More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1007 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1007  hypothetical protein  100 
 
 
422 aa  857    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0832  hypothetical protein  62.17 
 
 
417 aa  531  1e-149  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000822238 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  36.96 
 
 
420 aa  281  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  36.6 
 
 
429 aa  257  3e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  34.13 
 
 
421 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  33.65 
 
 
421 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0049  protein of unknown function DUF21  34.36 
 
 
467 aa  252  8.000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0885  protein of unknown function DUF21  34.39 
 
 
470 aa  250  3e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182877  normal  0.402091 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2054  hypothetical protein  35.55 
 
 
422 aa  250  3e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000265297  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  34.95 
 
 
429 aa  247  3e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1713  protein of unknown function DUF21  34.06 
 
 
477 aa  247  3e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  38.2 
 
 
426 aa  246  6e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  35.6 
 
 
425 aa  245  9e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  35.38 
 
 
421 aa  240  4e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1548  protein of unknown function DUF21  31.94 
 
 
468 aa  239  5.999999999999999e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0450  hypothetical protein  35.05 
 
 
418 aa  238  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00320716  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
417 aa  238  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1532  hypothetical protein  33.02 
 
 
442 aa  236  6e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.788333 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  33.75 
 
 
424 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1482  hypothetical protein  32.6 
 
 
442 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.14439  normal  0.218713 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4780  protein of unknown function DUF21  31.27 
 
 
443 aa  232  1e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.000717269  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1427  hypothetical protein  32.86 
 
 
437 aa  232  1e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.108419 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0407  protein of unknown function DUF21  35.18 
 
 
464 aa  232  1e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.426667  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  32.51 
 
 
424 aa  231  2e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  33.17 
 
 
420 aa  230  3e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2814  hypothetical protein  32.36 
 
 
442 aa  230  3e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  33.25 
 
 
424 aa  230  4e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3404  hypothetical protein  30.5 
 
 
428 aa  228  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.978563  normal  0.632864 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1613  UPF0053 inner membrane protein  31.47 
 
 
433 aa  227  3e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405489  normal  0.446608 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  33.01 
 
 
448 aa  224  2e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2275  hypothetical protein  33.97 
 
 
429 aa  224  2e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.746126  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  33.76 
 
 
425 aa  224  3e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1183  protein of unknown function DUF21  33.81 
 
 
424 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000010351  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  31.03 
 
 
464 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1410  protein of unknown function DUF21  31.27 
 
 
456 aa  222  9.999999999999999e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  29.76 
 
 
434 aa  221  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1630  hypothetical protein  30.5 
 
 
464 aa  219  6e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0534  hypothetical protein  32.19 
 
 
436 aa  219  7e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.616871 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2230  protein of unknown function DUF21  30.73 
 
 
464 aa  217  4e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214459  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1716  hypothetical protein  31.87 
 
 
429 aa  216  8e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.230477  normal  0.276793 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0911  hypothetical protein  31.09 
 
 
435 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  32.49 
 
 
414 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7571  CBS domain-containing protein  31.02 
 
 
434 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.52117 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  29.51 
 
 
422 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0537  hypothetical protein  30.71 
 
 
447 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.947499  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39600  Mg/Co transporter-like protein  30 
 
 
426 aa  212  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100251  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2313  hypothetical protein  30.05 
 
 
426 aa  211  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1777  protein of unknown function DUF21  32.03 
 
 
424 aa  211  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2723  protein of unknown function DUF21  32.04 
 
 
438 aa  210  3e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0292  hypothetical protein  30.47 
 
 
440 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.682803 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  32.56 
 
 
434 aa  210  4e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3007  hypothetical protein  30.46 
 
 
413 aa  209  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103767  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3367  hypothetical protein  30.52 
 
 
427 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00577149  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3232  hypothetical protein  30.52 
 
 
418 aa  206  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000119021  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2317  protein of unknown function DUF21  31.94 
 
 
438 aa  206  6e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00842677 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2000  hemolysin-like protein  31.82 
 
 
445 aa  206  6e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0678745  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2895  hypothetical protein  30.22 
 
 
413 aa  206  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.132173  normal  0.997899 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2893  hypothetical protein  30.22 
 
 
413 aa  206  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2825  hypothetical protein  30.22 
 
 
413 aa  206  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00280306  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2483  hypothetical protein  29.57 
 
 
442 aa  205  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.767391  normal  0.0571877 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1062  protein of unknown function DUF21  29.98 
 
 
413 aa  204  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000790091  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1071  hypothetical protein  29.98 
 
 
413 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0188831  normal  0.0406794 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0469  hypothetical protein  28.09 
 
 
426 aa  205  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272499  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  31.17 
 
 
446 aa  204  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2875  hypothetical protein  30.22 
 
 
413 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.156935  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1354  hemolysin protein, putative  31.19 
 
 
423 aa  203  4e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3001  hypothetical protein  30.27 
 
 
420 aa  203  5e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119732  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2771  hypothetical protein  30.27 
 
 
420 aa  203  5e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000124547  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2896  hypothetical protein  30.27 
 
 
420 aa  203  5e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147354  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1166  hypothetical protein  27.97 
 
 
427 aa  203  5e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.215094 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2764  hypothetical protein  30.27 
 
 
420 aa  203  5e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000294524  normal  0.119885 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1158  CBS domain-containing protein  29.69 
 
 
452 aa  202  7e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0849  hypothetical protein  30.53 
 
 
429 aa  202  8e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000648521  hitchhiker  0.0000222957 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  29.86 
 
 
447 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  32.4 
 
 
430 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3773  hypothetical protein  30.92 
 
 
418 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163336  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2181  hypothetical protein  30.37 
 
 
454 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0558  CBS domain-containing protein  30.17 
 
 
427 aa  201  1.9999999999999998e-50  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2563  hypothetical protein  30.84 
 
 
434 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0842  protein of unknown function DUF21  28.74 
 
 
430 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3066  hypothetical protein  32.04 
 
 
429 aa  199  7e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.897226  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3093  hypothetical protein  29.72 
 
 
413 aa  198  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000167222  normal  0.148775 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0424  protein of unknown function DUF21  27.54 
 
 
428 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  29.36 
 
 
432 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1668  hypothetical protein  28.78 
 
 
429 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.905318  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0886  hypothetical protein  31 
 
 
429 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0798  protein of unknown function DUF21  32.2 
 
 
429 aa  196  6e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3830  CBS domain-containing protein  28.95 
 
 
464 aa  196  6e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  28.95 
 
 
445 aa  196  7e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2004  hypothetical protein  29.98 
 
 
431 aa  196  8.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2027  CBS domain-containing protein  32.2 
 
 
435 aa  196  8.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.765021  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0718  hypothetical protein  29.54 
 
 
428 aa  196  8.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229015  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1949  CBS domain-containing protein  32.2 
 
 
435 aa  196  8.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1251  hypothetical protein  29.6 
 
 
424 aa  195  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000334819  hitchhiker  0.00000258332 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  30.36 
 
 
426 aa  194  3e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  28.95 
 
 
442 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2841  hypothetical protein  30.47 
 
 
423 aa  194  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.063755  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2923  hypothetical protein  30.69 
 
 
423 aa  194  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.801289  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1419  protein of unknown function DUF21  28.53 
 
 
423 aa  193  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3020  hypothetical protein  30.22 
 
 
423 aa  193  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000521324  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>