More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_4121 on replicon NC_013924
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013924  Nmag_4121  Glutamate--ammonia ligase  100 
 
 
433 aa  882    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3857  Glutamate--ammonia ligase  50.23 
 
 
461 aa  417  9.999999999999999e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261815  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3850  Glutamate--ammonia ligase  48.32 
 
 
453 aa  413  1e-114  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274285  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2380  Glutamate--putrescine ligase  33.79 
 
 
456 aa  225  1e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0068155  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0295  putative glutamine synthetase  31.83 
 
 
475 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4677  glutamine synthetase family protein  30.99 
 
 
456 aa  221  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00463  glutamine synthetase  32.88 
 
 
461 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.625789  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6419  glutamate--putrescine ligase  32.43 
 
 
444 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5914  glutamate--ammonia ligase  32.43 
 
 
444 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5549  glutamate--ammonia ligase  32.43 
 
 
444 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3517  glutamate--putrescine ligase  34.66 
 
 
445 aa  216  4e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.164982 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1031  L-glutamine synthetase  36.61 
 
 
444 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0199582  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1603  glutamate--ammonia ligase  34.69 
 
 
468 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0361504 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0350  glutamate--ammonia ligase  32.58 
 
 
455 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0380504  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3572  glutamate--putrescine ligase  31.9 
 
 
444 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.701465  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3247  glutamine synthetase  31.13 
 
 
458 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1181  L-glutamine synthetase  33.41 
 
 
451 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0728  glutamine synthetase catalytic domain  32.96 
 
 
444 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0636  glutamine synthetase catalytic domain  33.11 
 
 
444 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.961715  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2022  glutamine synthetase family protein  33.11 
 
 
444 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38140  putative glutamine synthetase  30.66 
 
 
458 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019966 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5091  glutamate--putrescine ligase  31.15 
 
 
458 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327313  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1340  Glutamate--putrescine ligase  32.66 
 
 
464 aa  213  7.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  34.1 
 
 
444 aa  212  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48880  glutamine synthetase  32.55 
 
 
458 aa  212  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2122  L-glutamine synthetase  31.54 
 
 
458 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0668807  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1107  glutamate--putrescine ligase  32.96 
 
 
445 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0907011  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0942  L-glutamine synthetase  32.72 
 
 
444 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.691188 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0279  glutamate--putrescine ligase  31.15 
 
 
458 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1130  glutamate--putrescine ligase  31.98 
 
 
449 aa  211  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0174  glutamate--putrescine ligase  31.78 
 
 
460 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1939  glutamate--putrescine ligase  31.12 
 
 
467 aa  210  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0199472  normal  0.0178394 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0972  glutamate--ammonia ligase  32.5 
 
 
449 aa  210  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00809428  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2006  Glutamate--putrescine ligase  32.3 
 
 
449 aa  210  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.349477  normal  0.804087 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4867  glutamate--ammonia ligase  32.44 
 
 
452 aa  210  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0918007  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5309  glutamine synthetase  32.44 
 
 
452 aa  209  6e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1093  glutamate--ammonia ligase  31.9 
 
 
451 aa  209  7e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.440027  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5347  glutamate--putrescine ligase  32.4 
 
 
460 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.107252 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5407  L-glutamine synthetase  32.66 
 
 
452 aa  208  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000279947 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1946  glutamine synthetase family protein  32.73 
 
 
444 aa  208  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0912905  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1060  glutamate--putrescine ligase  32.66 
 
 
449 aa  208  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0974728  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5914  glutamate--ammonia ligase  32.73 
 
 
445 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0341  L-glutamine synthetase  31.54 
 
 
459 aa  209  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0727612  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2163  glutamate--ammonia ligase  32.73 
 
 
445 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699868  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2181  glutamate--putrescine ligase  32.73 
 
 
445 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113907  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0825  glutamate--ammonia ligase  31.45 
 
 
456 aa  208  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.951182  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0387  glutamine synthetase  30.19 
 
 
458 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3148  glutamine synthetase, putative  31.91 
 
 
452 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5299  glutamine synthetase, putative  32.17 
 
 
460 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.802661  normal  0.238566 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5208  glutamate--putrescine ligase  32.4 
 
