242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2089 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3651  tryptophanyl-tRNA synthetase  82.73 
 
 
412 aa  676    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2089  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
407 aa  814    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1490  tryptophanyl-tRNA synthetase  39 
 
 
370 aa  287  2e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.624592 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1431  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 
386 aa  280  3e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.494991  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1822  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 
374 aa  280  4e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1612  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 
374 aa  277  2e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0454  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 
379 aa  276  7e-73  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1666  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 
377 aa  275  9e-73  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2178  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.61 
 
 
381 aa  271  1e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.774939  hitchhiker  0.000339901 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53719  Cytoplasmic tryptophanyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 
424 aa  261  1e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0587  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 
386 aa  246  6e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1942  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 
383 aa  240  4e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32113  predicted protein  35.86 
 
 
484 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0250041 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40901  predicted protein  35.35 
 
 
405 aa  221  9.999999999999999e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00430  tryptophan-tRNA ligase, putative  36.05 
 
 
641 aa  219  6e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10475  tryptophanyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G01640)  32.71 
 
 
424 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0904  tryptophanyl-tRNA synthetase  30.56 
 
 
358 aa  188  2e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1485  tryptophanyl-tRNA synthetase  31.28 
 
 
361 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1817  tryptophanyl-tRNA synthetase  30 
 
 
358 aa  177  3e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1078  tryptophanyl-tRNA synthetase  30.28 
 
 
358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0839  tryptophanyl-tRNA synthetase  30.28 
 
 
357 aa  169  7e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.138022  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1369  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.4 
 
 
418 aa  138  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.916392  hitchhiker  0.0000028509 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0642  tryptophan--tRNA ligase  26.78 
 
 
418 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0656  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.16 
 
 
418 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.52588  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3620  tryptophanyl-tRNA synthetase  32.02 
 
 
542 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1694  Tryptophan--tRNA ligase  33.62 
 
 
570 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1425  tryptophanyl-tRNA synthetase  32.66 
 
 
435 aa  114  3e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.790608  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1863  tryptophanyl-tRNA synthetase  31.58 
 
 
534 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.397905  normal  0.0397289 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0665  tryptophanyl-tRNA synthetase  32.75 
 
 
540 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.383548  normal  0.528912 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1732  tryptophan--tRNA ligase  27.76 
 
 
422 aa  110  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1670  tryptophanyl-tRNA synthetase  30.66 
 
 
537 aa  105  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1426  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.64 
 
 
432 aa  96.7  7e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1374  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.82 
 
 
473 aa  96.3  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0368  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.85 
 
 
432 aa  94.7  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0571  Tryptophan--tRNA ligase  29.78 
 
 
417 aa  90.5  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0806588  normal  0.210937 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1300  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.46 
 
 
324 aa  81.3  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0874  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.57 
 
 
346 aa  79  0.0000000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08970  Tryptophanyl-tRNA synthetase  26.86 
 
 
333 aa  75.9  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1201  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.51 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0204  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.84 
 
 
340 aa  73.9  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2168  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.3 
 
 
341 aa  73.6  0.000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00044454  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0450  tryptophanyl-tRNA synthetase II  27.64 
 
 
342 aa  73.2  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.481954 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0440  tryptophanyl-tRNA synthetase II  27.69 
 
 
342 aa  72.4  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2157  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.32 
 
 
335 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108936 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1456  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.99 
 
 
335 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256847  normal  0.958171 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0058  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.77 
 
 
341 aa  68.9  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00653714  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2090  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.95 
 
 
342 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2528  tryptophanyl-tRNA synthetase II  27.57 
 
 
346 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1317  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.84 
 
 
348 aa  67.8  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0172213  normal  0.0239999 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2145  tryptophanyl-tRNA synthetase  25 
 
 
356 aa  67.4  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106152  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  25 
 
 
356 aa  67.4  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0230  tryptophanyl-tRNA synthetase II  27.57 
 
 
346 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3480  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.92 
 
 
331 aa  67  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000674679  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0956  tryptophanyl-tRNA synthetase II  27.57 
 
 
346 aa  67  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1993  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.19 
 
 
340 aa  67.4  0.0000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0015923  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0792  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.47 
 
 
325 aa  67  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00324527  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1413  tryptophanyl-tRNA synthetase II  27.57 
 
 
346 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.718903  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1609  tryptophanyl-tRNA synthetase II  27.57 
 
 
346 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2670  tryptophanyl-tRNA synthetase II  27.57 
 
 
346 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.552159  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0267  tryptophanyl-tRNA synthetase II  27.57 
 
 
346 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2482  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.43 
 
 
340 aa  66.6  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0501  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.89 
 
 
366 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2877  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.84 
 
 
348 aa  65.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0020  tryptophan--tRNA ligase  27.41 
 
 
363 aa  65.9  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.15256 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.17 
 
 
328 aa  66.2  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.17 
 
 
328 aa  66.2  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1856  tryptophanyl-tRNA synthetase II  27.21 
 
 
339 aa  65.9  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1687  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.93 
 
 
326 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0957395  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0406  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.65 
 
 
342 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175639  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0765  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.94 
 
 
330 aa  65.1  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal  0.580666 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003890  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.58 
 
 
340 aa  64.7  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1800  tryptophanyl-tRNA synthetase II  27.96 
 
 
341 aa  64.7  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1247  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.18 
 
 
360 aa  63.9  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.258523  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5680  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.75 
 
 
337 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882251  normal  0.353927 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1393  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.85 
 
 
363 aa  64.3  0.000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0201  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.3 
 
 
346 aa  63.5  0.000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.231145 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2250  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.6 
 
 
327 aa  63.2  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000268792  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1833  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.84 
 
 
327 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.985699  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0512  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.89 
 
 
346 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2236  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.24 
 
 
340 aa  62.4  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.139935  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14880  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.55 
 
 
349 aa  62.4  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00197202  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6431  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.43 
 
 
337 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7191  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.21 
 
 
342 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1133  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.89 
 
 
330 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1044  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.97 
 
 
331 aa  61.2  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1960  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.09 
 
 
328 aa  61.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000535382  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0579  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.86 
 
 
355 aa  61.6  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1406  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.23 
 
 
335 aa  61.2  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.92 
 
 
321 aa  60.5  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130405  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1413  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.11 
 
 
337 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6416  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.11 
 
 
337 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.859169 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7076  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.11 
 
 
337 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.478137 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1919  tryptophanyl-tRNA synthetase  25 
 
 
337 aa  60.5  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00690514  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.04 
 
 
344 aa  60.5  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00178071  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2298  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.19 
 
 
327 aa  60.1  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2364  tryptophanyl-tRNA synthetase II  24.59 
 
 
333 aa  59.7  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.925711 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0032  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.4 
 
 
329 aa  59.7  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1925  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.77 
 
 
327 aa  59.7  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1154  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.39 
 
 
323 aa  59.7  0.00000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.63 
 
 
342 aa  59.3  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>