More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3644 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_3644  HesB/YadR/YfhF-family protein  100 
 
 
118 aa  238  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1576  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  56.48 
 
 
136 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.717654  normal  0.472195 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0398  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  55.14 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.770041  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0113  HesB/YadR/YfhF-family protein  56.57 
 
 
104 aa  122  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5902  putative iron-sulfur cluster assembly protein  57.66 
 
 
109 aa  121  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316321  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1447  HesB/YadR/YfhF  54.81 
 
 
135 aa  120  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0113719 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0206  HesB/YadR/YfhF family protein  54.13 
 
 
127 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.178163  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1406  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  51.4 
 
 
134 aa  117  4.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1065  HesB/YadR/YfhF  50.98 
 
 
118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4470  HesB/YadR/YfhF  50.49 
 
 
118 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0961  HesB/YadR/YfhF  50 
 
 
118 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5109  HesB/YadR/YfhF-family protein  45.95 
 
 
118 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7744  HesB/YadR/YfhF-family protein  54.35 
 
 
132 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7775  HesB/YadR/YfhF-family protein  54.35 
 
 
132 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178279  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01610  Nitrogen fixation Fe-S cluster assembly protein IscAnif  41 
 
 
107 aa  81.3  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1247  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.74 
 
 
111 aa  77  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1531  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.74 
 
 
111 aa  77  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.182474  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1513  HesB/YadR/YfhF  40.78 
 
 
107 aa  76.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1491  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40 
 
 
107 aa  72  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3155  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.45 
 
 
118 aa  71.6  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0471  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.05 
 
 
107 aa  70.9  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0506099  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0639  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.89 
 
 
109 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.248132  normal  0.354977 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1566  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  37.25 
 
 
107 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2266  HesB/YadR/YfhF family protein  35.24 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1741  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  35.24 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000381054  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1821  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  35.24 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00928185  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2278  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  35.24 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00670907  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40380  Iron-sulfur biogenesis protein  35.85 
 
 
107 aa  68.2  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0283  HesB-family protein  37.14 
 
 
107 aa  68.2  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2184  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.92 
 
 
106 aa  67  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0532  hypothetical protein  35.92 
 
 
106 aa  67  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0361463  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1823  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  30.28 
 
 
119 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1463  FeS assembly scaffold SufA  31.07 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0458373 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1795  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  30.28 
 
 
119 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2288  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  35.24 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0828937  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0844  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  35.85 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0887  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  35.85 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553032  hitchhiker  0.000153818 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1255  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.92 
 
 
106 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0594  HesB/YadR/YfhF  35.92 
 
 
110 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2315  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  34.29 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.608398  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2180  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  35.24 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000819662  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0874  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  35.85 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.301762 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3509  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  35.85 
 
 
107 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.684527  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1295  HesB/YadR/YfhF family protein  32.38 
 
 
107 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.609132  normal  0.0124228 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4257  HesB/YadR/YfhF  33.05 
 
 
123 aa  65.1  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1859  HesB/YadR/YfhF  37.14 
 
 
117 aa  64.7  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1963  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  33.33 
 
 
107 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00723814  hitchhiker  0.00183278 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2395  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  33.33 
 
 
107 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210631  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2384  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  33.33 
 
 
107 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000545288  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2500  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  33.33 
 
 
107 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0332072  hitchhiker  0.00778132 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1778  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  33.33 
 
 
107 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000335505 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0620  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.92 
 
 
110 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779082  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0629  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.92 
 
 
110 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1134  iron-sulfur cluster assembly protein  33.33 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4610  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  35.85 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0799177  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0979  HesB/YadR/YfhF  33.98 
 
 
106 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.29141 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4803  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  33.62 
 
 
121 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.901063 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2053  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.83 
 
 
112 aa  63.5  0.0000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.432369  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2134  hypothetical protein  38.83 
 
 
112 aa  63.5  0.0000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.191156  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1425  iron-binding protein IscA  35.85 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3630  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  31.07 
 
 
127 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2147  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  33.33 
 
 
107 aa  63.5  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00101616  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0824  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  34.29 
 
 
107 aa  62  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0263078  normal  0.761008 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1239  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  34.91 
 
 
107 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1631  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  31.07 
 
 
106 aa  62.8  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.017999  hitchhiker  0.0000149537 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3583  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.58 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143681  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5909  Iron-binding protein IscA (iron-sulfur cluster assembly protein)  34.31 
 
 
107 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2568  HesB/YadR/YfhF  36.54 
 
 
113 aa  62.8  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1363  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.38 
 
 
107 aa  62  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3562  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  31.07 
 
 
127 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.558968  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2181  HesB/YadR/YfhF  36.54 
 
 
122 aa  62.8  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0675  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  34.29 
 
 
107 aa  62  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6870  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.62 
 
 
206 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2442  FeS assembly scaffold SufA  32.04 
 
 
128 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.434123  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3357  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.67 
 
 
114 aa  62.4  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3025  iron-sulfur cluster assembly protein  34.29 
 
 
107 aa  62.4  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.116903  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2591  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.86 
 
 
112 aa  62  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3478  HesB/YadR/YfhF  30.1 
 
 
127 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4477  HesB/YadR/YfhF  33.64 
 
 
206 aa  62  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0747916  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4334  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  34.91 
 
 
107 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0987592  hitchhiker  0.00000000135167 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1776  FeS assembly scaffold SufA  33.33 
 
 
128 aa  62  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.641899  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1045  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  34.29 
 
 
110 aa  61.6  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2144  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  34.29 
 
 
107 aa  61.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.253252  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1083  HesB/YadR/YfhF  33.01 
 
 
106 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2445  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  33.33 
 
 
107 aa  60.8  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.300922  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2034  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  34.29 
 
 
107 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1227  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  33.98 
 
 
122 aa  60.8  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000951684 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004358  iron binding protein IscA for iron-sulfur cluster assembly  32.38 
 
 
107 aa  60.8  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1441  HesB/YadR/YfhF, Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  33.33 
 
 
107 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0666522  hitchhiker  0.00534365 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1301  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  34.91 
 
 
107 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0512057  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14750  putative iron-binding protein IscA  34.91 
 
 
107 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1509  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  33.98 
 
 
122 aa  60.8  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00886553  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2740  iron-sulfur cluster assembly protein  34.29 
 
 
107 aa  60.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1640  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  34.29 
 
 
107 aa  60.8  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.894847  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2142  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  34.29 
 
 
107 aa  60.8  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00782593 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3589  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.04 
 
 
127 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200335 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2161  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  34.29 
 
 
122 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2781  iron-sulfur cluster assembly protein  34.29 
 
 
107 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1247  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.62 
 
 
108 aa  60.5  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2915  iron-sulfur cluster assembly protein  34.29 
 
 
107 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>