43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0168 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0168  putative transmembrane protein  100 
 
 		 257 aa  500  1e-141  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3819  hypothetical protein  41.96 
 
 		 267 aa  189  4e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.684968  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3763  hypothetical protein  36.5 
 
 		 269 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.615277  hitchhiker  0.0015101 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4411  putative transmembrane protein  35.11 
 
 		 271 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3234  hypothetical protein  37.22 
 
 		 269 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0371045 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2230  hypothetical protein  35.5 
 
 		 269 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  0.319802 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0306  hypothetical protein  35.63 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3661  hypothetical protein  34.73 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0337  hypothetical protein  35.63 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2420  hypothetical protein  35.63 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2557  major facilitator superfamily permease  35.63 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444054  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1681  hypothetical protein  35.63 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1485  hypothetical protein  35.63 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3866  hypothetical protein  34.73 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00852916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4498  hypothetical protein  34.73 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0347943  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0860  hypothetical protein  35.63 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.106  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0599  hypothetical protein  36.02 
 
 		 270 aa  135  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4879  hypothetical protein  35.47 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183073  hitchhiker  0.00161342 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2841  putative transmembrane protein  33.97 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6796  putative transmembrane protein  33.2 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000000273897  decreased coverage  0.0000000549645 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0869  transmembrane protein  32.82 
 
 		 262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2439  putative transmembrane protein  33.08 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2046  hypothetical protein  32.69 
 
 		 265 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1475  hypothetical protein  29.12 
 
 		 263 aa  105  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1927  hypothetical protein  29.89 
 
 		 271 aa  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164957 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5328  hypothetical protein  30.65 
 
 		 277 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2673  hypothetical protein  30.08 
 
 		 275 aa  102  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.30693  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2628  hypothetical protein  29.73 
 
 		 267 aa  102  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0418368  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2234  hypothetical protein  33.97 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3321  hypothetical protein  29.69 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0393967 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1714  putative transmembrane protein  32.03 
 
 		 258 aa  98.2  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1322  hypothetical protein  31.27 
 
 		 259 aa  96.7  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0564  transmembrane protein  29.07 
 
 		 245 aa  95.9  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.259181  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1432  putative transmembrane protein  32.08 
 
 		 259 aa  85.9  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.634697 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1726  hypothetical protein  28.4 
 
 		 269 aa  85.1  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2450  transmembrane protein  30.5 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1539  hypothetical protein  28.06 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.610127  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0167  putative transmembrane protein  26.82 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3866  putative transmembrane protein  29.05 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1145  hypothetical protein  30.15 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.325876  normal  0.29202 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1059  hypothetical protein  27.41 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3818  hypothetical protein  25.73 
 
 		 333 aa  48.9  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.836994  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0733  hypothetical protein  27.9 
 
 		 280 aa  46.6  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.580141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>