39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3321 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3321  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  541  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0393967 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2673  hypothetical protein  99.27 
 
 		 275 aa  537  9.999999999999999e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.30693  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1927  hypothetical protein  80 
 
 		 271 aa  417  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164957 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5328  hypothetical protein  70.85 
 
 		 277 aa  384  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1475  hypothetical protein  57.85 
 
 		 263 aa  285  5.999999999999999e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1322  hypothetical protein  53.05 
 
 		 259 aa  258  9e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1726  hypothetical protein  53.48 
 
 		 269 aa  254  9e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1539  hypothetical protein  45.59 
 
 		 274 aa  205  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.610127  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0860  hypothetical protein  37.98 
 
 		 270 aa  161  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.106  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2557  major facilitator superfamily permease  37.98 
 
 		 270 aa  161  9e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444054  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0306  hypothetical protein  36.69 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0337  hypothetical protein  36.69 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2420  hypothetical protein  36.69 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1681  hypothetical protein  36.69 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1485  hypothetical protein  36.69 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0599  hypothetical protein  38.76 
 
 		 270 aa  158  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4411  putative transmembrane protein  36.33 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4879  hypothetical protein  35.79 
 
 		 268 aa  152  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183073  hitchhiker  0.00161342 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3234  hypothetical protein  37.84 
 
 		 269 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0371045 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3763  hypothetical protein  37.84 
 
 		 269 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.615277  hitchhiker  0.0015101 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3866  hypothetical protein  37.07 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00852916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4498  hypothetical protein  37.07 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0347943  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3661  hypothetical protein  37.07 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2230  hypothetical protein  37.07 
 
 		 269 aa  149  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  0.319802 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2841  putative transmembrane protein  33.83 
 
 		 268 aa  139  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0869  transmembrane protein  34.93 
 
 		 262 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2628  hypothetical protein  34.62 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0418368  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6796  putative transmembrane protein  33.08 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000000273897  decreased coverage  0.0000000549645 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1145  hypothetical protein  39.42 
 
 		 269 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.325876  normal  0.29202 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1059  hypothetical protein  37 
 
 		 268 aa  109  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3819  hypothetical protein  28.47 
 
 		 267 aa  95.1  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.684968  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1432  putative transmembrane protein  29.29 
 
 		 259 aa  93.2  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.634697 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2439  putative transmembrane protein  31.3 
 
 		 265 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1714  putative transmembrane protein  29.52 
 
 		 258 aa  90.1  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2046  hypothetical protein  30.27 
 
 		 265 aa  89  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2234  hypothetical protein  31.25 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0168  putative transmembrane protein  28.46 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0564  transmembrane protein  24.35 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.259181  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3866  putative transmembrane protein  30.43 
 
 		 198 aa  47  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>