More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2660 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2660  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  100 
 
 
315 aa  631  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3747  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  96.19 
 
 
315 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67324  normal  0.0274086 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2363  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  88.85 
 
 
316 aa  548  1e-155  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0607904  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2410  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  88.85 
 
 
316 aa  548  1e-155  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2404  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  88.85 
 
 
316 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11409  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  84.09 
 
 
319 aa  529  1e-149  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.098973  normal  0.197941 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2585  aspartate carbamoyltransferase  80.32 
 
 
318 aa  503  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2336  aspartate carbamoyltransferase  76.45 
 
 
316 aa  482  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.52271  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15550  aspartate carbamoyltransferase  71.79 
 
 
310 aa  459  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.824951  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5245  aspartate carbamoyltransferase  72.35 
 
 
311 aa  434  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.465856  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3136  aspartate carbamoyltransferase  67.1 
 
 
306 aa  419  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.604866  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3150  aspartate carbamoyltransferase  66.78 
 
 
309 aa  410  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.987909  hitchhiker  0.000518906 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3015  aspartate carbamoyltransferase  65.26 
 
 
313 aa  409  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00265688  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2401  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  64.52 
 
 
328 aa  405  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442258  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4279  aspartate carbamoyltransferase  64.71 
 
 
312 aa  401  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1301  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  66.67 
 
 
323 aa  403  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276181  normal  0.0170425 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1352  aspartate carbamoyltransferase  64.94 
 
 
311 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0159083 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1054  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  65.58 
 
 
313 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.38137  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3105  aspartate carbamoyltransferase  65.37 
 
 
302 aa  397  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.178757  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2805  Aspartate carbamoyltransferase  64.21 
 
 
310 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1706  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  63.67 
 
 
309 aa  393  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2428  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  62.66 
 
 
324 aa  391  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3202  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  62.14 
 
 
318 aa  384  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0897828  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1853  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  61.34 
 
 
308 aa  374  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.822345  normal  0.502816 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1846  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  61.34 
 
 
308 aa  371  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258176  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3005  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  61.64 
 
 
323 aa  370  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.290399 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1708  aspartate carbamoyltransferase  59.94 
 
 
335 aa  366  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116774  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2034  aspartate carbamoyltransferase  59.87 
 
 
332 aa  363  2e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0341419 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12620  aspartate carbamoyltransferase  58.01 
 
 
327 aa  355  3.9999999999999996e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0895444  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1325  aspartate carbamoyltransferase  57.36 
 
 
333 aa  353  2e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.358229 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2003  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  58.28 
 
 
342 aa  353  2e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000182057 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17960  aspartate carbamoyltransferase  57.61 
 
 
349 aa  352  7e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2266  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  58.66 
 
 
337 aa  350  1e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1842  aspartate carbamoyltransferase  58.28 
 
 
351 aa  350  2e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.553475  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12660  aspartate carbamoyltransferase  59.03 
 
 
319 aa  347  1e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0228481 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14730  aspartate carbamoyltransferase  56.7 
 
 
320 aa  342  5e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.41124  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1681  aspartate carbamoyltransferase  53.99 
 
 
312 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1305  aspartate carbamoyltransferase  50.81 
 
 
306 aa  308  5.9999999999999995e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00032948  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1615  aspartate carbamoyltransferase  52.1 
 
 
313 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0602203  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0370  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.99 
 
 
307 aa  307  1.0000000000000001e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0685539  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4019  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.33 
 
 
312 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00788568  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1173  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.83 
 
 
310 aa  305  6e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1896  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.2 
 
 
310 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.2 
 
 
310 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2863  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.79 
 
 
318 aa  302  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.694024  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1517  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.28 
 
 
335 aa  301  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2355  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.3 
 
 
313 aa  300  2e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0449699  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0503  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.75 
 
 
312 aa  298  6e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0338301  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0464  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.96 
 
 
317 aa  298  9e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.958757  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3200  aspartate carbamoyltransferase  50.65 
 
 
314 aa  297  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0879  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.47 
 
 
307 aa  296  2e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1575  aspartate carbamoyltransferase  47.42 
 
 
311 aa  295  6e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5487  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.15 
 
 
313 aa  294  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.07038 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1271  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.34 
 
 
311 aa  293  3e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102849  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2434  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.33 
 
 
318 aa  292  4e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0103  aspartate carbamoyltransferase  52.2 
 
 
329 aa  292  5e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10323  probable aspartate carbamoyltransferase  47.35 
 
 
309 aa  290  2e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1425  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.32 
 
 
325 aa  290  3e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2330  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.04 
 
 
313 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0344  aspartate carbamoyltransferase  48.36 
 
 
307 aa  289  4e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000132392  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2242  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.04 
 
 
313 aa  289  4e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.300493  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1618  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.04 
 
 
313 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2085  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.62 
 
 
310 aa  288  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148257  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4545  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.34 
 
 
308 aa  287  1e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0084  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.57 
 
 
307 aa  288  1e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0579282 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.7 
 
 
311 aa  287  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4349  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.15 
 
 
316 aa  287  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2657  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.38 
 
 
306 aa  286  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2193  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.76 
 
 
316 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.345265 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3418  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.16 
 
 
317 aa  286  4e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.633713 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1284  aspartate carbamoyltransferase  47.1 
 
 
312 aa  286  5e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0189809  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4725  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.82 
 
 
317 aa  285  5.999999999999999e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2964  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.32 
 
 
318 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.585187  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09370  aspartate carbamoyltransferase  50.32 
 
 
313 aa  285  5.999999999999999e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.370258  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0941  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.84 
 
 
328 aa  285  8e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.253806  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3635  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.49 
 
 
315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.177369 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.49 
 
 
315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.847198 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0936  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.46 
 
 
313 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0143291  normal  0.350081 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03120  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.15 
 
 
336 aa  284  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0295366  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3761  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.5 
 
 
336 aa  284  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0719  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.23 
 
 
308 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.778436  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2512  aspartate carbamoyltransferase  47.92 
 
 
314 aa  283  3.0000000000000004e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1878  aspartate carbamoyltransferase  50.65 
 
 
314 aa  282  5.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2282  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.82 
 
 
317 aa  282  6.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.47523  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0542  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.56 
 
 
334 aa  282  6.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.686364  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1713  aspartate carbamoyltransferase  50.5 
 
 
320 aa  282  6.000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2529  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.58 
 
 
310 aa  282  6.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1299  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.43 
 
 
318 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0235362  hitchhiker  0.00573061 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1769  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.08 
 
 
311 aa  281  8.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0422268  normal  0.117103 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3848  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.16 
 
 
316 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0236185 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3666  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.43 
 
 
322 aa  281  8.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3919  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.16 
 
 
315 aa  281  8.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0599  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.43 
 
 
322 aa  281  1e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0564  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.43 
 
 
322 aa  281  1e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0541  aspartate carbamoyltransferase  45.78 
 
 
306 aa  280  2e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000499557  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3512  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.83 
 
 
315 aa  280  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05260  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50 
 
 
334 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.873262  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1391  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.1 
 
 
318 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.621598  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0502  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.33 
 
 
334 aa  279  4e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2007  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.16 
 
 
362 aa  279  4e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>