48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0167 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0167  putative transmembrane protein  100 
 
 		 248 aa  478  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0564  transmembrane protein  37.45 
 
 		 245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.259181  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3818  hypothetical protein  36.52 
 
 		 333 aa  115  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.836994  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3866  putative transmembrane protein  34.92 
 
 		 198 aa  95.1  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3819  hypothetical protein  32.27 
 
 		 267 aa  90.1  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.684968  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2450  transmembrane protein  33.62 
 
 		 258 aa  90.1  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3976  ParB-like partition protein  27.85 
 
 		 250 aa  72  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.180656 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2628  hypothetical protein  30.32 
 
 		 267 aa  68.6  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0418368  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0869  transmembrane protein  28.35 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3866  hypothetical protein  29.15 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00852916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1681  hypothetical protein  28.82 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1485  hypothetical protein  28.82 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0306  hypothetical protein  28.82 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2557  major facilitator superfamily permease  28.82 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444054  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2420  hypothetical protein  28.82 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0337  hypothetical protein  28.82 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3661  hypothetical protein  29.15 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4498  hypothetical protein  29.15 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0347943  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0860  hypothetical protein  28.82 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.106  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4879  hypothetical protein  31.05 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183073  hitchhiker  0.00161342 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2230  hypothetical protein  29.15 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  0.319802 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2098  protein of unknown function DUF975  26.67 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.274945  normal  0.188406 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4411  putative transmembrane protein  29.46 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2841  putative transmembrane protein  28.77 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1475  hypothetical protein  25 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0599  hypothetical protein  27.51 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1900  hypothetical protein  25.75 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.873498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3763  hypothetical protein  28.14 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.615277  hitchhiker  0.0015101 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3234  hypothetical protein  28.14 
 
 		 269 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0371045 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0168  putative transmembrane protein  26.77 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2073  hypothetical protein  27.8 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000612499  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1539  hypothetical protein  26.13 
 
 		 274 aa  53.5  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.610127  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1714  putative transmembrane protein  24.54 
 
 		 258 aa  52.8  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1482  hypothetical protein  25.71 
 
 		 257 aa  52.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2146  hypothetical protein  28.03 
 
 		 218 aa  52  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00523759  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0733  hypothetical protein  23.44 
 
 		 280 aa  51.6  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.580141  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6796  putative transmembrane protein  26.73 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000000273897  decreased coverage  0.0000000549645 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1322  hypothetical protein  24.48 
 
 		 259 aa  51.2  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5328  hypothetical protein  24.08 
 
 		 277 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1737  putative cytochrome c oxidase, subunit I  24.18 
 
 		 260 aa  48.5  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1050  integral membrane protein  24.19 
 
 		 291 aa  46.6  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.143905 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1726  hypothetical protein  24.9 
 
 		 269 aa  45.8  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1927  hypothetical protein  25.98 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164957 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1432  putative transmembrane protein  26.73 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.634697 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2439  putative transmembrane protein  27.95 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5347  hypothetical protein  23.88 
 
 		 264 aa  43.9  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1494  hypothetical protein  23.11 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.452839  normal  0.118134 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2046  hypothetical protein  27.95 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>