43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2841 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2841  Exopolysaccharide synthesis ExoD  100 
 
 		 316 aa  624  1e-178  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.61734 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1687  exopolysaccharide synthesis ExoD  50.52 
 
 		 313 aa  269  4e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.882846 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1096  hypothetical protein  31.76 
 
 		 200 aa  94.7  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1099  hypothetical protein  30.68 
 
 		 200 aa  93.6  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1428  exopolysaccharide synthesis protein ExoD  29.95 
 
 		 200 aa  91.7  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1368  exopolysaccharide synthesis protein  29.95 
 
 		 200 aa  91.7  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0481317  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2869  exopolysaccharide synthesis, ExoD  31.94 
 
 		 220 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1827  exopolysaccharide synthesis, ExoD  31.72 
 
 		 227 aa  82  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0769  exopolysaccharide synthesis protein  29.05 
 
 		 209 aa  81.3  0.00000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0140556  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0307  exopolysaccharide synthesis, ExoD  30 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4269  exopolysaccharide synthesis ExoD  32.22 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.528198  decreased coverage  0.0088823 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6438  exopolysaccharide synthesis ExoD  35.37 
 
 		 223 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3870  uncharacterized ABC-type transport system permease protein  31.15 
 
 		 212 aa  75.5  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2728  Exopolysaccharide synthesis ExoD  28.42 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0212409 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1027  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.74 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0369  exopolysaccharide synthesis, ExoD  33.79 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0151  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  26.82 
 
 		 218 aa  65.5  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0150  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  26.97 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0209  exopolysaccharide synthesis protein  29.37 
 
 		 198 aa  65.1  0.000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.742112  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5451  exopolysaccharide synthesis ExoD  28.43 
 
 		 259 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2365  Exopolysaccharide synthesis ExoD  33.09 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2415  Exopolysaccharide synthesis ExoD  33.09 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2945  exopolysaccharide synthesis, ExoD  29.65 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0152237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1302  exopolysaccharide synthesis, ExoD  28.19 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2622  exopolysaccharide synthesis, ExoD  31.94 
 
 		 208 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.512151  normal  0.293711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1758  Exopolysaccharide synthesis ExoD  31.5 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4959  exopolysaccharide synthesis ExoD  25.68 
 
 		 203 aa  58.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.938152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1479  exopolysaccharide synthesis ExoD  25.47 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.438541  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4382  Exopolysaccharide synthesis ExoD  30.18 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0680521 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3324  Exopolysaccharide synthesis ExoD  31.68 
 
 		 194 aa  55.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.183092  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0922  Exopolysaccharide synthesis ExoD  31.68 
 
 		 194 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.93119e-33 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2346  exopolysaccharide synthesis, ExoD  25 
 
 		 210 aa  53.5  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2718  exopolysaccharide synthesis, ExoD  28.83 
 
 		 200 aa  53.1  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5360  hypothetical protein  33.07 
 
 		 317 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290755  hitchhiker  0.00309893 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01796  Exopolysaccharide synthesis, ExoD  27.59 
 
 		 191 aa  51.2  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0457786  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1715  uncharacterized ABC-type transport system permease component-like protein  27.37 
 
 		 177 aa  50.8  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2195  exopolysaccharide synthesis ExoD  25.58 
 
 		 202 aa  47.8  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1251  ABC transporter permease  24.23 
 
 		 215 aa  46.6  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.531282  normal  0.725571 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1193  Exopolysaccharide synthesis ExoD  29.17 
 
 		 210 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01278  probable exopolysaccharide synthesis protein  26.55 
 
 		 192 aa  45.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.183403  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3452  Exopolysaccharide synthesis ExoD  25.57 
 
 		 219 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1212  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.63 
 
 		 201 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1242  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.63 
 
 		 201 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.345513 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>