More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1324 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  100 
 
 
406 aa  800    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  62.65 
 
 
405 aa  488  1e-137  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  54.35 
 
 
410 aa  426  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  49.29 
 
 
420 aa  387  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  49.75 
 
 
401 aa  378  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  48.56 
 
 
413 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  47.51 
 
 
442 aa  372  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  50.12 
 
 
404 aa  375  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  49.28 
 
 
413 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  49.28 
 
 
413 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  49.28 
 
 
413 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3017  flagellar hook protein FlgE  49.64 
 
 
414 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  48.66 
 
 
402 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.498374 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  48.8 
 
 
413 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  48.8 
 
 
413 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  48.8 
 
 
413 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  48.66 
 
 
402 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2096  flagellar hook protein FlgE  48.8 
 
 
413 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  48.8 
 
 
413 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2997  flagellar hook protein FlgE  48.8 
 
 
413 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  48.8 
 
 
413 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0269  flagellar hook protein FlgE  48.8 
 
 
413 aa  365  1e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  48.33 
 
 
413 aa  364  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  48.32 
 
 
413 aa  361  2e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2426  flagellar basal body FlaE domain protein  48.18 
 
 
410 aa  356  5e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.594401 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  46.52 
 
 
414 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  46.52 
 
 
414 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  46.52 
 
 
414 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  47.3 
 
 
401 aa  350  4e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  45.56 
 
 
414 aa  348  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  46.27 
 
 
408 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1220  flagellar basal body FlaE domain protein  46.23 
 
 
408 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.423975  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  46.24 
 
 
425 aa  332  1e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24030  Flagellar basal body rod protein  45.68 
 
 
383 aa  324  1e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  44.25 
 
 
399 aa  325  1e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2847  flagellar hook protein FlgE  43.74 
 
 
438 aa  323  3e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.111901 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  44.78 
 
 
426 aa  319  6e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2375  hypothetical protein  44.32 
 
 
425 aa  316  5e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1871  flagellar hook protein FlgE  47.1 
 
 
405 aa  315  6e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2921  flagellar basal body FlaE domain protein  42.22 
 
 
450 aa  315  9.999999999999999e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.926176  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1227  flagellar hook protein FlgE  42.82 
 
 
437 aa  315  9.999999999999999e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  45.87 
 
 
401 aa  312  6.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5628  flagellar hook protein FlgE  44.76 
 
 
417 aa  311  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06156  flagellar hook protein FlgE  43.55 
 
 
407 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000721061  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2595  flagellar hook protein FlgE  45.04 
 
 
405 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01010  flagellar hook protein FlgE  43.55 
 
 
407 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432857  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  45.63 
 
 
401 aa  310  4e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  44.71 
 
 
423 aa  309  5e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  45.39 
 
 
402 aa  309  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  45.39 
 
 
402 aa  309  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1227  flagellar hook protein FlgE  42.14 
 
 
437 aa  308  1.0000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  44.9 
 
 
401 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  44.9 
 
 
401 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  44.66 
 
 
402 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  44.79 
 
 
404 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1590  flagellar hook protein FlgE  45.3 
 
 
404 aa  302  8.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2249  flagellar hook protein FlgE  44.42 
 
 
402 aa  301  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.467124  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2195  flagellar hook protein FlgE  44.31 
 
 
403 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000430421 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2011  flagellar hook protein FlgE  44.31 
 
 
403 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764857  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1274  flagellar hook protein FlgE  44.31 
 
 
403 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1773  flagellar hook-basal body protein  43.23 
 
 
418 aa  300  4e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1289  flagellar hook protein FlgE  44.31 
 
 
403 aa  299  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209767  normal  0.0125362 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1245  flagellar hook protein FlgE  44.31 
 
 
403 aa  299  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3949  flagellar hook protein FlgE  40.55 
 
 
440 aa  299  7e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1556  flagellar hook protein FlgE  45.35 
 
 
405 aa  298  1e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460065  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2321  flagellar hook protein FlgE  42.57 
 
 
428 aa  297  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2001  flagellar hook protein FlgE  42.57 
 
 
428 aa  297  2e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3478  flagellar hook protein FlgE  41.31 
 
 
442 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4297  flagellar hook protein FlgE  39.66 
 
 
462 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2422  flagellar hook protein FlgE  42.57 
 
 
428 aa  297  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.638743  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50450  flagellar hook protein FlgE  40.09 
 
 
462 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0277327 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3737  flagellar hook protein FlgE  43.49 
 
 
415 aa  295  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1936  flagellar hook protein FlgE  40 
 
 
441 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4388  flagellar hook protein FlgE  39.18 
 
 
440 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408667  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4248  flagellar hook protein FlgE  39.73 
 
 
443 aa  290  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0896  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  37.1 
 
 
430 aa  289  7e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1903  flagellar hook protein FlgE  42.03 
 
 
407 aa  288  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.117439 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2967  flagellar hook protein FlgE  43.17 
 
 
407 aa  287  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3729  flagellar hook protein FlgE  39.91 
 
 
451 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0517  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  38.42 
 
 
418 aa  278  1e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3968  flagellar hook protein FlgE  41.52 
 
 
395 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1975  flagellar basal body FlaE  41.28 
 
 
387 aa  275  9e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3575  flagellar hook protein FlgE  38.57 
 
 
398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3247  flagellar hook protein FlgE  37.55 
 
 
453 aa  273  3e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1324  flagellar hook protein FlgE  37.91 
 
 
453 aa  273  6e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0596368 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0209  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  39.26 
 
 
395 aa  272  7e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.676304 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3465  flagellar hook protein FlgE  41.18 
 
 
395 aa  271  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2315  flagellar hook protein FlgE  36.87 
 
 
453 aa  268  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3368  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  38.82 
 
 
400 aa  268  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0266  lateral flagellar hook protein LfgE  38.82 
 
 
400 aa  267  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3648  flagellar hook protein FlgE  40 
 
 
402 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2594  flagellar hook protein FlgE  37.25 
 
 
453 aa  266  5e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1262  flagellar hook protein FlgE  37.04 
 
 
453 aa  265  1e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0072  flagellar hook protein FlgE  40.39 
 
 
402 aa  264  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  39.22 
 
 
399 aa  263  4e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1332  flagellar hook protein FlgE  36.66 
 
 
453 aa  263  4e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2944  flagellar hook protein FlgE  36.19 
 
 
460 aa  262  6e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000737  flagellar hook protein FlgE  39.51 
 
 
398 aa  261  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0066  flagellar hook protein FlgE  38.83 
 
 
398 aa  260  4e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3097  flagellar hook protein FlgE  35.81 
 
 
453 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>