More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0169 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0169  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
214 aa  437  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0816  adenine phosphoribosyltransferase  76.61 
 
 
171 aa  271  5.000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  53.41 
 
 
177 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  54.71 
 
 
182 aa  188  5.999999999999999e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  54.04 
 
 
176 aa  184  7e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  52.33 
 
 
173 aa  184  7e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  52.87 
 
 
181 aa  182  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  52.87 
 
 
181 aa  182  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3489  adenine phosphoribosyltransferase  56.55 
 
 
180 aa  181  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0169872 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2323  adenine phosphoribosyltransferase  55.29 
 
 
172 aa  181  6e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  51.83 
 
 
172 aa  181  9.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  51.76 
 
 
181 aa  179  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  52.35 
 
 
181 aa  180  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  51.76 
 
 
181 aa  179  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  53.53 
 
 
179 aa  179  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  50.6 
 
 
172 aa  179  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  51.46 
 
 
171 aa  179  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1431  adenine phosphoribosyltransferase  50.58 
 
 
178 aa  178  7e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000408759  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  52.38 
 
 
170 aa  177  9e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13598  Adenine phosphoribosyl transferase  51.48 
 
 
173 aa  177  1e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.910884  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  51.85 
 
 
181 aa  177  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2974  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
170 aa  176  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.46723  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1531  adenine phosphoribosyltransferase  50.6 
 
 
173 aa  176  2e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2454  adenine phosphoribosyltransferase  54.49 
 
 
424 aa  176  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0252819  hitchhiker  0.000000021435 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1432  adenine phosphoribosyltransferase  51.45 
 
 
185 aa  176  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.068464  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  52.07 
 
 
168 aa  176  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1558  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 
171 aa  176  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.459333 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13570  adenine phosphoribosyltransferase  54.22 
 
 
177 aa  176  3e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2682  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 
171 aa  175  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  47.19 
 
 
181 aa  175  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
172 aa  175  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2194  adenine phosphoribosyltransferase  55.36 
 
 
172 aa  175  4e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1905  adenine phosphoribosyltransferase  55.36 
 
 
172 aa  175  4e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.637099  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2270  adenine phosphoribosyltransferase  48.24 
 
 
180 aa  175  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739798  normal  0.613668 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1185  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
176 aa  175  4e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850843  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2098  adenine phosphoribosyltransferase  52.69 
 
 
174 aa  174  7e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 
171 aa  174  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1526  adenine phosphoribosyltransferase  47.95 
 
 
171 aa  174  8e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0650778  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3212  adenine phosphoribosyltransferase  51.72 
 
 
179 aa  174  8e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  47.8 
 
 
185 aa  173  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  47.7 
 
 
180 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  49.41 
 
 
179 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  51.18 
 
 
184 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2470  adenine phosphoribosyltransferase  53.53 
 
 
172 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  49.12 
 
 
171 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0311  adenine phosphoribosyltransferase  49.37 
 
 
190 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3653  adenine phosphoribosyltransferase  52.38 
 
 
174 aa  172  2.9999999999999996e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  49.15 
 
 
181 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  49.41 
 
 
175 aa  171  6.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  52.44 
 
 
170 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0657  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
170 aa  171  7.999999999999999e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000491203  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1836  adenine phosphoribosyltransferase  51.18 
 
 
178 aa  171  9e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.820901  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1004  adenine phosphoribosyltransferase  51.19 
 
 
172 aa  171  9e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  51.15 
 
 
183 aa  170  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  51.15 
 
 
183 aa  170  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  51.15 
 
 
183 aa  170  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 
187 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  51.15 
 
 
183 aa  170  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 
187 aa  170  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0363  adenine phosphoribosyltransferase  50.31 
 
 
205 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0485  adenine phosphoribosyltransferase  51.18 
 
 
178 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.994648  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
182 aa  170  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  51.15 
 
 
183 aa  170  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3236  adenine phosphoribosyltransferase  48.86 
 
 
185 aa  171  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0483226  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2325  adenine phosphoribosyltransferase  48 
 
 
179 aa  171  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.915682  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1842  adenine phosphoribosyltransferase  48.52 
 
 
175 aa  171  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.530485  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  51.15 
 
 
183 aa  170  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 
187 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  51.15 
 
 
183 aa  170  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  51.15 
 
 
183 aa  170  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0377  adenine phosphoribosyltransferase  47.16 
 
 
176 aa  170  1e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  46.93 
 
 
197 aa  171  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0299  adenine phosphoribosyltransferase  45.83 
 
 
202 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0417  adenine phosphoribosyltransferase  50.94 
 
 
231 aa  169  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0792  adenine phosphoribosyltransferase  47.98 
 
 
174 aa  170  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1719  adenine phosphoribosyltransferase  49.4 
 
 
172 aa  170  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0453146  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  47.67 
 
 
179 aa  169  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
183 aa  170  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0788  adenine phosphoribosyltransferase  48.55 
 
 
177 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.607381  normal  0.0139712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1804  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 
188 aa  169  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.05322  hitchhiker  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  48.26 
 
 
173 aa  169  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  50.57 
 
 
183 aa  169  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15290  adenine phosphoribosyltransferase  50.8 
 
 
187 aa  169  4e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.863479  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  50.58 
 
 
182 aa  169  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  48.77 
 
 
199 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2740  adenine phosphoribosyltransferase  47.95 
 
 
172 aa  169  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2613  adenine phosphoribosyltransferase  47.09 
 
 
179 aa  168  5e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0272  adenine phosphoribosyltransferase  50.96 
 
 
202 aa  168  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1084  adenine phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 
171 aa  168  6e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.226168  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4134  adenine phosphoribosyltransferase  48.26 
 
 
184 aa  168  7e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.488945 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0625  adenine phosphoribosyltransferase  48.28 
 
 
178 aa  168  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0543  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
183 aa  168  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0527  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
183 aa  168  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11259  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0527  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
183 aa  168  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0533  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
183 aa  168  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  48.85 
 
 
198 aa  167  8e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2619  adenine phosphoribosyltransferase  46.43 
 
 
173 aa  167  8e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0915  adenine phosphoribosyltransferase  48.81 
 
 
172 aa  167  8e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361097  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0938  adenine phosphoribosyltransferase  50.6 
 
 
170 aa  167  9e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0227  adenine phosphoribosyltransferase  48.21 
 
 
172 aa  167  1e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>