More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0944 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0944  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 131 aa  264  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0892  ArsR family transcriptional regulator  90.84 
 
 		 131 aa  234  3e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2699  transcriptional regulator, ArsR family  52.94 
 
 		 142 aa  100  9e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1791  ArsR family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 96 aa  77  0.00000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3751  transcriptional regulator, ArsR family  42.39 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  48.31 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3740  ArsR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  43.01 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  43.48 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 116 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0357  transcriptional regulator, ArsR family  53.97 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.175794 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1182  regulatory protein, ArsR  40.38 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  42.22 
 
 		 102 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0018  regulatory protein, ArsR  42.22 
 
 		 102 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413678  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  41.94 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0018  transcriptional regulator, ArsR family protein  48.68 
 
 		 101 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.591177  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  42.7 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1306  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.680406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  42.53 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  43.82 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 101 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0026  ArsR family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 102 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0793  regulatory protein, ArsR  49.3 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0023  ArsR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 102 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000124872  hitchhiker  0.000733869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0021  ArsR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 102 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000364753  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0025  ArsR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 101 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0029  ArsR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 102 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000481298  hitchhiker  0.000000745632 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0037  ArsR family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 102 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0021  regulatory protein ArsR  47.37 
 
 		 102 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00282375  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  43.02 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0025  ArsR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 102 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00398711  normal  0.0110166 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0026  regulatory protein, ArsR  47.37 
 
 		 102 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000871967  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0025  transcriptional regulator, ArsR family  47.37 
 
 		 102 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111257  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1486  ArsR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1488  ArsR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1510  ArsR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0961  regulatory protein, ArsR  48 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1589  ArsR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 115 aa  67  0.00000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.000194684  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3459  ArsR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 112 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1532  ArsR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 115 aa  67  0.00000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  40.66 
 
 		 107 aa  67  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000101  transcriptional regulator ArsR family  37.08 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344497  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3239  transcriptional regulator, ArsR family  46.84 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00078895  normal  0.52452 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 101 aa  66.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3538  transcriptional regulator HlyU  46.84 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1050  regulatory protein, ArsR  46.84 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000242354  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1055  regulatory protein, ArsR  46.84 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584265  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1884  ArsR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1117  regulatory protein ArsR  46.84 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000362609  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0020  regulatory protein, ArsR  46.15 
 
 		 101 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1580  regulatory protein ArsR  38.71 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0014541  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2961  ArsR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318119  normal  0.703465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3043  ArsR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000176438  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1151  ArsR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000355977  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3141  ArsR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177762  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01281  transcriptional regulator, ArsR family protein  48.53 
 
 		 87 aa  65.1  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000457227  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2105  ArsR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  43.68 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0920  transcriptional regulator HlyU  40 
 
 		 98 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000331953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1286  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1287  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 98 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000165957  normal  0.329148 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4035  ArsR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.137887 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1742  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11027 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3631  transcriptional regulator of ArsR family protein  34 
 
 		 103 aa  64.3  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2894  transcriptional regulator, ArsR family protein  43.53 
 
 		 98 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0578791  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1085  ArsR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 115 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0694077  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3640  transcriptional regulator, ArsR family  40.66 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5676  ArsR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004423  transcriptional activator HlyU  39.51 
 
 		 100 aa  63.5  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000188739  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3554  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 94 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3285  transcriptional regulator ArsR family  39.77 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2727  regulatory protein, ArsR  44.3 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000369896  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1937  ArsR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1190  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00010661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0024  ArsR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 101 aa  62.8  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000555304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1900  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 115 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428282  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0445  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 115 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0937  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 115 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0359  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 115 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2606  ArsR family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  38.82 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1264  regulatory protein, ArsR  46.75 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1527  regulatory protein ArsR  45.78 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1814  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 115 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.978602  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0202  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 115 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2812  transcriptional regulator  47.3 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.158239 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1095  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000620503  normal  0.070685 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>