19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2125 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2125  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 425 aa  795    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1049  hypothetical protein  52.75 
 
 		 428 aa  301  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0105777 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2558  major facilitator transporter  51.23 
 
 		 414 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653406  hitchhiker  0.0000197888 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0307  major facilitator superfamily MFS_1  44.84 
 
 		 414 aa  229  5e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3520  major facilitator superfamily MFS_1  38.31 
 
 		 434 aa  182  8.000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0263  major facilitator superfamily MFS_1  43.9 
 
 		 367 aa  164  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1343  putative transport protein  41.22 
 
 		 374 aa  124  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2156  major facilitator transporter  28.28 
 
 		 409 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06042  hypothetical protein  32.09 
 
 		 310 aa  62  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3395  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 		 408 aa  56.2  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0631  major facilitator superfamily MFS_1  24.04 
 
 		 402 aa  53.9  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0094  major facilitator transporter  20.54 
 
 		 406 aa  52  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0031083  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3544  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 		 406 aa  51.2  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0235  major facilitator superfamily MFS_1  34.56 
 
 		 424 aa  49.7  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0869  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 445 aa  49.3  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.422831  normal  0.558623 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1915  major facilitator superfamily permease  26.8 
 
 		 389 aa  48.1  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.488655  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0600  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 		 411 aa  44.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2349  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 399 aa  44.3  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3861  major facilitator transporter  24.76 
 
 		 426 aa  43.9  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00863555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>