45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1373 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1373  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 		 76 aa  156  7e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.150452  normal  0.608201 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5834  phage transcriptional regulator, AlpA  63.64 
 
 		 78 aa  97.1  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1213  DNA binding domain-containing protein  62.32 
 
 		 81 aa  94  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.134195  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0771  putative transcriptional regulator  60.87 
 
 		 78 aa  90.9  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707589  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2321  DNA binding domain protein, excisionase family  74.58 
 
 		 74 aa  90.5  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.842741  hitchhiker  0.0000766281 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20560  hypothetical protein  61.9 
 
 		 79 aa  85.5  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0975  DNA binding domain-containing protein  57.97 
 
 		 76 aa  84.3  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.339599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1818  DNA binding domain protein, excisionase family  58.73 
 
 		 71 aa  84  7e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1754  DNA binding domain-containing protein  61.54 
 
 		 79 aa  82.8  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.988357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0912  excision promoter, Xis  56.52 
 
 		 76 aa  82  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.5021 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2433  DNA binding domain protein, excisionase family  58.73 
 
 		 71 aa  79.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0216773 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08700  DNA-binding protein, excisionase family  61.02 
 
 		 76 aa  79  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.687814 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3803  putative transcriptional regulator  61.4 
 
 		 75 aa  79.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0056722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2702  DNA binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 71 aa  77.8  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265646  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1256  DNA binding domain protein, excisionase family  63.64 
 
 		 69 aa  77.8  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0879674 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14660  DNA-binding protein, excisionase family  57.81 
 
 		 74 aa  77  0.00000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4273  DNA binding domain protein, excisionase family  63.79 
 
 		 91 aa  76.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.156451  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2501  Prophage CP4-57 regulatory  63.16 
 
 		 69 aa  74.7  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4404  DNA binding domain-containing protein  54.1 
 
 		 96 aa  67  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00533805  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4229  DNA binding domain-containing protein  49.18 
 
 		 96 aa  63.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0000299969  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4635  DNA binding domain protein, excisionase family  48.28 
 
 		 98 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0413  DNA binding domain-containing protein  37.93 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229992 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0612  phage transcriptional regulator, AlpA  36.21 
 
 		 66 aa  47  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274045  normal  0.0916726 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0343  DNA binding domain-containing protein  36.21 
 
 		 69 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.683411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8339  excision promoter, Xis  37.04 
 
 		 74 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4353  putative transcriptional regulator  37.93 
 
 		 74 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0244  DNA binding domain-containing protein  32.76 
 
 		 85 aa  44.3  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00265398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0484  DNA binding domain-containing protein  31.58 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111356  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2780  phage transcriptional regulator, AlpA  38.18 
 
 		 57 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0923797  normal  0.386289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0537  hypothetical protein  37.04 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3301  phage transcriptional regulator, AlpA  37.74 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4450  DNA binding domain protein, excisionase family  37.04 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6742  DNA binding domain protein, excisionase family  37.74 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0912  DNA binding domain protein, excisionase family  35.19 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4589  DNA binding domain protein, excisionase family  33.33 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02760  DNA-binding protein, excisionase family  37.04 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1237  putative transcriptional regulator  32.14 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3099  excision promoter, Xis  31.58 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5764  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  32.73 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0251  excisionase family DNA binding domain-containing protein  35.19 
 
 		 67 aa  42.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1004  DNA binding domain protein, excisionase family  31.58 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0271  excisionase/Xis, DNA-binding  39.29 
 
 		 139 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000397414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3263  excision promoter, Xis  34.62 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0661  DNA binding domain protein, excisionase family  29.82 
 
 		 80 aa  40.8  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1200  excisionase/Xis, DNA-binding  34.69 
 
 		 98 aa  40.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00000791415  normal  0.674457 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>