein  28 
 
 		 355 aa  50.1  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0920  hypothetical protein  24.66 
 
 		 295 aa  43.5  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0220945  hitchhiker  0.000000000622111 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1278  hypothetical protein  29.8 
 
 		 357 aa  43.1  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.422818  normal  0.140099 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0914  hypothetical protein  26.02 
 
 		 349 aa  43.1  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1384  hypothetical protein  22.86 
 
 		 295 aa  43.1  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1641  hypothetical protein  25.97 
 
 		 299 aa  42.7  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2798  hypothetical protein  28.1 
 
 		 366 aa  42.7  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5257  protein of unknown function DUF201  26.4 
 
 		 363 aa  42.7  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  25.95 
 
 		 405 aa  42.7  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>