 
460 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179896  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1739  glutamate--putrescine ligase  33.03 
 
 
454 aa  207  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000378796 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2566  glutamate--putrescine ligase  31.91 
 
 
452 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2707  glutamate--putrescine ligase  31.91 
 
 
452 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210959  normal  0.606055 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5184  glutamine synthetase, putative  30.91 
 
 
458 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.92577  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2897  glutamate--putrescine ligase  31.24 
 
 
452 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2079  glutamate--putrescine ligase  32.51 
 
 
445 aa  207  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0114961  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3011  glutamate--ammonia ligase  30.58 
 
 
451 aa  207  4e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.858612  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0342  L-glutamine synthetase  32.66 
 
 
452 aa  206  5e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48860  putative glutamine synthetase  32.07 
 
 
453 aa  206  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467779  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2269  glutamate--ammonia ligase  32.45 
 
 
476 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0828356  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0161  L-glutamine synthetase  32.8 
 
 
475 aa  206  5e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.636195  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03860  putative glutamine synthetase  30.19 
 
 
458 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5244  glutamate--putrescine ligase  30.91 
 
 
458 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2201  glutamate--ammonia ligase  32.73 
 
 
445 aa  206  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3193  Glutamate--putrescine ligase  31.67 
 
 
451 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0866318  normal  0.0139402 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1107  glutamate--ammonia ligase  31.67 
 
 
451 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000899819  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1165  glutamate--putrescine ligase  31.67 
 
 
451 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184277  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1198  glutamate--putrescine ligase  31.67 
 
 
451 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000128825  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1455  glutamate--putrescine ligase  32.95 
 
 
440 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.171449  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4666  Glutamate--putrescine ligase  32.03 
 
 
444 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0945  glutamate--putrescine ligase  31.53 
 
 
449 aa  204  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3936  glutamate--putrescine ligase  32.24 
 
 
476 aa  203  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5408  L-glutamine synthetase  30.91 
 
 
458 aa  203  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532857  hitchhiker  0.00182517 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0538  glutamate--putrescine ligase  31.64 
 
 
446 aa  202  8e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1828  glutamine synthetase family protein  33.64 
 
 
456 aa  202  9e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1268  glutamine synthetase  31.45 
 
 
451 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5473  L-glutamine synthetase  32.05 
 
 
445 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.393385  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2711  glutamine synthetase catalytic domain  33.64 
 
 
444 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2919  L-glutamine synthetase  31.22 
 
 
451 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000934315  normal  0.778941 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3098  L-glutamine synthetase  31.22 
 
 
451 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000533566  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2864  glutamate--ammonia ligase  31.96 
 
 
459 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317185  normal  0.149371 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2788  glutamine synthetase family protein  33.64 
 
 
490 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289948  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2079  L-glutamine synthetase  30.13 
 
 
454 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3001  L-glutamine synthetase  31 
 
 
451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000079724  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3960  glutamate--putrescine ligase  33.03 
 
 
440 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2654  glutamine synthetase  33.41 
 
 
444 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0768  glutamine synthetase family protein  31.76 
 
 
476 aa  200  3e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.150739  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5310  glutamine synthetase  30.68 
 
 
458 aa  201  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3944  glutamate--putrescine ligase  32.42 
 
 
466 aa  201  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244314  normal  0.971464 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2644  glutamate--ammonia ligase  32.21 
 
 
451 aa  201  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.274474  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4259  L-glutamine synthetase  31.72 
 
 
447 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03880  glutamine synthetase  32.21 
 
 
452 aa  200  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5183  glutamine synthetase, putative  31.1 
 
 
452 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4868  glutamate--ammonia ligase  30.44 
 
 
458 aa  199  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5243  glutamate--putrescine ligase  31.1 
 
 
452 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.689829  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0389  glutamine synthetase  32.21 
 
 
452 aa  199  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2828  L-glutamine synthetase  30.02 
 
 
468 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0715  glutamine synthetase family protein  31.53 
 
 
476 aa  199  9e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1176  glutamine synthetase catalytic region  32.08 
 
 
486 aa  199  9e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34400  glutamine synthetase catalytic domain family protein  33.33 
 
 
446 aa  199  9e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>