28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0666 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0666  Zinc finger/thioredoxin putative  100 
 
 		 284 aa  580  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.248868  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0575  hypothetical protein  72.32 
 
 		 285 aa  409  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5219  MJ0042 family finger-like protein  52.94 
 
 		 298 aa  295  7e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0833  Zinc finger/thioredoxin putative  51.33 
 
 		 293 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0939857  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0942  Zinc finger/thioredoxin putative  50.34 
 
 		 293 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1175  hypothetical protein  51.34 
 
 		 306 aa  281  6.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4868  Zinc finger/thioredoxin putative  51.77 
 
 		 306 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186444  normal  0.75995 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1596  Zinc finger-domain-containing protein  32.21 
 
 		 318 aa  126  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889508 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3088  MJ0042 family finger-like protein  40.16 
 
 		 251 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.148898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2979  Zinc finger-domain-containing protein  30.22 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0278166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2862  Zinc finger-domain-containing protein  39.37 
 
 		 273 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3216  Zinc finger-domain-containing protein  26.47 
 
 		 308 aa  90.1  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639596  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1155  MJ0042 family finger-like protein  42.37 
 
 		 237 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.967228  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2196  Zinc finger-domain-containing protein  42.86 
 
 		 236 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal  0.693925 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2373  Zinc finger-domain-containing protein  24.54 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2982  MJ0042 family finger-like protein  54.29 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0702  Zinc finger/thioredoxin putative  54.29 
 
 		 294 aa  50.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2893  Zinc finger/thioredoxin putative  51.43 
 
 		 254 aa  47.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0057  zinc finger-like domain-containing protein  43.59 
 
 		 221 aa  47.4  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0030  hypothetical protein  30.39 
 
 		 221 aa  47.4  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1855  MJ0042 family finger-like protein  45.71 
 
 		 383 aa  46.6  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0454  MJ0042 family finger-like protein  32.43 
 
 		 1163 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.75357  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3253  hypothetical protein  29.55 
 
 		 361 aa  45.8  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2134  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0453  MJ0042 family finger-like protein  32.43 
 
 		 1144 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13216  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0425  zinc finger/thioredoxin putative  42.86 
 
 		 1139 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4144  Zinc finger-domain-containing protein  36 
 
 		 1124 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000494225 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0479  Zinc finger/thioredoxin putative  40 
 
 		 274 aa  42.7  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2015  Zinc finger-domain-containing protein  28.57 
 
 		 538 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>