52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0960 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0960  polysaccharide pyruvyl transferase  100 
 
 
418 aa  873    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.63346  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0829  polysaccharide pyruvyl transferase  62.29 
 
 
411 aa  526  1e-148  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.270983  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0956  polysaccharide pyruvyl transferase  26.86 
 
 
407 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2020  polysaccharide pyruvyl transferase  26.5 
 
 
392 aa  95.1  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.751321 
 
 
-
 
NC_002936  DET0213  hypothetical protein  24.72 
 
 
431 aa  91.3  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0586  polysaccharide pyruvyl transferase  24.82 
 
 
395 aa  89.7  9e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00188852  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4482  hypothetical protein  28.57 
 
 
432 aa  81.3  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0140  hypothetical protein  23.94 
 
 
430 aa  76.6  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.794718  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2659  putative pyruvyl transferase  21.81 
 
 
426 aa  72.4  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.520792  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4136  polysaccharide pyruvyl transferase  26.61 
 
 
394 aa  72  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.920771 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2441  putative pyruvyl transferase  20.62 
 
 
426 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248643 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2283  putative pyruvyl transferase  20.1 
 
 
426 aa  70.1  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000193394 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2327  putative pyruvyl transferase  20.29 
 
 
426 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244725  normal  0.210218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2334  putative pyruvyl transferase  20.38 
 
 
426 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.703418 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2226  putative pyruvyl transferase  20.38 
 
 
426 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0937494  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3356  polysaccharide pyruvyl transferase  22.26 
 
 
435 aa  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2979  putative pyruvyl transferase  21.12 
 
 
426 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.158831  hitchhiker  0.000214392 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1187  putative pyruvyl transferase  21.6 
 
 
426 aa  61.6  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1017  putative pyruvyl transferase  21.17 
 
 
426 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826012  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2337  putative pyruvyl transferase  21.17 
 
 
426 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00581258  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1596  putative pyruvyl transferase  22.67 
 
 
426 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.077358  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1612  polysaccharide pyruvyl transferase  21.12 
 
 
426 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00148194  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  23.87 
 
 
745 aa  60.1  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01951  predicted pyruvyl transferase  21.17 
 
 
426 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0168831  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01940  hypothetical protein  21.17 
 
 
426 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0157145  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0713  polysaccharide pyruvyl transferase  19.09 
 
 
369 aa  56.2  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.67475  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2943  polysaccharide pyruvyl transferase  22.86 
 
 
367 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0783  polysaccharide pyruvyl transferase  20.33 
 
 
362 aa  54.3  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727732  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4399  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  20.47 
 
 
362 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0391258  hitchhiker  0.00000000000323458 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0973  CsaB protein  19.44 
 
 
367 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0112574 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2392  polysaccharide pyruvyl transferase  21.67 
 
 
395 aa  52.8  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.692445  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1238  hypothetical protein  24.71 
 
 
509 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.235902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0884  pyruvyl-transferase  19.2 
 
 
367 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0840  CsaB protein  19.2 
 
 
367 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0788  pyruvyl-transferase  19.39 
 
 
367 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192045  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0932  pyruvyl-transferase  20.67 
 
 
362 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.277719  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0215  polysaccharide pyruvyl transferase  23.46 
 
 
366 aa  51.6  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1063  CsaB protein  19.15 
 
 
367 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1408  polysaccharide pyruvyl transferase  23.61 
 
 
341 aa  50.1  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000381534  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0824  hypothetical protein  24.92 
 
 
422 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.00269709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0786  pyruvyl-transferase  19.05 
 
 
375 aa  49.7  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0102  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  23.59 
 
 
367 aa  48.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3364  polysaccharide pyruvyl transferase  20.3 
 
 
382 aa  46.6  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.324545  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2379  polysaccharide pyruvyl transferase  22.33 
 
 
400 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000108064  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2271  polysaccharide pyruvyl transferase  20.3 
 
 
378 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000535083  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1476  hypothetical protein  21.45 
 
 
374 aa  44.7  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.470406  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3605  polysaccharide pyruvyl transferase  20.3 
 
 
382 aa  45.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.808806  hitchhiker  0.000648077 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2362  polysaccharide pyruvyl transferase  22.78 
 
 
332 aa  44.7  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0735051  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0419  hypothetical protein  22.19 
 
 
413 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0972  CsaB protein  20.82 
 
 
369 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953296  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0123  polysaccharide pyruvyl transferase  20.73 
 
 
356 aa  43.9  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000678569  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0729  hypothetical protein  22.89 
 
 
443 aa  43.1  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>