10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_R0017 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_R0017  tRNA-His  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000497759  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0039  tRNA-His  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0312373 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0038  tRNA-His  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.322941  normal  0.556926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0060  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0047  tRNA-His  92.86 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.297374  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0047  tRNA-His  92.86 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.761804 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0049  tRNA-His  92.86 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0049  tRNA-His  92.86 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0002  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08830  tRNA-His  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0406412  normal  0.0611739 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>