41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2439 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2439  putative transmembrane protein  100 
 
 		 265 aa  522  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2046  hypothetical protein  97.72 
 
 		 265 aa  511  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2234  hypothetical protein  88.64 
 
 		 265 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0869  transmembrane protein  54.86 
 
 		 262 aa  302  5.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2628  hypothetical protein  54.31 
 
 		 267 aa  278  5e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0418368  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1714  putative transmembrane protein  43.02 
 
 		 258 aa  225  6e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0306  hypothetical protein  46.69 
 
 		 270 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0337  hypothetical protein  46.69 
 
 		 270 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2420  hypothetical protein  46.69 
 
 		 270 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1681  hypothetical protein  46.69 
 
 		 270 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1485  hypothetical protein  46.69 
 
 		 270 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0860  hypothetical protein  45.96 
 
 		 270 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.106  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2557  major facilitator superfamily permease  45.96 
 
 		 270 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444054  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4411  putative transmembrane protein  46.77 
 
 		 271 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4879  hypothetical protein  48.31 
 
 		 268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183073  hitchhiker  0.00161342 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2230  hypothetical protein  47.58 
 
 		 269 aa  216  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  0.319802 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0599  hypothetical protein  47.43 
 
 		 270 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4498  hypothetical protein  48.5 
 
 		 269 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0347943  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3866  hypothetical protein  48.5 
 
 		 269 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00852916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3661  hypothetical protein  48.5 
 
 		 269 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1432  putative transmembrane protein  42.29 
 
 		 259 aa  211  7e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.634697 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3763  hypothetical protein  46.3 
 
 		 269 aa  209  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.615277  hitchhiker  0.0015101 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3234  hypothetical protein  46.62 
 
 		 269 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0371045 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2841  putative transmembrane protein  45.49 
 
 		 268 aa  201  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6796  putative transmembrane protein  46.27 
 
 		 268 aa  195  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000000273897  decreased coverage  0.0000000549645 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3819  hypothetical protein  31.78 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.684968  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5328  hypothetical protein  33.2 
 
 		 277 aa  115  8.999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1927  hypothetical protein  31.72 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164957 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1475  hypothetical protein  31.66 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1059  hypothetical protein  31.32 
 
 		 268 aa  103  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1322  hypothetical protein  31.13 
 
 		 259 aa  99.8  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0168  putative transmembrane protein  30.15 
 
 		 257 aa  98.6  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1726  hypothetical protein  30.86 
 
 		 269 aa  95.1  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2673  hypothetical protein  32.06 
 
 		 275 aa  88.6  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.30693  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3321  hypothetical protein  31.68 
 
 		 275 aa  87  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0393967 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0564  transmembrane protein  28.52 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.259181  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1539  hypothetical protein  29.33 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.610127  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2450  transmembrane protein  30.86 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1145  hypothetical protein  32.69 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.325876  normal  0.29202 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3866  putative transmembrane protein  26.79 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0167  putative transmembrane protein  28.82 
 
 		 248 aa  52.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>