41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4498 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3866  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00852916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4498  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0347943  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3661  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2230  hypothetical protein  97.03 
 
 		 269 aa  486  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  0.319802 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3234  hypothetical protein  84.39 
 
 		 269 aa  447  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0371045 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3763  hypothetical protein  85.5 
 
 		 269 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.615277  hitchhiker  0.0015101 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4879  hypothetical protein  88.85 
 
 		 268 aa  440  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183073  hitchhiker  0.00161342 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1485  hypothetical protein  71.96 
 
 		 270 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1681  hypothetical protein  71.96 
 
 		 270 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2557  major facilitator superfamily permease  71.96 
 
 		 270 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444054  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2420  hypothetical protein  71.96 
 
 		 270 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0337  hypothetical protein  71.96 
 
 		 270 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0860  hypothetical protein  71.96 
 
 		 270 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.106  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0306  hypothetical protein  71.96 
 
 		 270 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0599  hypothetical protein  72.52 
 
 		 270 aa  380  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4411  putative transmembrane protein  66.79 
 
 		 271 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2841  putative transmembrane protein  68.08 
 
 		 268 aa  349  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6796  putative transmembrane protein  67.94 
 
 		 268 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000000273897  decreased coverage  0.0000000549645 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0869  transmembrane protein  50.56 
 
 		 262 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2628  hypothetical protein  49.63 
 
 		 267 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0418368  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2439  putative transmembrane protein  48.12 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2046  hypothetical protein  48.69 
 
 		 265 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2234  hypothetical protein  46.64 
 
 		 265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1714  putative transmembrane protein  40.38 
 
 		 258 aa  191  8e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1432  putative transmembrane protein  38.85 
 
 		 259 aa  185  9e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.634697 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1927  hypothetical protein  37.73 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164957 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5328  hypothetical protein  35.25 
 
 		 277 aa  162  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1475  hypothetical protein  37.45 
 
 		 263 aa  161  8.000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1322  hypothetical protein  35.14 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3321  hypothetical protein  38.22 
 
 		 275 aa  151  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0393967 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2673  hypothetical protein  38.22 
 
 		 275 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.30693  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1726  hypothetical protein  39.22 
 
 		 269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3819  hypothetical protein  36.74 
 
 		 267 aa  138  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.684968  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1539  hypothetical protein  36.24 
 
 		 274 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.610127  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0168  putative transmembrane protein  34.47 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1145  hypothetical protein  32.56 
 
 		 269 aa  99  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.325876  normal  0.29202 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1059  hypothetical protein  31.91 
 
 		 268 aa  93.6  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0564  transmembrane protein  28.5 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.259181  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2450  transmembrane protein  28.52 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3866  putative transmembrane protein  27.65 
 
 		 198 aa  55.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0167  putative transmembrane protein  28.7 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>