41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2230 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2230  hypothetical protein  100 
 
 
269 aa  531  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  0.319802 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3866  hypothetical protein  97.03 
 
 
269 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00852916  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3661  hypothetical protein  97.03 
 
 
269 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492279  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4498  hypothetical protein  97.03 
 
 
269 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0347943  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3763  hypothetical protein  86.62 
 
 
269 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.615277  hitchhiker  0.0015101 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3234  hypothetical protein  85.5 
 
 
269 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0371045 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4879  hypothetical protein  87.73 
 
 
268 aa  437  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183073  hitchhiker  0.00161342 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1485  hypothetical protein  71.22 
 
 
270 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1681  hypothetical protein  71.22 
 
 
270 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2557  major facilitator superfamily permease  71.22 
 
 
270 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444054  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2420  hypothetical protein  71.22 
 
 
270 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0337  hypothetical protein  71.22 
 
 
270 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0860  hypothetical protein  71.22 
 
 
270 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.106  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0306  hypothetical protein  71.22 
 
 
270 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0599  hypothetical protein  70.48 
 
 
270 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4411  putative transmembrane protein  69.06 
 
 
271 aa  374  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2841  putative transmembrane protein  68.85 
 
 
268 aa  353  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6796  putative transmembrane protein  68.32 
 
 
268 aa  342  4e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000000273897  decreased coverage  0.0000000549645 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0869  transmembrane protein  50.19 
 
 
262 aa  248  7e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2628  hypothetical protein  49.25 
 
 
267 aa  245  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0418368  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2046  hypothetical protein  49.26 
 
 
265 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2439  putative transmembrane protein  48.33 
 
 
265 aa  211  9e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2234  hypothetical protein  47.04 
 
 
265 aa  199  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1714  putative transmembrane protein  39.62 
 
 
258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1432  putative transmembrane protein  38.85 
 
 
259 aa  185  6e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.634697 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1927  hypothetical protein  37.73 
 
 
271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0164957 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5328  hypothetical protein  34.07 
 
 
277 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1475  hypothetical protein  38.31 
 
 
263 aa  160  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1322  hypothetical protein  33.98 
 
 
259 aa  151  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3321  hypothetical protein  38.22 
 
 
275 aa  149  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0393967 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2673  hypothetical protein  38.22 
 
 
275 aa  149  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.30693  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1726  hypothetical protein  39.22 
 
 
269 aa  147  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3819  hypothetical protein  37.88 
 
 
267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.684968  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1539  hypothetical protein  35.37 
 
 
274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.610127  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0168  putative transmembrane protein  33.59 
 
 
257 aa  112  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1145  hypothetical protein  32.56 
 
 
269 aa  97.1  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.325876  normal  0.29202 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1059  hypothetical protein  31.37 
 
 
268 aa  95.9  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0564  transmembrane protein  28 
 
 
245 aa  73.9  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.259181  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2450  transmembrane protein  28.15 
 
 
258 aa  63.2  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0167  putative transmembrane protein  28.7 
 
 
248 aa  53.9  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3866  putative transmembrane protein  27.19 
 
 
198 aa  53.1  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>