23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2654 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2654  Elongator protein 3/MiaB/NifB  100 
 
 
366 aa  761    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0658  Elongator protein 3/MiaB/NifB  90.16 
 
 
365 aa  676    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2174  Radical SAM domain protein  76.5 
 
 
358 aa  589  1e-167  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1373  Elongator protein 3/MiaB/NifB  78.69 
 
 
364 aa  584  1e-166  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1428  Radical SAM domain protein  77.32 
 
 
358 aa  583  1.0000000000000001e-165  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0822  Radical SAM domain protein  39.07 
 
 
334 aa  247  3e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1179  hypothetical protein  38.51 
 
 
346 aa  241  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0057  hypothetical protein  39.71 
 
 
347 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0937  hypothetical protein  36.34 
 
 
329 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.263205  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1151  radical SAM domain-containing protein  40.48 
 
 
313 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1444  radical SAM domain-containing protein  38.42 
 
 
328 aa  209  5e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2148  Radical SAM domain protein  38.42 
 
 
328 aa  205  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1266  hypothetical protein  36.26 
 
 
324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.541114 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0046  radical SAM domain-containing protein  32.88 
 
 
358 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.405197  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1645  radical SAM domain-containing protein  31.22 
 
 
355 aa  188  1e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0580  radical SAM domain-containing protein  31.39 
 
 
355 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0256  radical SAM domain-containing protein  30.97 
 
 
355 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.959358  normal  0.0374147 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1409  Elongator protein 3/MiaB/NifB  35.76 
 
 
328 aa  182  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00449736  normal  0.39779 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0342  radical SAM domain-containing protein  30.53 
 
 
355 aa  176  6e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2308  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.77 
 
 
325 aa  139  6e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2957  radical SAM domain-containing protein  30.63 
 
 
322 aa  79  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.378786  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2071  Radical SAM domain protein  28.24 
 
 
322 aa  73.9  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2454  Radical SAM domain protein  26.91 
 
 
352 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  hitchhiker  0.0012286 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>