35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3818 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3818  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  609  1e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.836994  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0167  putative transmembrane protein  37.6 
 
 
248 aa  142  8e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0564  transmembrane protein  34.23 
 
 
245 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.259181  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2450  transmembrane protein  31.78 
 
 
258 aa  88.2  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3976  ParB-like partition protein  28.27 
 
 
250 aa  75.1  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.180656 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3819  hypothetical protein  27.41 
 
 
267 aa  67.8  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.684968  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3866  putative transmembrane protein  26.9 
 
 
198 aa  67.4  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2230  hypothetical protein  27.84 
 
 
269 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  0.319802 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4879  hypothetical protein  26.77 
 
 
268 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183073  hitchhiker  0.00161342 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3661  hypothetical protein  27.6 
 
 
269 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492279  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3866  hypothetical protein  27.6 
 
 
269 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00852916  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4498  hypothetical protein  27.6 
 
 
269 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0347943  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1485  hypothetical protein  25.1 
 
 
270 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1681  hypothetical protein  25.1 
 
 
270 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2420  hypothetical protein  25.1 
 
 
270 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0337  hypothetical protein  25.1 
 
 
270 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0306  hypothetical protein  25.1 
 
 
270 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0860  hypothetical protein  25.1 
 
 
270 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.106  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2557  major facilitator superfamily permease  25.1 
 
 
270 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444054  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03837  hypothetical protein  28.32 
 
 
299 aa  53.9  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4411  putative transmembrane protein  24.9 
 
 
271 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1475  hypothetical protein  27.91 
 
 
263 aa  49.7  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2628  hypothetical protein  28.87 
 
 
267 aa  49.3  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0418368  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3986  hypothetical protein  33.9 
 
 
303 aa  48.9  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.761342 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3234  hypothetical protein  26.3 
 
 
269 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0371045 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3763  hypothetical protein  26.3 
 
 
269 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.615277  hitchhiker  0.0015101 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0869  transmembrane protein  30.81 
 
 
262 aa  47  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0599  hypothetical protein  24.9 
 
 
270 aa  46.2  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2841  putative transmembrane protein  24.05 
 
 
268 aa  46.2  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1726  hypothetical protein  26.42 
 
 
269 aa  45.8  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3048  integral membrane protein  27.13 
 
 
275 aa  44.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702381  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1927  hypothetical protein  30.64 
 
 
271 aa  43.9  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0164957 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6796  putative transmembrane protein  25.48 
 
 
268 aa  43.5  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000000273897  decreased coverage  0.0000000549645 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0168  putative transmembrane protein  29.19 
 
 
257 aa  43.5  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1322  hypothetical protein  27.52 
 
 
259 aa  43.1  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>