32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1447 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1447  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 420 aa  809    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2246  amino acid permease-associated region  46.06 
 
 		 442 aa  352  5e-96  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0960  amino acid permease-associated region  37.62 
 
 		 446 aa  233  5e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.402464  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1373  amino acid permease-associated region  35.86 
 
 		 484 aa  224  2e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0348286 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2139  amino acid permease-associated region  37.35 
 
 		 417 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.578825  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0964  amino acid permease-associated region  33.94 
 
 		 463 aa  194  2e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.801487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  24.5 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  25.71 
 
 		 441 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  26.05 
 
 		 422 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  21.26 
 
 		 447 aa  54.3  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  23.68 
 
 		 440 aa  53.9  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0409  amino acid permease-associated region  25.62 
 
 		 526 aa  53.5  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2587  amino acid permease-associated region  23.62 
 
 		 440 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250393 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2029  amino acid permease family protein  24.28 
 
 		 442 aa  50.1  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3114  amino acid transporter  22.65 
 
 		 446 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.988661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  25.64 
 
 		 449 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  25.83 
 
 		 468 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  21.9 
 
 		 450 aa  47.4  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  25.43 
 
 		 449 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  24.23 
 
 		 443 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0683  amino acid permease-associated region  25.7 
 
 		 425 aa  46.6  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0535  amino acid permease-associated region  24.48 
 
 		 443 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  24.21 
 
 		 501 aa  44.3  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  24.13 
 
 		 475 aa  43.9  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  27.44 
 
 		 439 aa  44.3  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3809  amino acid permease-associated region  23.65 
 
 		 443 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0509  amino acid permease-associated region  24.48 
 
 		 443 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  22.26 
 
 		 434 aa  43.5  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0530  amino acid permease-associated region  23.65 
 
 		 443 aa  43.1  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0153  amino acid permease-associated region  28 
 
 		 487 aa  43.1  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3674  amino acid permease-associated region  25.45 
 
 		 487 aa  43.1  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  22.97 
 
 		 456 aa  43.1  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>