130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0114 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0114  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
199 aa  390  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  35.33 
 
 
342 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  35.33 
 
 
342 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  35.33 
 
 
342 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  31.72 
 
 
342 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
343 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  30.98 
 
 
342 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
343 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  25.34 
 
 
254 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  25.34 
 
 
253 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  25.34 
 
 
254 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  25.34 
 
 
254 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  25.34 
 
 
253 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  25.34 
 
 
253 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  24.77 
 
 
251 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  25.23 
 
 
253 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  24.89 
 
 
253 aa  61.6  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  24.77 
 
 
253 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  24.55 
 
 
251 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
343 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
343 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  37.11 
 
 
342 aa  56.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  25.12 
 
 
252 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  32.12 
 
 
342 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  25 
 
 
252 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3218  MerR family transcriptional regulator  60.53 
 
 
336 aa  52.4  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4400  transcriptional regulator, MerR family  41.54 
 
 
303 aa  52  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462564  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2999  regulatory protein, MerR  60.53 
 
 
336 aa  51.6  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.645753  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4650  transcriptional regulator, MerR family  40.28 
 
 
354 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3566  MerR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
345 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  33.02 
 
 
288 aa  49.3  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4910  putative transcriptional regulator, MerR family  53.85 
 
 
334 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48977  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1491  regulatory protein MerR  51.28 
 
 
326 aa  48.5  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  31.73 
 
 
133 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2665  MerR family transcriptional regulator  24.88 
 
 
639 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  26.6 
 
 
648 aa  47  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  32 
 
 
144 aa  46.6  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1729  MerR family transcriptional regulator  27.13 
 
 
659 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  38.75 
 
 
139 aa  46.2  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1532  MerR family transcriptional regulator  27.13 
 
 
604 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  32 
 
 
141 aa  46.2  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4517  zinc-responsive transcriptional regulator  31.37 
 
 
143 aa  46.2  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00152846  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  32 
 
 
141 aa  46.2  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0811  MerR family transcriptional regulator  27.13 
 
 
630 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1328  MerR family transcriptional regulator  27.13 
 
 
604 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0545  MerR family transcriptional regulator  27.13 
 
 
630 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1556  MerR family transcriptional regulator  27.13 
 
 
604 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.486456  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0610  MerR family transcriptional regulator  27.13 
 
 
604 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303247  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3072  MerR family transcriptional regulator  42.62 
 
 
341 aa  45.4  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
143 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
150 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  36.9 
 
 
133 aa  44.7  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3680  zinc-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 
141 aa  44.7  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3715  zinc-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 
141 aa  44.7  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.325937 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3608  zinc-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 
141 aa  44.7  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.260442 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3607  zinc-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 
141 aa  44.7  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3778  zinc-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 
141 aa  44.7  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03143  zinc-responsive transcriptional regulator  33.64 
 
 
141 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0421  transcriptional regulator, MerR family  33.64 
 
 
141 aa  44.3  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5140  MerR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
147 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2470  MerR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
138 aa  44.7  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5066  MerR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
340 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3486  zinc-responsive transcriptional regulator  33.64 
 
 
141 aa  44.3  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0751902  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3775  zinc-responsive transcriptional regulator  33.64 
 
 
141 aa  44.3  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.02383  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2916  MerR family transcriptional regulator  43.42 
 
 
154 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221684  normal  0.314176 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  33.64 
 
 
141 aa  44.3  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  hitchhiker  0.0000172555 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3587  zinc-responsive transcriptional regulator  33.64 
 
 
141 aa  44.3  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.205456  normal  0.141164 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3678  zinc-responsive transcriptional regulator  33.64 
 
 
141 aa  44.3  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4072  transcriptional regulator, MerR family  36.11 
 
 
140 aa  44.3  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.44146 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03094  hypothetical protein  33.64 
 
 
141 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6980  transcriptional regulator, MerR family  40.91 
 
 
299 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4614  zinc-responsive transcriptional regulator  33.64 
 
 
141 aa  44.3  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000341039  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2451  transcriptional regulator, MerR family  48.72 
 
 
339 aa  43.5  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  31.25 
 
 
148 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  37.04 
 
 
135 aa  43.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1724  MerR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
134 aa  43.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35820  predicted transcriptional regulator  39.68 
 
 
134 aa  43.9  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  35.96 
 
 
133 aa  43.5  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2141  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
181 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0481912  normal  0.077667 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  36.25 
 
 
142 aa  43.5  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  36.25 
 
 
142 aa  43.5  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5193  MerR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
147 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  35.53 
 
 
138 aa  43.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4624  transcriptional regulator, MerR family  34.29 
 
 
333 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3793  transcriptional regulator, MerR family  32.53 
 
 
139 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3303  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
143 aa  43.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0113  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
143 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
257 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0123  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
143 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  43.48 
 
 
130 aa  42.7  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  31.25 
 
 
148 aa  42.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2932  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
143 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327003  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0123  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
143 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169164  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5013  MerR family transcriptional regulator  28.43 
 
 
147 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0137  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
143 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3106  regulator of pmrA, putative  25.66 
 
 
257 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0273598  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1026  MerR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
140 aa  42  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120689  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0230  MerR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
154 aa  42.4  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1973  MerR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
154 aa  42.4  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  32.1 
 
 
137 aa  42.4  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>