More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1788 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  100 
 
 		 291 aa  601  1.0000000000000001e-171  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2014  ribonuclease Z  55.33 
 
 		 291 aa  359  3e-98  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.426384  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  39.47 
 
 		 305 aa  204  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  37.41 
 
 		 308 aa  190  2e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  39.32 
 
 		 305 aa  187  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  37.42 
 
 		 310 aa  176  5e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1776  ribonuclease Z  34.01 
 
 		 299 aa  175  6e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  38.18 
 
 		 306 aa  172  9e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0417  ribonuclease Z  38.23 
 
 		 326 aa  170  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  37.09 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  37.63 
 
 		 305 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  35.55 
 
 		 341 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  35.55 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  35.55 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2497  ribonuclease Z  35.55 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.883053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  37.38 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  35.55 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  33.22 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  33.33 
 
 		 305 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  34.46 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  33.33 
 
 		 305 aa  160  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  33.22 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  33.33 
 
 		 305 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  33.33 
 
 		 305 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  32.9 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  36.75 
 
 		 309 aa  160  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  33.33 
 
 		 305 aa  160  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  33.33 
 
 		 305 aa  159  6e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  38.38 
 
 		 314 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1383  ribonuclease Z  35.71 
 
 		 287 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.409103  normal  0.0217204 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1973  ribonuclease Z  36.69 
 
 		 313 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  33.1 
 
 		 314 aa  155  8e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0647  ribonuclease Z  37 
 
 		 313 aa  154  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.834913  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  32.67 
 
 		 308 aa  152  5e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  34.43 
 
 		 318 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.39 
 
 		 312 aa  152  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  33.33 
 
 		 322 aa  151  1e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  31.29 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  38.19 
 
 		 305 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  32.68 
 
 		 393 aa  150  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  33.33 
 
 		 307 aa  149  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  33.33 
 
 		 307 aa  149  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  33.33 
 
 		 307 aa  149  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  34 
 
 		 307 aa  149  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  33.33 
 
 		 307 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  33.33 
 
 		 307 aa  149  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  33.33 
 
 		 307 aa  149  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0659  ribonuclease Z  33.11 
 
 		 309 aa  148  9e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  32.67 
 
 		 307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  33.33 
 
 		 307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  33.09 
 
 		 308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3197  ribonuclease Z  35.23 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  33.33 
 
 		 307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  33.33 
 
 		 307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  36.81 
 
 		 318 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0430  ribonuclease Z  36.81 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0405  beta-lactamase domain-containing protein  32.78 
 
 		 287 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.945649  normal  0.820015 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.74 
 
 		 312 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  31.48 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1447  RNAse Z  30.39 
 
 		 312 aa  143  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1475  beta-lactamase superfamily hydrolase  31.82 
 
 		 318 aa  143  3e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1613  ribonuclease Z  32.05 
 
 		 316 aa  142  4e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0350  ribonuclease Z  31.46 
 
 		 304 aa  143  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1360  ribonuclease Z  31.07 
 
 		 316 aa  142  5e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0966966  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1103  RNAse Z  34.12 
 
 		 287 aa  142  6e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0015  ribonuclease Z  31.8 
 
 		 315 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.134703  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0010  ribonuclease Z  33.33 
 
 		 304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1723  ribonuclease Z  33.11 
 
 		 287 aa  140  3e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00214675  decreased coverage  0.00000691229 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4033  ribonuclease Z  33.45 
 
 		 319 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299532  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1210  ribonuclease Z  32.89 
 
 		 309 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  31.63 
 
 		 319 aa  139  4.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1716  ribonuclease Z  31.61 
 
 		 316 aa  139  7e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  33.22 
 
 		 315 aa  138  8.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0739  ribonuclease Z  31.29 
 
 		 304 aa  138  8.999999999999999e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  31.95 
 
 		 319 aa  138  1e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1193  ribonuclease Z  31.58 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1365  hypothetical protein  33.77 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000739768  hitchhiker  0.0000000312864 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15101  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.07 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  31.7 
 
 		 314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.37 
 
 		 327 aa  136  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0654  ribonuclease Z  30.56 
 
 		 307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.296839  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.51 
 
 		 314 aa  136  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1554  ribonuclease Z  33.33 
 
 		 317 aa  136  4e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1805  ribonuclease Z  32.73 
 
 		 319 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0782  ribonuclease Z  30.14 
 
 		 319 aa  135  9e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1678  beta-lactamase domain-containing protein  33.89 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.554215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1591  ribonuclease Z  32.57 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.125239 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2818  ribonuclease Z  34.11 
 
 		 305 aa  132  5e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2403  ribonuclease Z  32.23 
 
 		 345 aa  132  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335232  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3634  ribonuclease Z  32.48 
 
 		 319 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0641  ribonuclease Z  31.89 
 
 		 321 aa  132  6.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  decreased coverage  0.00172895 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1914  ribonuclease Z  30.3 
 
 		 313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.552811  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1839  ribonuclease Z  32.85 
 
 		 321 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.885199  normal  0.0537997 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12268  predicted protein  32.99 
 
 		 311 aa  129  8.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812865  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05331  beta-lactamase superfamily hydrolase  32.04 
 
 		 318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2169  ribonuclease Z  29.6 
 
 		 323 aa  126  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0974694  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10313  ribonuclease Z  30 
 
 		 301 aa  125  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1070  beta-lactamase domain protein  33.21 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5044  ribonuclease Z  33 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1866  beta-lactamase domain protein  29.17 
 
 		 303 aa  124  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>