70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1268 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1268  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  570  1e-161  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0354701  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0317  alpha/beta hydrolase fold protein  61.59 
 
 
288 aa  332  5e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.439503  hitchhiker  0.00517721 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4785  alpha/beta hydrolase fold protein  52.28 
 
 
289 aa  272  4.0000000000000004e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.213395 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2980  alpha/beta hydrolase fold protein  52.63 
 
 
295 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0121  hypothetical protein  48.61 
 
 
287 aa  230  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0251  alpha/beta hydrolase fold protein  45.64 
 
 
287 aa  212  5.999999999999999e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.799554 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5099  alpha/beta hydrolase fold protein  41.46 
 
 
277 aa  157  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1562  alpha/beta hydrolase fold protein  39.73 
 
 
281 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0424412  normal  0.113898 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4947  putative hydrolase  40.34 
 
 
283 aa  149  7e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3267  alpha/beta hydrolase fold protein  37.24 
 
 
277 aa  138  8.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.251524  normal  0.03966 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3694  ab hydrolase, alpha/beta hydrolase fold protein  38.26 
 
 
285 aa  116  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.110664 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1274  alpha/beta hydrolase fold protein  34.75 
 
 
297 aa  113  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.576034  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6037  hypothetical protein  34.96 
 
 
273 aa  108  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6963  ab hydrolase, alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
282 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.931194  normal  0.108228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0526  alpha/beta hydrolase fold protein  31.66 
 
 
280 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.375875  normal  0.273636 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0153  hydrolase  27.11 
 
 
278 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0155  alpha/beta fold family hydrolase  26.74 
 
 
269 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0161  hypothetical protein  26.74 
 
 
269 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0160  hypothetical protein  26.74 
 
 
269 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0182  hypothetical protein  26.74 
 
 
269 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0204  hypothetical protein  26.39 
 
 
269 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0078  ab hydrolase, alpha/beta hydrolase fold protein  27.74 
 
 
282 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2603  alpha/beta hydrolase fold  32.75 
 
 
276 aa  62.8  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2657  alpha/beta hydrolase fold  32.75 
 
 
276 aa  62.8  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1731  alpha/beta hydrolase fold  46.38 
 
 
251 aa  53.5  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4189  alpha/beta hydrolase fold protein  31.48 
 
 
281 aa  53.1  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1592  alpha/beta hydrolase fold  44.58 
 
 
267 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121533  normal  0.0764642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8266  alpha/beta hydrolase fold-1  35.25 
 
 
267 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0277486 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1808  hypothetical protein  31.67 
 
 
219 aa  50.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  37.37 
 
 
277 aa  49.3  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  24.24 
 
 
282 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  30.51 
 
 
270 aa  46.6  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 
283 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1807  hypothetical protein  27.35 
 
 
319 aa  46.2  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  27.45 
 
 
334 aa  45.8  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1808  hypothetical protein  27.35 
 
 
319 aa  45.8  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5612  alpha/beta hydrolase fold  40.26 
 
 
311 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00676484  hitchhiker  0.00203627 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  32.18 
 
 
304 aa  45.8  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4943  alpha/beta hydrolase fold  29.44 
 
 
290 aa  45.8  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2671  haloalkane dehalogenase  32.14 
 
 
302 aa  45.8  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.731283  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  23.91 
 
 
282 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  34.23 
 
 
296 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2698  alpha/beta hydrolase fold  36.94 
 
 
306 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.705965  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  32.41 
 
 
280 aa  45.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 
330 aa  45.4  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  35.25 
 
 
278 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5868  alpha/beta hydrolase fold protein  29.6 
 
 
281 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.139447 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2742  alpha/beta hydrolase fold  36.94 
 
 
306 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  31.21 
 
 
260 aa  45.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1826  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 
285 aa  44.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363916  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8768  putative hydrolase  36.22 
 
 
272 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  35.92 
 
 
265 aa  44.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1534  lipolytic enzyme  31.45 
 
 
294 aa  44.3  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.277395  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37050  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  39.44 
 
 
285 aa  43.9  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3071  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
290 aa  43.9  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.357729  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2728  alpha/beta hydrolase fold  37.14 
 
 
275 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.629642  normal  0.292016 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11929  lignin peroxidase lipJ  32.38 
 
 
462 aa  43.5  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.831009  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  29.73 
 
 
317 aa  43.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0934  alpha/beta hydrolase fold  32.46 
 
 
266 aa  43.1  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.570173  hitchhiker  0.00160688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8373  proline iminopeptidase  38.27 
 
 
284 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  28.31 
 
 
282 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2011  proline iminopeptidase  31.31 
 
 
321 aa  43.1  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0118869  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8637  alpha/beta hydrolase fold protein  27.72 
 
 
370 aa  43.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  0.751963 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3723  alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 
281 aa  43.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0906881  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0850  prolyl aminopeptidase  28.83 
 
 
313 aa  42.7  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  26.54 
 
 
272 aa  43.1  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1844  alpha/beta hydrolase fold  40.7 
 
 
276 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719774  normal  0.0141832 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2459  alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 
287 aa  42.7  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.664427  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1381  alpha/beta hydrolase fold protein  34.58 
 
 
277 aa  42.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  30.63 
 
 
302 aa  42.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>