41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6796 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6796  putative transmembrane protein  100 
 
 
268 aa  529  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000000273897  decreased coverage  0.0000000549645 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2841  putative transmembrane protein  94.78 
 
 
268 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4411  putative transmembrane protein  76.15 
 
 
271 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2557  major facilitator superfamily permease  66.92 
 
 
270 aa  371  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444054  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0860  hypothetical protein  66.92 
 
 
270 aa  371  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.106  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0306  hypothetical protein  66.92 
 
 
270 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1485  hypothetical protein  66.92 
 
 
270 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1681  hypothetical protein  66.92 
 
 
270 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2420  hypothetical protein  66.92 
 
 
270 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0337  hypothetical protein  66.92 
 
 
270 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0599  hypothetical protein  67.79 
 
 
270 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3234  hypothetical protein  66.04 
 
 
269 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0371045 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3763  hypothetical protein  65.67 
 
 
269 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.615277  hitchhiker  0.0015101 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2230  hypothetical protein  68.32 
 
 
269 aa  348  4e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  0.319802 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3661  hypothetical protein  67.94 
 
 
269 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492279  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4498  hypothetical protein  67.94 
 
 
269 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0347943  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3866  hypothetical protein  67.94 
 
 
269 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00852916  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4879  hypothetical protein  67.56 
 
 
268 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183073  hitchhiker  0.00161342 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0869  transmembrane protein  47.49 
 
 
262 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2628  hypothetical protein  47.29 
 
 
267 aa  228  6e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0418368  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2046  hypothetical protein  46.07 
 
 
265 aa  195  6e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2439  putative transmembrane protein  46.88 
 
 
265 aa  192  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2234  hypothetical protein  47.45 
 
 
265 aa  187  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1432  putative transmembrane protein  37.97 
 
 
259 aa  178  9e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.634697 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1714  putative transmembrane protein  37.8 
 
 
258 aa  171  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1927  hypothetical protein  35.61 
 
 
271 aa  156  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0164957 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5328  hypothetical protein  33.96 
 
 
277 aa  155  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1322  hypothetical protein  33.85 
 
 
259 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1475  hypothetical protein  33.08 
 
 
263 aa  147  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2673  hypothetical protein  33.46 
 
 
275 aa  137  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.30693  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3321  hypothetical protein  33.08 
 
 
275 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0393967 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1726  hypothetical protein  33.58 
 
 
269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3819  hypothetical protein  33.2 
 
 
267 aa  132  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.684968  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0168  putative transmembrane protein  32.82 
 
 
257 aa  110  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1145  hypothetical protein  32.95 
 
 
269 aa  102  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.325876  normal  0.29202 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1539  hypothetical protein  29.6 
 
 
274 aa  97.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.610127  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0564  transmembrane protein  29.15 
 
 
245 aa  85.9  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.259181  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1059  hypothetical protein  27.88 
 
 
268 aa  75.9  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0167  putative transmembrane protein  27.35 
 
 
248 aa  55.8  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2450  transmembrane protein  26.69 
 
 
258 aa  55.5  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3866  putative transmembrane protein  29.19 
 
 
198 aa  47.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>