39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1145 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1145  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  519  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.325876  normal  0.29202 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1927  hypothetical protein  43.88 
 
 		 271 aa  170  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164957 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3321  hypothetical protein  40.15 
 
 		 275 aa  154  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0393967 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5328  hypothetical protein  39.19 
 
 		 277 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2673  hypothetical protein  39.78 
 
 		 275 aa  152  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.30693  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1322  hypothetical protein  38.91 
 
 		 259 aa  151  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1475  hypothetical protein  36.47 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0306  hypothetical protein  32.73 
 
 		 270 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0337  hypothetical protein  32.73 
 
 		 270 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2420  hypothetical protein  32.73 
 
 		 270 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1681  hypothetical protein  32.73 
 
 		 270 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1485  hypothetical protein  32.73 
 
 		 270 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2557  major facilitator superfamily permease  33.33 
 
 		 270 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444054  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0860  hypothetical protein  33.33 
 
 		 270 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.106  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4498  hypothetical protein  34.98 
 
 		 269 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0347943  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3661  hypothetical protein  34.98 
 
 		 269 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3866  hypothetical protein  34.98 
 
 		 269 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00852916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0599  hypothetical protein  32.95 
 
 		 270 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2230  hypothetical protein  34.22 
 
 		 269 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  0.319802 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4411  putative transmembrane protein  32.56 
 
 		 271 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4879  hypothetical protein  33.33 
 
 		 268 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183073  hitchhiker  0.00161342 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3234  hypothetical protein  32.34 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0371045 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3763  hypothetical protein  32.34 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.615277  hitchhiker  0.0015101 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2841  putative transmembrane protein  33.96 
 
 		 268 aa  125  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6796  putative transmembrane protein  33.72 
 
 		 268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000000273897  decreased coverage  0.0000000549645 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1726  hypothetical protein  33.46 
 
 		 269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1059  hypothetical protein  35.64 
 
 		 268 aa  112  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1539  hypothetical protein  36.73 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.610127  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0869  transmembrane protein  29.84 
 
 		 262 aa  98.6  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2628  hypothetical protein  29 
 
 		 267 aa  97.4  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0418368  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1714  putative transmembrane protein  27.51 
 
 		 258 aa  90.5  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1432  putative transmembrane protein  26.95 
 
 		 259 aa  90.9  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.634697 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3819  hypothetical protein  30 
 
 		 267 aa  87.8  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.684968  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2439  putative transmembrane protein  27.01 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2234  hypothetical protein  26.97 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2046  hypothetical protein  26.74 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0168  putative transmembrane protein  29.12 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0564  transmembrane protein  24.81 
 
 		 245 aa  53.1  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.259181  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2450  transmembrane protein  29.64 
 
 		 258 aa  43.1  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>