25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0836 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  512  1e-144  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  48.42 
 
 
453 aa  66.2  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2504  ribonuclease  53.66 
 
 
1084 aa  62.4  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  36.7 
 
 
522 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  39.05 
 
 
407 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  36 
 
 
830 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4200  hypothetical protein  36.63 
 
 
857 aa  53.1  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3858  rhs element Vgr protein  43.68 
 
 
258 aa  52.8  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1512  hypothetical protein  37.5 
 
 
1261 aa  52.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23491  hypothetical protein  47.83 
 
 
480 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.425384 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.84 
 
 
257 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1469  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  52.54 
 
 
445 aa  45.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0854841  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0549  hypothetical protein  38.4 
 
 
501 aa  45.8  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  36.59 
 
 
489 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  49.55 
 
 
2313 aa  45.8  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.72 
 
 
1162 aa  45.4  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  28.28 
 
 
1394 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  27.73 
 
 
778 aa  45.4  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2598  KR domain protein  45.65 
 
 
7149 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  36.84 
 
 
484 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  39.62 
 
 
1281 aa  43.1  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  40 
 
 
625 aa  43.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  60.47 
 
 
363 aa  43.1  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000110923  unclonable  0.000000219993 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0403  hypothetical protein  35.79 
 
 
938 aa  42.7  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.879706  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2975  membrane protein  35.16 
 
 
833 aa  42  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>