64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_R0039 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_R0039  tRNA-His  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0312373 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0038  tRNA-His  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.322941  normal  0.556926 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0021  tRNA-His  88.89 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.730448  normal  0.901985 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0017  tRNA-His  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000497759  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0018  tRNA-His  87.67 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.898186  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tHis01  tRNA-His  90.2 
 
 		 80 bp  61.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0015  tRNA-His  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.956741  normal  0.235739 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-His-1  tRNA-His  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.34848  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0050  tRNA-His  96.97 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2041  tRNA-His  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000147998  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1762  tRNA-His  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0024  tRNA-His  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000441767  unclonable  9.7747e-19 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0038  tRNA-His  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.650606  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0047  tRNA-His  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0023  tRNA-His  88.46 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.794961  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0042  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0027  tRNA-His  84.51 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000752575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0033  tRNA-His  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-His-1  tRNA-His  96.67 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00107575  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0027  tRNA-His  96.67 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0027  tRNA-His  85.14 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000556999  normal  0.160274 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_831  tRNA-His  96.67 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000011255  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0051  tRNA-His  85.25 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000083549  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08830  tRNA-His  84.93 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0406412  normal  0.0611739 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1684  tRNA-His  83.12 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.592978  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2211  tRNA-His  83.12 
 
 		 79 bp  50.1  0.00008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.240288  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0011  tRNA-His  85.25 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2136  tRNA-His  83.12 
 
 		 79 bp  50.1  0.00008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00922633  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_BR0008  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000747513  normal  0.235119 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_BR0002  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000269854  normal  0.234293 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_BR0013  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  6.55572e-16  normal  0.0212264 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0083  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0073  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000478269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0026  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000242034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0039  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000281938  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0023  tRNA-Met  84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.013256 
 
 
-
 
NC_006368  lppt23  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0019  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.322851  normal  0.248393 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0015  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0186  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt23  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0032  tRNA-Pro  91.43 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0580782  normal  0.580774 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0070  tRNA-His  91.43 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0203804  normal  0.914236 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0087  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000283468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0025  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000151787  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0015  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000558308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0054  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0788  tRNA-His  93.55 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.611877  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0057  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0335757  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0040  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000050813  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0683  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.684611  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0036  tRNA-His  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0000713799  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0048  tRNA-Leu  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.223448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0038  tRNA-Trp  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.23193 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAMetVIMSS1309206  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.218177  hitchhiker  0.000283446 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0060  tRNA-His  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0026  tRNA-Met  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.000000000000595128  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0006  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.412994  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0044  tRNA-His  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0009  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.630653 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1469  tRNA-His  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0077  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R23  tRNA-Ile  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna1  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>