45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0564 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0564  transmembrane protein  100 
 
 		 245 aa  487  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.259181  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0167  putative transmembrane protein  36.44 
 
 		 248 aa  131  7.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2450  transmembrane protein  34.57 
 
 		 258 aa  128  8.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3819  hypothetical protein  31.6 
 
 		 267 aa  112  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.684968  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3818  hypothetical protein  34.23 
 
 		 333 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.836994  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3866  putative transmembrane protein  33.83 
 
 		 198 aa  97.1  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0306  hypothetical protein  29.81 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0337  hypothetical protein  29.81 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2420  hypothetical protein  29.81 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2557  major facilitator superfamily permease  29.46 
 
 		 270 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444054  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1681  hypothetical protein  29.81 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1485  hypothetical protein  29.81 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0860  hypothetical protein  29.46 
 
 		 270 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.106  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0599  hypothetical protein  29.84 
 
 		 270 aa  90.9  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4411  putative transmembrane protein  28.91 
 
 		 271 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4879  hypothetical protein  31.34 
 
 		 268 aa  89.7  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183073  hitchhiker  0.00161342 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0869  transmembrane protein  28.57 
 
 		 262 aa  88.6  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2841  putative transmembrane protein  30.15 
 
 		 268 aa  86.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3661  hypothetical protein  28.5 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3866  hypothetical protein  28.5 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00852916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4498  hypothetical protein  28.5 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0347943  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2230  hypothetical protein  28 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  0.319802 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2628  hypothetical protein  28.64 
 
 		 267 aa  79.7  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0418368  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6796  putative transmembrane protein  28.64 
 
 		 268 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000000273897  decreased coverage  0.0000000549645 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0168  putative transmembrane protein  29.07 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2439  putative transmembrane protein  27.64 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3234  hypothetical protein  28.5 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0371045 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3763  hypothetical protein  29 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.615277  hitchhiker  0.0015101 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1432  putative transmembrane protein  24.53 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.634697 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2046  hypothetical protein  27.01 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5328  hypothetical protein  25.94 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3976  ParB-like partition protein  28.26 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.180656 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1714  putative transmembrane protein  24.88 
 
 		 258 aa  67  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2234  hypothetical protein  24.91 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1927  hypothetical protein  27.5 
 
 		 271 aa  65.5  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164957 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1475  hypothetical protein  27.24 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0733  hypothetical protein  27.51 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.580141  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3321  hypothetical protein  24.35 
 
 		 275 aa  58.5  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0393967 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2673  hypothetical protein  24.35 
 
 		 275 aa  58.5  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.30693  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1539  hypothetical protein  26.27 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.610127  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03837  hypothetical protein  24.74 
 
 		 299 aa  53.1  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1726  hypothetical protein  25.75 
 
 		 269 aa  50.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3986  hypothetical protein  21.15 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.761342 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1059  hypothetical protein  22.17 
 
 		 268 aa  42.4  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1322  hypothetical protein  24.51 
 
 		 259 aa  42.4  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>