More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0398 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0398  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
315 aa  631  1e-180  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.859369  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0678  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.52 
 
 
310 aa  324  1e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.211345  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1545  alcohol dehydrogenase  37.2 
 
 
322 aa  192  6e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0146504 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0639  alcohol dehydrogenase  36.86 
 
 
322 aa  192  7e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00000239851  hitchhiker  0.000149204 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2114  putative alcohol dehydrogenase  35.93 
 
 
331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1770  putative alcohol dehydrogenase  35.93 
 
 
331 aa  174  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.754529  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1426  putative alcohol dehydrogenase  35.97 
 
 
332 aa  170  3e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.967843  normal  0.34363 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0785  putative alcohol dehydrogenase  35.74 
 
 
331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0151749  normal  0.604245 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0305  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.59 
 
 
336 aa  164  3e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0882  putative alcohol dehydrogenase  37.97 
 
 
331 aa  162  6e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1823  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.39 
 
 
333 aa  157  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0247  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.93 
 
 
328 aa  147  3e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0601  alcohol dehydrogenase  35.8 
 
 
324 aa  137  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.474293 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  36.66 
 
 
344 aa  129  9.000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2254  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.51 
 
 
349 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.843055  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2645  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.93 
 
 
339 aa  126  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2098  alcohol dehydrogenase  34.54 
 
 
350 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302969  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.82 
 
 
335 aa  124  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1615  putative alcohol dehydrogenase  34.81 
 
 
332 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.923405  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0121  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  32.93 
 
 
338 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0523  alcohol dehydrogenase  30.48 
 
 
350 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2912  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.08 
 
 
342 aa  116  5e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.85 
 
 
337 aa  116  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.18 
 
 
342 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0173  alcohol dehydrogenase  33.57 
 
 
337 aa  113  4.0000000000000004e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.976128  normal  0.272839 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0148  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.83 
 
 
331 aa  113  5e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1113  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.97 
 
 
320 aa  112  8.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  29.08 
 
 
344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4951  alcohol dehydrogenase  29.38 
 
 
337 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179579  normal  0.722562 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1937  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.27 
 
 
344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601892  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3065  alcohol dehydrogenase  33.87 
 
 
338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.456044 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2996  alcohol dehydrogenase  29.67 
 
 
344 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  28.99 
 
 
344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.06 
 
 
342 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0607  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  31.8 
 
 
324 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420026  normal  0.0271059 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0056  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.71 
 
 
329 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1684  alcohol dehydrogenase  32.41 
 
 
330 aa  110  3e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.900502  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  30.52 
 
 
344 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  30.95 
 
 
347 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  29.97 
 
 
341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0905  alcohol dehydrogenase  31.48 
 
 
350 aa  109  5e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.586977  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2229  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.58 
 
 
340 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1175  alcohol dehydrogenase  32.4 
 
 
346 aa  108  9.000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.518707 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1144  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.61 
 
 
323 aa  108  9.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.129111 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  31.25 
 
 
357 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.4 
 
 
344 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00880  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  29.34 
 
 
327 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.25 
 
 
341 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.25 
 
 
341 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2088  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  30.72 
 
 
335 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3048  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.14 
 
 
355 aa  108  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.25 
 
 
341 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.25 
 
 
341 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4119  alcohol dehydrogenase  31.45 
 
 
356 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362779  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.74 
 
 
342 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  31.25 
 
 
341 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1744  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  30.72 
 
 
335 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0255685 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.4 
 
 
344 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1258  alcohol dehydrogenase  31.47 
 
 
340 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.08 
 
 
342 aa  108  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.56 
 
 
342 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2059  alcohol dehydrogenase  31.12 
 
 
366 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.286272 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1030  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.16 
 
 
346 aa  107  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0743662  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
342 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.06 
 
 
341 aa  107  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  29.17 
 
 
342 aa  106  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0237  alcohol dehydrogenase  30.42 
 
 
336 aa  107  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.15535  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0992  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.82 
 
 
326 aa  106  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  31.58 
 
 
345 aa  107  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.49 
 
 
342 aa  106  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67803  secondary alcohol dehydrogenase (SADH2)  29.7 
 
 
336 aa  106  5e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0778  alcohol dehydrogenase  31.82 
 
 
333 aa  106  6e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0919  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.19 
 
 
351 aa  105  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2413  hypothetical protein  30.72 
 
 
328 aa  105  7e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.76 
 
 
341 aa  105  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3357  alcohol dehydrogenase  28.45 
 
 
340 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0469865 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2086  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.45 
 
 
340 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  30.2 
 
 
336 aa  105  9e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0108  alcohol dehydrogenase  33.9 
 
 
338 aa  105  9e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.476377  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2558  hypothetical protein  30.39 
 
 
328 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2945  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.25 
 
 
336 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2439  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  30.12 
 
 
332 aa  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00520029 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1958  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.46 
 
 
353 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.22 
 
 
323 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568823  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
342 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5450  alcohol dehydrogenase  30.36 
 
 
356 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524745  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_52208  alcohol dehydrogenase  29.59 
 
 
353 aa  104  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  30.18 
 
 
341 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  28.27 
 
 
342 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2412  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.66 
 
 
341 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.16 
 
 
348 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2774  alcohol dehydrogenase  30.95 
 
 
342 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
340 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  28.87 
 
 
342 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.09 
 
 
333 aa  103  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  28.87 
 
 
342 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0630  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  29.01 
 
 
344 aa  103  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1889  alcohol dehydrogenase  27.57 
 
 
343 aa  103  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2723  alcohol dehydrogenase  27.6 
 
 
338 aa  103  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0619136  normal  0.4282 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3870  alcohol dehydrogenase  28.27 
 
 
338 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  normal  0.388912 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>