55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0225 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0225  50S ribosomal protein L7Ae  100 
 
 		 128 aa  255  2e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1068  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  54.47 
 
 		 130 aa  150  5e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.0039063  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1580  50S ribosomal protein L7Ae  52.89 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1759  50S ribosomal protein L7Ae  52.07 
 
 		 153 aa  140  5e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0217268  hitchhiker  0.000585072 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0589  50S ribosomal protein L7Ae  50.41 
 
 		 169 aa  137  6e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.962005  hitchhiker  0.000204671 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2132  50S ribosomal protein L7Ae  49.59 
 
 		 125 aa  134  3.0000000000000003e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00358351  hitchhiker  0.0000558661 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1236  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  51.26 
 
 		 121 aa  130  3.9999999999999996e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0331  50S ribosomal protein L7Ae  44.26 
 
 		 122 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0219  50S ribosomal protein L7Ae  51.28 
 
 		 117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1846  50S ribosomal protein L7Ae  45.45 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1842  50S ribosomal protein L7Ae  49.57 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00104534  normal  0.186642 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0721  50S ribosomal protein L7Ae  47.54 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0318706  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2621  50S ribosomal protein L7Ae  47.01 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302096  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0493  50S ribosomal protein L7Ae  51.2 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3388  50S ribosomal protein L7Ae  47.06 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000000732492  normal  0.0682764 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0443  50S ribosomal protein L7Ae  59.77 
 
 		 149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1601  50S ribosomal protein L7Ae  47.9 
 
 		 122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.718255 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0750  50S ribosomal protein L7Ae  47.86 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.897962  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0081  50S ribosomal protein L7Ae  48.65 
 
 		 117 aa  114  3e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.309731  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0523  50S ribosomal protein L7Ae  43.9 
 
 		 122 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.535144 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2527  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  47.41 
 
 		 120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0690  50S ribosomal protein L7Ae  47.01 
 
 		 122 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.197581 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0451  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  44.07 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.202723  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1553  50S ribosomal protein L7Ae  43.24 
 
 		 136 aa  105  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.751058  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1497  50S ribosomal protein L7Ae  41.53 
 
 		 122 aa  104  5e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.122049 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0963  50S ribosomal protein L7Ae  43.24 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0248  50S ribosomal protein L7Ae  43.24 
 
 		 136 aa  101  4e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.182406  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1665  50S ribosomal protein L7Ae  43.24 
 
 		 136 aa  101  4e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0339872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53138  predicted protein  42.31 
 
 		 126 aa  87.4  5e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01500  snRNP subunit, putative  43.18 
 
 		 127 aa  84  6e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9983  predicted protein  40.91 
 
 		 123 aa  80.1  0.000000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79967  predicted protein  34 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41236  predicted protein  48.65 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01319  snRNP and snoRNP protein (Snu13), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05950)  40.45 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17769  predicted protein  45.45 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000637772  hitchhiker  0.00579454 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36743  predicted protein  39.29 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.931628  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01710  nucleolar protein family A member 2, putative  32.98 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_26963  60S ribosomal protein L7A  37.5 
 
 		 253 aa  53.5  0.0000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.546499 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00695  small nuclear ribonucleoprotein complex protein Nhp2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13570)  29.63 
 
 		 224 aa  53.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41276  Ribosomal protein L7a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  44.64 
 
 		 254 aa  52.4  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86627  ribosomal protein L8B (L4B) (rp6) (YL5)  36.36 
 
 		 261 aa  52.4  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0378292  normal  0.472149 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0314  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  38.24 
 
 		 80 aa  51.6  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000236555  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2466  50S ribosomal protein L7AE  39.47 
 
 		 83 aa  51.2  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0116433 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0806  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  34.78 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000124413  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_23079  predicted protein  35.37 
 
 		 259 aa  49.3  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.740425  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0188  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  34.78 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158603  decreased coverage  0.00101223 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1530  hypothetical protein  36.23 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000100287  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05520  cytosolic large ribosomal subunit protein L7A (AFU_orthologue; AFUA_6G12990)  38.89 
 
 		 264 aa  47.4  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.32412 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02040  ribosomal protein L4, putative  38.03 
 
 		 266 aa  46.2  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.637781  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34756  predicted protein  35.63 
 
 		 214 aa  45.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.351945  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0280  putative ribosomal protein L7Ae-like protein  37.88 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000000500453  decreased coverage  0.00000955735 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2339  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  33.82 
 
 		 86 aa  41.6  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000362211  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8686  predicted protein  31.34 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2726  50S ribosomal protein L7AE  29.76 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000168835  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0054  50S ribosomal protein L30e  31.4 
 
 		 95 aa  40.4  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0738724 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>