More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0256 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0256  glyoxylate reductase  100 
 
 
315 aa  634    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.466331 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0823  glyoxylate reductase  53.5 
 
 
339 aa  333  3e-90  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0412  glyoxylate reductase  50.16 
 
 
322 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.281575 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0350  Glyoxylate reductase  47.63 
 
 
319 aa  298  1e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3073  Glyoxylate reductase  46.01 
 
 
322 aa  294  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0551614  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2536  Glyoxylate reductase  48.88 
 
 
318 aa  294  2e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.400778  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3049  Glyoxylate reductase  45.37 
 
 
322 aa  286  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2897  Glyoxylate reductase  46.47 
 
 
327 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000351696  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4324  glyoxylate reductase  46.86 
 
 
341 aa  281  1e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0151043  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3914  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  48.56 
 
 
327 aa  279  4e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.430325 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0892  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  47.91 
 
 
318 aa  276  2e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0266088  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1147  glyoxylate reductase  45.22 
 
 
317 aa  277  2e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2957  Glyoxylate reductase  45.71 
 
 
320 aa  276  3e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000853458  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2820  Glyoxylate reductase  43.4 
 
 
334 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566306  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3042  Glyoxylate reductase  44.79 
 
 
324 aa  272  7e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1980  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  45.37 
 
 
337 aa  271  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00177006  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1522  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  46.44 
 
 
320 aa  270  2e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.417299  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0216  glyoxylate reductase  45.6 
 
 
340 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0089  Glyoxylate reductase  46.44 
 
 
319 aa  269  4e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1344  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  44.27 
 
 
338 aa  266  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000916966  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0846  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  49.66 
 
 
326 aa  267  2e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.908652  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1954  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  46.18 
 
 
329 aa  265  8e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0249135 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0052  Glyoxylate reductase  47.32 
 
 
316 aa  264  1e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2722  Glyoxylate reductase  46.06 
 
 
322 aa  263  4e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0516  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  41.38 
 
 
323 aa  262  4.999999999999999e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1078  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  45.86 
 
 
323 aa  260  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1888  glycerate dehydrogenase  46.08 
 
 
317 aa  259  3e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2371  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  45.91 
 
 
317 aa  259  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.421154  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2328  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  45.91 
 
 
317 aa  259  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5208  Glyoxylate reductase  47.4 
 
 
309 aa  256  5e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1137  glycerate dehydrogenase  48.25 
 
 
323 aa  255  5e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.657649  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0025  lactate dehydrogenase related enzyme  40.57 
 
 
319 aa  254  2.0000000000000002e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2388  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  44.73 
 
 
323 aa  253  3e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00285003  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1337  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  47.8 
 
 
323 aa  252  6e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1535  glycerate dehydrogenase  47.8 
 
 
323 aa  252  7e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1299  glycerate dehydrogenase  47.94 
 
 
323 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0929  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  38.73 
 
 
319 aa  251  9.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0948  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  38.73 
 
 
319 aa  251  9.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1325  glycerate dehydrogenase  47.8 
 
 
323 aa  250  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.470821  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1434  glycerate dehydrogenase  47.8 
 
 
323 aa  250  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.215188  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1574  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  47.62 
 
 
323 aa  249  4e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1298  glycerate dehydrogenase  47.48 
 
 
323 aa  249  6e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.952061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1506  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  47.92 
 
 
339 aa  248  7e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0180022 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3789  2-ketogluconate reductase  41.08 
 
 
326 aa  246  3e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4137  2-ketogluconate reductase  41.08 
 
 
326 aa  246  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0017  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  40.76 
 
 
326 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5042  gluconate 2-dehydrogenase  42.77 
 
 
320 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6845  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  43.59 
 
 
321 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4613  gluconate 2-dehydrogenase  43.13 
 
 
330 aa  242  6e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01261  glyoxylate reductase  46.07 
 
 
357 aa  241  9e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05388  2-hydroxyacid dehydrogenase  45.13 
 
 
331 aa  241  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4773  gluconate 2-dehydrogenase  43.13 
 
 
330 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4635  gluconate 2-dehydrogenase  43.13 
 
 
330 aa  241  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5135  gluconate 2-dehydrogenase  43.13 
 
 
330 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1468  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  47.3 
 
 
323 aa  241  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0619  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding protein  46.18 
 
 
327 aa  241  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3876  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  46.86 
 
 
323 aa  241  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5047  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  43.13 
 
 
330 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21840  glycerate dehydrogenase  45.28 
 
 
274 aa  240  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0628061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5014  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  42.81 
 
 
330 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5035  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  42.49 
 
 
330 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.341371  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0199  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  42.81 
 
 
330 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0038  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  42.26 
 
 
320 aa  238  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2298  2-ketogluconate reductase  44.69 
 
 
325 aa  237  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35320  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  43.79 
 
 
328 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317653  normal  0.274973 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0731  Glyoxylate reductase  41.88 
 
 
322 aa  236  3e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12970  lactate dehydrogenase-like oxidoreductase  45.48 
 
 
321 aa  236  3e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0758  Gluconate 2-dehydrogenase  48.06 
 
 
324 aa  236  4e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.163484  normal  0.223338 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2977  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  43.79 
 
 
328 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269444  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2286  2-ketogluconate reductase  44.05 
 
 
325 aa  235  8e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2151  gluconate 2-dehydrogenase  44.05 
 
 
325 aa  235  8e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00341832  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4725  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  41.85 
 
 
320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1983  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  48.81 
 
 
321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2094  gluconate 2-dehydrogenase  44.05 
 
 
325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2002  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding protein  49.15 
 
 
321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2048  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  49.15 
 
 
321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1528  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  48.06 
 
 
321 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.27928  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3514  gluconate 2-dehydrogenase  41.85 
 
 
320 aa  231  9e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3643  glyoxylate reductase  41.46 
 
 
330 aa  231  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000307425 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2855  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  46.55 
 
 
345 aa  230  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0057  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  40 
 
 
325 aa  229  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0055  Gluconate 2-dehydrogenase  41.94 
 
 
321 aa  229  4e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4738  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  39.25 
 
 
335 aa  229  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.373917 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3874  2-ketogluconate reductase  39.87 
 
 
324 aa  229  5e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0592  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  41.21 
 
 
326 aa  229  6e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.80162  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5027  gluconate 2-dehydrogenase  47.29 
 
 
321 aa  229  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.19225 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03403  2-ketoaldonate reductase/glyoxylate reductase B  39.87 
 
 
324 aa  228  9e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3973  2-ketogluconate reductase  39.87 
 
 
324 aa  228  9e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4049  2-ketogluconate reductase  39.87 
 
 
324 aa  228  9e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4929  2-ketogluconate reductase  39.87 
 
 
324 aa  228  9e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.763267 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03354  hypothetical protein  39.87 
 
 
324 aa  228  9e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1511  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  42.31 
 
 
330 aa  228  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.480657  normal  0.0780281 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1652  gluconate 2-dehydrogenase  47.29 
 
 
321 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.999002  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3754  2-ketogluconate reductase  39.87 
 
 
324 aa  227  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0163  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  39.87 
 
 
324 aa  227  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3305  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  43.51 
 
 
326 aa  227  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106249  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0159  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding protein  39.55 
 
 
324 aa  227  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1251  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  40.65 
 
 
322 aa  226  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0731661  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1652  gluconate 2-dehydrogenase  46.9 
 
 
321 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242679  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1370  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  39.69 
 
 
326 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>