56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3645 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3645  ThiJ/PfpI domain protein  100 
 
 
210 aa  417  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.415005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2155  ThiJ/PfpI domain protein  65.13 
 
 
206 aa  237  9e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.663488 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4040  ThiJ/PfpI domain-containing protein  55.88 
 
 
204 aa  232  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00474505 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4072  ThiJ/PfpI domain protein  56.28 
 
 
202 aa  214  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2512  ThiJ/PfpI domain-containing protein  55.34 
 
 
210 aa  195  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0353  ThiJ/PfpI family intracellular protease  40.98 
 
 
208 aa  154  9e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2402  ThiJ/PfpI family protein  39.81 
 
 
210 aa  149  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247507  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2564  ThiJ/PfpI domain protein  42.65 
 
 
241 aa  147  8e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2291  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.51 
 
 
210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2690  thiJ/pfpI family protein  38.83 
 
 
210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0560939  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1842  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.49 
 
 
210 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000198171  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2475  thiJ/pfpI family protein  39.32 
 
 
210 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0918447  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2657  thiJ/pfpI family protein  39.32 
 
 
210 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2761  intracellular protease, ThiJ/PfpI family  39.13 
 
 
210 aa  143  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000853116 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2674  thiJ/pfpI family protein  39.32 
 
 
210 aa  142  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000490961 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0808  hypothetical protein  38.73 
 
 
212 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0613727 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0569  ThiJ/PfpI domain protein  42.5 
 
 
212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1340  ThiJ/PfpI  37.89 
 
 
208 aa  109  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1843  ThiJ/PfpI domain protein  29.9 
 
 
190 aa  104  8e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04597  DJ-1/PfpI family  35.14 
 
 
192 aa  82.8  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0833  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  27.12 
 
 
196 aa  66.2  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000524755  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3342  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.57 
 
 
190 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000897289  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1791  thiJ/pfpI family protein  25 
 
 
194 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3715  thiJ/pfpI family protein  28.35 
 
 
190 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000105676  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1648  thiJ/pfpI family protein  24.32 
 
 
194 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3408  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  28.35 
 
 
190 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163373  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3445  thiJ/pfpI family protein  28.35 
 
 
190 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000555251  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1529  thiJ/pfpI family protein  24.32 
 
 
194 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.695646  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3290  DJ-1 family protein  33.1 
 
 
184 aa  52.8  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3664  DJ-1/PfpI family protein  28.35 
 
 
151 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1492  intracellular protease/amidase  22.1 
 
 
194 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.882955  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1501  thiJ/PfpI family protein  23.65 
 
 
194 aa  51.6  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000524776  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3678  ThiJ/PfpI  36.84 
 
 
196 aa  51.6  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3688  thiJ/pfpI family protein  27.56 
 
 
190 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000554437  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2090  ThiJ/PfpI domain protein  24.72 
 
 
192 aa  51.2  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.117884  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  22.53 
 
 
189 aa  50.1  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00863935  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3763  thiJ/pfpI family protein  25.2 
 
 
190 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00017711  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3357  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  26.56 
 
 
186 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000501015  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0803  DJ-1 family protein  30.46 
 
 
182 aa  50.4  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1553  thiJ/pfpI family protein  28.93 
 
 
190 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454916  normal  0.0345603 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3165  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.53 
 
 
191 aa  48.9  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3683  thiJ/pfpI family protein  26.52 
 
 
190 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00698458  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1101  DJ-1 family protein  28.57 
 
 
182 aa  48.1  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1118  DJ-1 family protein  32 
 
 
190 aa  47.8  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2740  transcriptional activator FtrA  29.11 
 
 
317 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2119  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 
388 aa  46.6  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0158071  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1245  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  30.87 
 
 
284 aa  46.6  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0468502  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2955  transcriptional regulator, AraC family  29.11 
 
 
317 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.012422  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 
325 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  29.37 
 
 
331 aa  45.1  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0946  DJ-1 family protein  32.61 
 
 
187 aa  44.3  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.892246  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1208  DJ-1 family protein  28.79 
 
 
188 aa  42.7  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3593  AraC family transcriptional regulator  40.62 
 
 
342 aa  42  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  31.91 
 
 
358 aa  41.6  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0523  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  29.76 
 
 
203 aa  41.6  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.017348  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0681  DJ-1 family protein  29.76 
 
 
203 aa  41.6  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728078  normal  0.0428535 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>