More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4980 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4980  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  100 
 
 
369 aa  722    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0353  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  52.51 
 
 
383 aa  334  1e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0142166 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0592  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  56.63 
 
 
328 aa  333  3e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8332  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  54.83 
 
 
325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328047  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4264  phosphate ABC transporter permease  53.47 
 
 
347 aa  311  7.999999999999999e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2934  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstC  55.37 
 
 
326 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8262  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  50.32 
 
 
694 aa  296  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735974  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2741  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  53.25 
 
 
320 aa  293  5e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0392833  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4379  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  51.97 
 
 
320 aa  286  5e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4649  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  49.84 
 
 
318 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0092  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  49.83 
 
 
332 aa  271  1e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.902581  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31860  phosphate ABC transporter membrane protein  46.47 
 
 
327 aa  269  5e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3425  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.53 
 
 
325 aa  269  7e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0659  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  48.68 
 
 
336 aa  268  1e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.825746  hitchhiker  0.000295634 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0203  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  49.84 
 
 
310 aa  266  5.999999999999999e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0363  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  48.87 
 
 
310 aa  264  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37630  phosphate ABC transporter membrane protein  48.39 
 
 
314 aa  263  4.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.158089 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3925  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.73 
 
 
344 aa  258  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01620  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  47.91 
 
 
319 aa  258  1e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6820  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.81 
 
 
352 aa  258  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2081  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  48.89 
 
 
353 aa  254  2.0000000000000002e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.601728  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25610  phosphate ABC transporter membrane protein  44.13 
 
 
320 aa  249  5e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0166325  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0457  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.71 
 
 
373 aa  249  6e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2967  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  50 
 
 
330 aa  248  1e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4262  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.66 
 
 
312 aa  246  6e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06950  phosphate ABC transporter membrane protein  44.54 
 
 
326 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0915  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.59 
 
 
335 aa  241  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4901  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.79 
 
 
349 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2963  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  48.63 
 
 
331 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4518  phosphate ABC transporter permease  44.79 
 
 
349 aa  239  5e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4605  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.79 
 
 
349 aa  239  5e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0222  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  44.22 
 
 
334 aa  238  1e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10947  phosphate-transport system integral membrane ABC transporter pstC2  44.59 
 
 
324 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1662  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.93 
 
 
322 aa  228  9e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.334683  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3542  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.83 
 
 
348 aa  228  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0874  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.16 
 
 
328 aa  226  3e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.524714  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7663  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.56 
 
 
339 aa  226  6e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1071  phosphate ABC transporter permease  42.67 
 
 
317 aa  220  3e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5091  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.61 
 
 
322 aa  219  7e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.359495  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2216  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstC  40.54 
 
 
324 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100122  normal  0.140551 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00542  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  39.94 
 
 
324 aa  200  3.9999999999999996e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0417223  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1796  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40 
 
 
325 aa  199  6e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00856556  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5388  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.35 
 
 
335 aa  199  6e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.730152 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1283  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.02 
 
 
324 aa  199  7.999999999999999e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1347  ABC transporter phosphate permease  39.02 
 
 
324 aa  199  7.999999999999999e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.225213  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1310  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.06 
 
 
322 aa  197  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.648336  normal  0.22532 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2559  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.44 
 
 
324 aa  196  7e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00389867  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1517  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.44 
 
 
324 aa  196  7e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1333  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.78 
 
 
325 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282843  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1720  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.95 
 
 
336 aa  192  6e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000175747  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2503  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.05 
 
 
336 aa  192  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0838  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.38 
 
 
329 aa  191  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0428557 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3270  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.93 
 
 
331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.263457  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2684  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.09 
 
 
305 aa  188  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.070579  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3294  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.28 
 
 
322 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2829  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.28 
 
 
322 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.594709  normal  0.637207 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1851  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.69 
 
 
334 aa  187  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2478  phosphate ABC transporter permease  37.38 
 
 
316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5253  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.6 
 
 
324 aa  184  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0650  phosphate ABC transporter permease  38.63 
 
 
337 aa  183  4.0000000000000006e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0147  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3538  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.83 
 
 
328 aa  183  4.0000000000000006e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.590785  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4515  phosphate ABC transporter permease  38.8 
 
 
342 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3409  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.33 
 
 
328 aa  183  5.0000000000000004e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.222291 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5181  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.58 
 
 
324 aa  181  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.886508 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0727  phosphate ABC transporter permease  31.66 
 
 
315 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.127565  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4714  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.58 
 
 
324 aa  181  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.332449 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1273  phosphate transport system permease protein  35.96 
 
 
340 aa  182  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.588439 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4170  phosphate transporter permease subunit PstC  37.7 
 
 
318 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4196  phosphate transporter permease subunit PstC  37.7 
 
 
318 aa  181  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.319484  normal  0.0245807 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4232  phosphate transporter permease subunit PstC  37.7 
 
 
318 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.691548  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07751  putative phosphate ABC transporter  31.66 
 
 
315 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.588684  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4187  phosphate transporter permease subunit PstC  37.17 
 
 
319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4137  phosphate transporter permease subunit PstC  37.17 
 
 
319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.293082  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4081  phosphate transporter permease subunit PstC  37.17 
 
 
319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4065  phosphate transporter permease subunit PstC  37.17 
 
 
319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.132116  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4244  phosphate transporter permease subunit PstC  37.17 
 
 
319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.812613  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07751  putative phosphate ABC transporter  31.66 
 
 
315 aa  180  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08661  putative phosphate ABC transporter  30.72 
 
 
315 aa  179  9e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0507  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  36.76 
 
 
341 aa  179  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.54837 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0582  phosphate ABC transporter permease  37.85 
 
 
343 aa  178  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0697516  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1154  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.34 
 
 
341 aa  178  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1437  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  39.34 
 
 
325 aa  177  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177965  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03611  phosphate transporter subunit  36.84 
 
 
319 aa  176  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4240  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.84 
 
 
319 aa  176  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3942  phosphate transporter permease subunit PstC  36.84 
 
 
319 aa  176  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4238  phosphate transporter permease subunit PstC  36.84 
 
 
319 aa  176  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4267  phosphate transporter permease subunit PstC  36.84 
 
 
319 aa  176  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.879292  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5156  phosphate transporter permease subunit PstC  36.84 
 
 
319 aa  176  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.558018 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0481  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstC  39.02 
 
 
325 aa  176  4e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4201  phosphate transporter permease subunit PstC  36.84 
 
 
319 aa  176  4e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03555  hypothetical protein  36.84 
 
 
319 aa  176  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1530  phosphate transporter permease subunit PstC  38.31 
 
 
321 aa  176  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22156  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2184  phosphate transporter permease subunit PstC  38.39 
 
 
321 aa  176  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.184456  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2312  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.8 
 
 
359 aa  176  7e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.310759  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1137  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  37.22 
 
 
325 aa  176  7e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0475  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.16 
 
 
302 aa  176  7e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4091  phosphate transporter permease subunit PstC  36.48 
 
 
319 aa  176  7e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.541621 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6689  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.96 
 
 
324 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2974  phosphate ABC transporter inner membrane protein  35.03 
 
 
354 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0819  phosphate ABC transporter permease  39.81 
 
 
315 aa  175  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>