11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03837 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03837  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  572  1.0000000000000001e-162  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3986  hypothetical protein  48.18 
 
 
303 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.761342 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1669  hypothetical protein  44.95 
 
 
302 aa  191  2e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1741  hypothetical protein  44 
 
 
362 aa  185  7e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0564  transmembrane protein  24.74 
 
 
245 aa  62.8  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.259181  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2450  transmembrane protein  28.22 
 
 
258 aa  62  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1927  hypothetical protein  27.6 
 
 
271 aa  48.9  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0164957 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0869  transmembrane protein  33.33 
 
 
262 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4879  hypothetical protein  26.32 
 
 
268 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183073  hitchhiker  0.00161342 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5328  hypothetical protein  29.54 
 
 
277 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3818  hypothetical protein  35.92 
 
 
333 aa  45.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.836994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>