More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0554 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0554  CoA-binding domain-containing protein  100 
 
 
689 aa  1398    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.794682  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4122  CoA-binding domain protein  38.03 
 
 
719 aa  431  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4362  hypothetical protein  37.38 
 
 
709 aa  428  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.138782  normal  0.0457098 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2327  CoA-binding domain-containing protein  37.6 
 
 
707 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1525  CoA-binding domain-containing protein  37.34 
 
 
722 aa  415  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.193132  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3116  hypothetical protein  35.88 
 
 
713 aa  412  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0277399  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8714  CoA-binding domain protein  37.28 
 
 
722 aa  411  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1703  CoA-binding domain-containing protein  36.03 
 
 
680 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1969  CoA-binding domain protein  36.93 
 
 
680 aa  398  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0566  CoA-binding  35.19 
 
 
688 aa  394  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.9879  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1471  CoA-binding  35.84 
 
 
687 aa  390  1e-107  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1620  CoA-binding domain-containing protein  35.32 
 
 
694 aa  377  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0696581 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0914  CoA-binding domain-containing protein  34.75 
 
 
687 aa  364  3e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.216851  hitchhiker  0.00000000145434 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1309  CoA-binding domain-containing protein  32.9 
 
 
705 aa  363  7.0000000000000005e-99  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000175905 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0863  hypothetical protein  33.28 
 
 
707 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0968097 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1246  CoA-binding domain-containing protein  32.44 
 
 
753 aa  354  2.9999999999999997e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000185124  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1910  CoA-binding domain protein  34.95 
 
 
676 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.236564  normal  0.164304 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  37.61 
 
 
929 aa  327  6e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  39.29 
 
 
699 aa  322  9.999999999999999e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  38.74 
 
 
696 aa  320  6e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  38.19 
 
 
698 aa  308  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  35.92 
 
 
697 aa  302  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  34.36 
 
 
701 aa  301  3e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  40.36 
 
 
696 aa  300  8e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  36.89 
 
 
700 aa  298  2e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  34.92 
 
 
918 aa  298  3e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1093  CoA-binding domain-containing protein  36.66 
 
 
477 aa  297  4e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  36.73 
 
 
712 aa  295  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3442  CoA-binding domain protein  32.43 
 
 
710 aa  294  4e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  35.2 
 
 
911 aa  292  1e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0586  CoA-binding domain-containing protein  32.88 
 
 
705 aa  292  1e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  33.63 
 
 
920 aa  291  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  36.75 
 
 
698 aa  287  5e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  35.37 
 
 
711 aa  286  9e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  34.37 
 
 
915 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  36.36 
 
 
706 aa  284  4.0000000000000003e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1991  CoA-binding domain protein  35.56 
 
 
711 aa  278  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820209  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  34.77 
 
 
912 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  32.23 
 
 
921 aa  274  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  33.26 
 
 
669 aa  272  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1854  CoA-binding domain-containing protein  34.85 
 
 
472 aa  268  4e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.794372 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  37.17 
 
 
704 aa  267  5e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  33.04 
 
 
889 aa  266  7e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0319  CoA-binding domain protein  36.38 
 
 
464 aa  266  1e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0484  CoA-binding domain-containing protein  33.62 
 
 
461 aa  264  4.999999999999999e-69  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.833675  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  32.6 
 
 
706 aa  261  3e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  34.2 
 
 
697 aa  261  4e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  33.55 
 
 
698 aa  260  6e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  31.21 
 
 
892 aa  260  7e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4996  CoA-binding domain-containing protein  30.9 
 
 
705 aa  258  4e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  33.11 
 
 
714 aa  256  7e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  31.49 
 
 
905 aa  256  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  33.99 
 
 
695 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  34.21 
 
 
883 aa  255  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  33.85 
 
 
702 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  33.63 
 
 
702 aa  254  5.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  31.28 
 
 
892 aa  254  5.000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  33.63 
 
 
703 aa  252  1e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  31.06 
 
 
895 aa  251  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5066  CoA-binding domain-containing protein  35.12 
 
 
727 aa  250  7e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1635  CoA-binding domain-containing protein  34.56 
 
 
461 aa  246  9e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.242255  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2602  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  34.25 
 
 
660 aa  246  9.999999999999999e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.470486  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4811  CoA-binding domain-containing protein  34.91 
 
 
693 aa  246  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441537  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  34.67 
 
 
704 aa  245  1.9999999999999999e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3477  CoA-binding domain protein  33.7 
 
 
699 aa  245  1.9999999999999999e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  30.48 
 
 
897 aa  244  3e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  30.57 
 
 
900 aa  244  5e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1804  CoA-binding domain-containing protein  32.97 
 
 
461 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.688194  normal  0.0833486 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0138  CoA-binding domain-containing protein  29.55 
 
 
492 aa  240  5e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0892765  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0336  CoA-binding domain-containing protein  34.11 
 
 
508 aa  241  5e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  30.33 
 
 
893 aa  239  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1637  CoA-binding domain protein  32.97 
 
 
709 aa  239  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0978  CoA-binding domain-containing protein  34.14 
 
 
375 aa  238  3e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00209366  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  31.21 
 
 
707 aa  238  4e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  30.36 
 
 
698 aa  237  6e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0162  CoA-binding domain-containing protein  36.39 
 
 
516 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000166188  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2324  GCN5-related N-acetyltransferase  30.26 
 
 
898 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1589  CoA-binding domain-containing protein  34.81 
 
 
451 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.710571  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.18 
 
 
711 aa  234  4.0000000000000004e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2897  CoA-binding domain-containing protein  33.41 
 
 
451 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  30.97 
 
 
699 aa  233  8.000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1809  CoA-binding domain-containing protein  35.71 
 
 
710 aa  233  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1399  CoA-binding domain-containing protein  29.4 
 
 
660 aa  231  3e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.578078  hitchhiker  0.000299945 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1928  CoA-binding domain-containing protein  30.22 
 
 
900 aa  231  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.517585  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  30.94 
 
 
728 aa  229  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2428  CoA-binding domain protein  30.27 
 
 
697 aa  229  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.816008  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1760  acetyltransferase  30.26 
 
 
911 aa  227  7e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0308068 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1837  CoA-binding domain-containing protein  30.26 
 
 
899 aa  225  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.515671  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2598  CoA-binding  35.4 
 
 
708 aa  224  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2078  GCN5-related N-acetyltransferase  29.39 
 
 
896 aa  223  9e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0450979  normal  0.503964 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2093  CoA-binding domain protein  30.04 
 
 
901 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.642552  normal  0.884051 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2252  CoA-binding domain-containing protein  30.04 
 
 
901 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0699279  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2105  CoA-binding domain-containing protein  30.04 
 
 
905 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.965972  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2369  CoA-binding domain-containing protein  30.04 
 
 
901 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.181802  normal  0.823699 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2530  GCN5-related N-acetyltransferase  29.48 
 
 
896 aa  220  7e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1876  CoA-binding domain-containing protein  30.04 
 
 
913 aa  220  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.766873 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2116  acetyltransferase  30.04 
 
 
903 aa  219  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2098  CoA-binding domain-containing protein  30.04 
 
 
913 aa  219  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.865996 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4084  CoA-binding domain protein  31.69 
 
 
750 aa  219  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.030706  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  29.41 
 
 
913 aa  218  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>