38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1059 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1059  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  506  9.999999999999999e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1927  hypothetical protein  34.75 
 
 		 271 aa  122  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164957 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5328  hypothetical protein  33.7 
 
 		 277 aa  122  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1475  hypothetical protein  30.48 
 
 		 263 aa  112  8.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3321  hypothetical protein  35.09 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0393967 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2673  hypothetical protein  35.09 
 
 		 275 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.30693  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3763  hypothetical protein  33.7 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.615277  hitchhiker  0.0015101 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3234  hypothetical protein  33.96 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0371045 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0306  hypothetical protein  30.37 
 
 		 270 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1681  hypothetical protein  30.37 
 
 		 270 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2557  major facilitator superfamily permease  30.37 
 
 		 270 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444054  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1485  hypothetical protein  30.37 
 
 		 270 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2420  hypothetical protein  30.37 
 
 		 270 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0337  hypothetical protein  30.37 
 
 		 270 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0860  hypothetical protein  30.37 
 
 		 270 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.106  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2230  hypothetical protein  31.37 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  0.319802 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0869  transmembrane protein  30.08 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1322  hypothetical protein  31.85 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2439  putative transmembrane protein  32.71 
 
 		 265 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3661  hypothetical protein  31.91 
 
 		 269 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2046  hypothetical protein  32.21 
 
 		 265 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3866  hypothetical protein  31.91 
 
 		 269 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00852916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4498  hypothetical protein  31.91 
 
 		 269 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0347943  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0599  hypothetical protein  30.08 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4411  putative transmembrane protein  30.86 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4879  hypothetical protein  31.52 
 
 		 268 aa  97.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183073  hitchhiker  0.00161342 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1726  hypothetical protein  30.68 
 
 		 269 aa  94.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2628  hypothetical protein  27.8 
 
 		 267 aa  92.4  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0418368  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2234  hypothetical protein  31.82 
 
 		 265 aa  92  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1145  hypothetical protein  36.5 
 
 		 269 aa  91.3  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.325876  normal  0.29202 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1714  putative transmembrane protein  28.24 
 
 		 258 aa  91.3  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1432  putative transmembrane protein  27.86 
 
 		 259 aa  87  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.634697 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2841  putative transmembrane protein  29.78 
 
 		 268 aa  86.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6796  putative transmembrane protein  27.99 
 
 		 268 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000000273897  decreased coverage  0.0000000549645 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1539  hypothetical protein  28.77 
 
 		 274 aa  75.9  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.610127  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3819  hypothetical protein  30.66 
 
 		 267 aa  75.5  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.684968  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0168  putative transmembrane protein  26.26 
 
 		 257 aa  43.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2450  transmembrane protein  27.95 
 
 		 258 aa  42.7  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>