40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0770 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0770  Phage protein D-like protein  100 
 
 		 341 aa  694    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.737587  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0982  hypothetical protein  27.92 
 
 		 362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  29.96 
 
 		 593 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1508  phage protein D  25.76 
 
 		 348 aa  99.8  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4347  hypothetical protein  26.25 
 
 		 393 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.21518  normal  0.0759441 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  26.67 
 
 		 589 aa  87  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  24.5 
 
 		 587 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3664  hypothetical protein  27.39 
 
 		 360 aa  83.2  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000879822 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1869  hypothetical protein  24.61 
 
 		 406 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5384  Rhs element Vgr protein  25 
 
 		 602 aa  76.6  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  22.64 
 
 		 592 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1954  Phage protein D-like protein  22.74 
 
 		 407 aa  75.1  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  24.1 
 
 		 610 aa  72.4  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5250  Rhs element Vgr protein  23.96 
 
 		 596 aa  70.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1906  Rhs element Vgr protein  23.83 
 
 		 606 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194585  hitchhiker  0.0014616 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  20.9 
 
 		 641 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3155  Rhs element Vgr protein  22.22 
 
 		 581 aa  67  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2945  Rhs element Vgr protein  23.61 
 
 		 589 aa  67  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703955  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0753  phage late control gene D protein GPD  25.55 
 
 		 480 aa  67  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.514992  normal  0.317434 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  23.21 
 
 		 589 aa  62.4  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3609  Rhs element Vgr protein  30.05 
 
 		 574 aa  62  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0662  putative phage late control gene D protein  23.28 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0676  Rhs element Vgr protein  20.61 
 
 		 596 aa  60.5  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0852  putative phage late control gene D protein  23.58 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  20.81 
 
 		 589 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3822  phage protein D-like  23 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0369  Rhs element Vgr protein  21.68 
 
 		 596 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3042  hypothetical protein  23.97 
 
 		 361 aa  53.9  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000069589 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3003  Rhs element Vgr protein  22.03 
 
 		 598 aa  53.5  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1051  Rhs element Vgr protein  24 
 
 		 594 aa  53.1  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3822  Rhs element Vgr protein  24.91 
 
 		 578 aa  53.5  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0938  Phage protein D-like  22.51 
 
 		 427 aa  53.1  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0367858  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1883  Phage protein D-like  21.09 
 
 		 427 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109131  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1042  phosphoserine phosphatase SerB  22.01 
 
 		 565 aa  50.4  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0669  Rhs element Vgr protein  19.45 
 
 		 576 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3927  Rhs element Vgr protein  20.89 
 
 		 604 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00332693  hitchhiker  0.00450013 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2289  phage late control D family protein  25.17 
 
 		 384 aa  47  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.775888  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1080  hypothetical protein  20 
 
 		 599 aa  44.7  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.752206 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1749  hypothetical protein  21.45 
 
 		 384 aa  44.3  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.698415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4390  Rhs element Vgr protein  19.52 
 
 		 652 aa  42.7  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.86257  normal  0.698434 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>