33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3866 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3866  putative transmembrane protein  100 
 
 		 198 aa  385  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0564  transmembrane protein  33.83 
 
 		 245 aa  97.1  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.259181  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0167  putative transmembrane protein  31.91 
 
 		 248 aa  90.5  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3976  ParB-like partition protein  31.91 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.180656 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3819  hypothetical protein  29.63 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.684968  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3818  hypothetical protein  37.78 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.836994  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0168  putative transmembrane protein  28.95 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4879  hypothetical protein  31.52 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183073  hitchhiker  0.00161342 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1485  hypothetical protein  29.44 
 
 		 270 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1681  hypothetical protein  29.44 
 
 		 270 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2557  major facilitator superfamily permease  29.44 
 
 		 270 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444054  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2420  hypothetical protein  29.44 
 
 		 270 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0337  hypothetical protein  29.44 
 
 		 270 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0860  hypothetical protein  29.44 
 
 		 270 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.106  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0306  hypothetical protein  29.44 
 
 		 270 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2234  hypothetical protein  26.54 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2046  hypothetical protein  26.98 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0869  transmembrane protein  32.18 
 
 		 262 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3866  hypothetical protein  29.09 
 
 		 269 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00852916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4498  hypothetical protein  29.09 
 
 		 269 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0347943  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3661  hypothetical protein  29.09 
 
 		 269 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2439  putative transmembrane protein  26.98 
 
 		 265 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4411  putative transmembrane protein  28.66 
 
 		 271 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2230  hypothetical protein  28.48 
 
 		 269 aa  52.4  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  0.319802 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2628  hypothetical protein  29.14 
 
 		 267 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0418368  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1714  putative transmembrane protein  24.34 
 
 		 258 aa  50.1  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2450  transmembrane protein  28.35 
 
 		 258 aa  50.4  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2841  putative transmembrane protein  29.27 
 
 		 268 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3234  hypothetical protein  28.25 
 
 		 269 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0371045 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0599  hypothetical protein  28.5 
 
 		 270 aa  46.6  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3763  hypothetical protein  27.8 
 
 		 269 aa  45.4  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.615277  hitchhiker  0.0015101 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6796  putative transmembrane protein  27.16 
 
 		 268 aa  42.4  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000000273897  decreased coverage  0.0000000549645 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1432  putative transmembrane protein  24.41 
 
 		 259 aa  42  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.634697 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>