42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2450 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2450  transmembrane protein  100 
 
 		 258 aa  492  9.999999999999999e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0564  transmembrane protein  34.57 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.259181  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0167  putative transmembrane protein  32.33 
 
 		 248 aa  95.1  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3818  hypothetical protein  32.17 
 
 		 333 aa  79.3  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.836994  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3819  hypothetical protein  28.96 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.684968  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3661  hypothetical protein  27.04 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3866  hypothetical protein  27.04 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00852916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4498  hypothetical protein  27.04 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0347943  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2230  hypothetical protein  26.67 
 
 		 269 aa  72  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  0.319802 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0306  hypothetical protein  29.23 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4411  putative transmembrane protein  28.85 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0337  hypothetical protein  29.23 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2420  hypothetical protein  29.23 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2557  major facilitator superfamily permease  29.23 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444054  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1681  hypothetical protein  29.23 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1485  hypothetical protein  29.23 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0860  hypothetical protein  29.23 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.106  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2046  hypothetical protein  30.86 
 
 		 265 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2234  hypothetical protein  31.1 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2841  putative transmembrane protein  28.52 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4879  hypothetical protein  27.84 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183073  hitchhiker  0.00161342 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2439  putative transmembrane protein  30.86 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0599  hypothetical protein  28.85 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6796  putative transmembrane protein  25.95 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000000273897  decreased coverage  0.0000000549645 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0869  transmembrane protein  28.73 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1714  putative transmembrane protein  25 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3976  ParB-like partition protein  28.15 
 
 		 250 aa  62  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.180656 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0168  putative transmembrane protein  28.96 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1475  hypothetical protein  26.69 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3866  putative transmembrane protein  28.65 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3763  hypothetical protein  27.34 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.615277  hitchhiker  0.0015101 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2628  hypothetical protein  28.41 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0418368  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3234  hypothetical protein  27.84 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0371045 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1322  hypothetical protein  29.33 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1432  putative transmembrane protein  26.36 
 
 		 259 aa  53.9  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.634697 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1927  hypothetical protein  27.94 
 
 		 271 aa  51.2  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164957 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03837  hypothetical protein  27.21 
 
 		 299 aa  50.4  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0733  hypothetical protein  25.88 
 
 		 280 aa  50.4  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.580141  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5328  hypothetical protein  29.67 
 
 		 277 aa  49.7  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1539  hypothetical protein  26.15 
 
 		 274 aa  47  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.610127  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3986  hypothetical protein  26.83 
 
 		 303 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.761342 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0362  hypothetical protein  28.99 
 
 		 260 aa  42.4  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.984928  normal  0.154213 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>